More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2162 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2162  major facilitator transporter  100 
 
 		 370 aa  712    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1780  major facilitator transporter  56.99 
 
 		 379 aa  411  1e-113  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2076  major facilitator superfamily MFS_1  48.77 
 
 		 378 aa  308  8e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284167  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2763  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 		 374 aa  67  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.640372  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  25.22 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3156  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 438 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  22.66 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  24.44 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  27.43 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 438 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  27.91 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  27.91 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  27.91 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2715  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.9 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.618209 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  28.4 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  28.4 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  26.25 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  28.4 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  28.4 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  27.78 
 
 		 458 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  22 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  27.91 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4313  major facilitator transporter  26.64 
 
 		 431 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  27.78 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  27.78 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  22.32 
 
 		 435 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3902  major facilitator superfamily MFS_1  22.51 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.088151  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1500  major facilitator superfamily protein  28.03 
 
 		 513 aa  57.4  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.096158  normal  0.892962 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5549  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 450 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0993  2-ketogluconate/H(+) major facilitator transporter  28.8 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051326  normal  0.375991 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  21.74 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 432 aa  57  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  25.88 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3731  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 		 444 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 479 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3797  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 		 444 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3900  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 		 444 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  normal  0.649925 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3887  major facilitator transporter  25.16 
 
 		 432 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.218515 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 464 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  23.13 
 
 		 431 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  22.75 
 
 		 422 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 461 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 463 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 469 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0859  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 366 aa  55.8  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3839  major facilitator superfamily transporter  25 
 
 		 443 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993033  normal  0.150303 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  22.46 
 
 		 427 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 428 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 440 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 440 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 430 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  26.88 
 
 		 478 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 421 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2328  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0114986  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1722  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 433 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0389181  normal  0.259403 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 463 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 430 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 463 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 		 449 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0541  major facilitator transporter  24.03 
 
 		 444 aa  53.9  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24945  hitchhiker  0.0000121127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 		 534 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  29.01 
 
 		 443 aa  53.5  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2482  major facilitator transporter  24.31 
 
 		 432 aa  53.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  22.58 
 
 		 432 aa  53.5  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  20.27 
 
 		 434 aa  53.5  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 390 aa  53.5  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  24.1 
 
 		 454 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 434 aa  53.5  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  24.1 
 
 		 454 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  24.1 
 
 		 454 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2040  major facilitator family transporter  24.23 
 
 		 431 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 445 aa  53.1  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.62 
 
 		 504 aa  53.1  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 437 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  23.86 
 
 		 451 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 443 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 444 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2069  major facilitator superfamily protein  23.12 
 
 		 424 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118592  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0628  major facilitator family transporter  23.54 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  26.38 
 
 		 468 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  23.31 
 
 		 448 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0574  major facilitator family transporter  23.54 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.84757 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2392  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 416 aa  52.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0045  d-galactonate transporter  23.32 
 
 		 430 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0569  major facilitator family transporter  23.54 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.676652  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  25.13 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  32.59 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0567  major facilitator family transporter  23.54 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3702  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 431 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0165127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  23.59 
 
 		 455 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  24.36 
 
 		 475 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>