29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2153 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2153  DNA primase  100 
 
 		 413 aa  815    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000561406  hitchhiker  0.000473756 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1059  TOPRIM domain protein  70.34 
 
 		 402 aa  585  1e-166  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0877165  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0169  DNA primase  46.88 
 
 		 452 aa  394  1e-108  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0207779  normal  0.165101 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0501  DNA primase  47.83 
 
 		 426 aa  361  1e-98  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1050  DNA primase  45.91 
 
 		 407 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00972841 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0960  DNA primase  46.15 
 
 		 405 aa  355  5.999999999999999e-97  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.916463 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1886  DNA primase  47.77 
 
 		 405 aa  347  2e-94  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1321  DNA primase  45.68 
 
 		 403 aa  346  3e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0722  DNA primase  42.92 
 
 		 438 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000789623  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1395  TOPRIM domain protein  43.03 
 
 		 407 aa  306  3e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.145165  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1769  DNA primase  36.5 
 
 		 475 aa  271  1e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1017  DNA primase  37.01 
 
 		 408 aa  272  1e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0846  DNA primase  37.68 
 
 		 415 aa  271  1e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0959  DNA primase  47.95 
 
 		 517 aa  266  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0699  DNA primase  36.54 
 
 		 417 aa  264  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000129929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0596  DNA primase  37.33 
 
 		 443 aa  258  2e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.792701  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0741  DNA primase  50.92 
 
 		 464 aa  258  2e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.119048  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0307  DNA primase  46.41 
 
 		 438 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1388  DNA primase  38.37 
 
 		 438 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0361  DNA primase  35.47 
 
 		 434 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0531  DNA primase  48.88 
 
 		 439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.956269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1229  TOPRIM domain protein  43 
 
 		 491 aa  236  5.0000000000000005e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189055  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1103  DNA primase  35.08 
 
 		 440 aa  235  9e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3256  TOPRIM domain protein  42.12 
 
 		 477 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1302  DNA primase  36.36 
 
 		 380 aa  232  1e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000182826 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1544  DNA primase  43.02 
 
 		 461 aa  224  3e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.513524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2135  DNA primase  41.73 
 
 		 505 aa  219  7e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.218194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0194  DNA primase  41.89 
 
 		 537 aa  212  7.999999999999999e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.112469  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0961  DNA primase  25 
 
 		 579 aa  43.9  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>