More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2146 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2146  30S ribosomal protein S11P  100 
 
 		 132 aa  261  2e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.00000000001001  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1053  ribosomal protein S11P  85.12 
 
 		 132 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0618466  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0540  30S ribosomal protein S11P  70.87 
 
 		 139 aa  170  5e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0132624 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1813  30S ribosomal protein S11P  70.08 
 
 		 141 aa  170  6.999999999999999e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1623  30S ribosomal protein S11P  68.75 
 
 		 135 aa  167  3e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1654  30S ribosomal protein S11P  67.72 
 
 		 138 aa  164  4e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1620  30S ribosomal protein S11P  62.2 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.677477  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2386  30S ribosomal protein S11P  61.48 
 
 		 131 aa  157  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0421655  normal  0.64544 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1398  ribosomal protein S11P  63.2 
 
 		 128 aa  156  9e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.708751  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2900  30S ribosomal protein S11P  62.3 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.126404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1802  30S ribosomal protein S11P  62.07 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2223  30S ribosomal protein S11P  58.2 
 
 		 132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0076  30S ribosomal protein S11P  60.98 
 
 		 126 aa  152  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0038  30S ribosomal protein S11P  63.33 
 
 		 126 aa  152  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1645  30S ribosomal protein S11P  66.94 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0100802 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2522  30S ribosomal protein S11P  56.56 
 
 		 128 aa  150  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0132893  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1245  30S ribosomal protein S11P  60.87 
 
 		 131 aa  148  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000186566  normal  0.971043 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2591  30S ribosomal protein S11P  57.26 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.50824  normal  0.265478 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0257  30S ribosomal protein S11P  66.96 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2552  ribosomal protein S11P  55.12 
 
 		 129 aa  147  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0422  ribosomal protein S11P  55.12 
 
 		 129 aa  146  7e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0632  30S ribosomal protein S11P  62.5 
 
 		 124 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1818  30S ribosomal protein S11P  54.69 
 
 		 129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0272  30S ribosomal protein S11P  62.5 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0566  30S ribosomal protein S11P  62.5 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.549434 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1352  30S ribosomal protein S11P  62.5 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1099  30S ribosomal protein S11P  63.39 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87510  40S ribosomal protein S14-B (RP59B)  58.04 
 
 		 136 aa  141  4e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464079  normal  0.172566 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05960  40S ribosomal protein S14 (Broad)  58.26 
 
 		 149 aa  140  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29967  Ribosomal protein S14, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  55.65 
 
 		 139 aa  137  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.51773  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50886  predicted protein  55.36 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00670  structural constituent of ribosome, putative  56.52 
 
 		 150 aa  124  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.39165  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1450  30S ribosomal protein S11  61.46 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  43.65 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2301  30S ribosomal protein S11  41.6 
 
 		 129 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.598814  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00961  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 		 130 aa  90.5  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000322377  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0477  30S ribosomal protein S11  42.4 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237439 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04498  30S ribosomal protein S11  43.55 
 
 		 130 aa  90.1  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.846656  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0778  30S ribosomal protein S11  42.74 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0579728 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4726  30S ribosomal protein S11  42.4 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49415  normal  0.352381 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0516  30S ribosomal protein S11  42.4 
 
 		 130 aa  89.4  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.704694  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0506  30S ribosomal protein S11  42.4 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0510  30S ribosomal protein S11  42.4 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  0.0188454 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06480  30S ribosomal protein S11  42.4 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0649  ribosomal protein S11  42.4 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4526  30S ribosomal protein S11  42.4 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.828676  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5057  30S ribosomal protein S11  42.4 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000518123  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0455  30S ribosomal protein S11  42.4 
 
 		 130 aa  89.4  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.348659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0860  30S ribosomal protein S11  42.4 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  40.8 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09090  30S ribosomal protein S11  42.4 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  42.4 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  40 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0624  30S ribosomal protein S11  42.4 
 
 		 129 aa  88.2  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000665656  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0207  30S ribosomal protein S11  42.4 
 
 		 130 aa  87.4  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000194302  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  38.4 
 
 		 131 aa  87.4  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  40.8 
 
 		 133 aa  86.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  40.8 
 
 		 133 aa  86.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4667  30S ribosomal protein S11  42.4 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000031185  unclonable  0.00000000812252 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  40.8 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  41.6 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2302  30S ribosomal protein S11  41.6 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.12621  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4296  30S ribosomal protein S11  42.4 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000132773  unclonable  0.0000000000385388 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0982  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000271815  hitchhiker  0.00410898 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0193  30S ribosomal protein S11  42.4 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310597  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  40.8 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0481  30S ribosomal protein S11  41.27 
 
 		 130 aa  85.9  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0512  30S ribosomal protein S11  40.48 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11652  hitchhiker  0.00952872 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0181  30S ribosomal protein S11  42.4 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000807145  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0507  30S ribosomal protein S11  40.48 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00376989  normal  0.069652 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  41.6 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  40 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0236  30S ribosomal protein S11  41.6 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000127993  unclonable  0.00000919144 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0171  30S ribosomal protein S11  41.6 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000137898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0082  30S ribosomal protein S11  40.8 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000625128  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  37.6 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1318  30S ribosomal protein S11  44.17 
 
 		 130 aa  84  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000513052  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  37.6 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1368  30S ribosomal protein S11  44.17 
 
 		 130 aa  84  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  37.6 
 
 		 129 aa  83.6  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0074  30S ribosomal protein S11  39.2 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.475977  hitchhiker  0.00000000906112 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  36.8 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  41.6 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0345  30S ribosomal protein S11  40.8 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000250973  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  39.2 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2146  30S ribosomal protein S11  42.4 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0472409  normal  0.694866 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  40 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3925  30S ribosomal protein S11  40.8 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  40 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  40 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  40 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  39.2 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3613  30S ribosomal protein S11  39.2 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00134375  normal  0.497735 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  40 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  40 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  40 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  40 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  39.2 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  40 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>