More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2140 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2140  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 225 aa  456  9.999999999999999e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000050996  hitchhiker  0.0000667505 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1047  ribosomal protein S2  76.55 
 
 		 226 aa  365  1e-100  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.269348  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1104  30S ribosomal protein S2  58.5 
 
 		 207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0027  30S ribosomal protein S2  58 
 
 		 208 aa  250  1e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0058  30S ribosomal protein S2  58 
 
 		 206 aa  246  3e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0190126 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0061  30S ribosomal protein S2  55 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.924609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0274  30S ribosomal protein S2  50 
 
 		 214 aa  230  2e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0478  30S ribosomal protein S2  58.43 
 
 		 206 aa  224  8e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2002  30S ribosomal protein S2  47.42 
 
 		 215 aa  223  1e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0430  ribosomal protein S2  53.89 
 
 		 263 aa  219  3e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.748529  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0219  30S ribosomal protein S2  52.6 
 
 		 221 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.664063  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1524  30S ribosomal protein S2  52.6 
 
 		 221 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.524219  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1693  30S ribosomal protein S2  52.6 
 
 		 221 aa  218  5e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2544  ribosomal protein S2  56.82 
 
 		 269 aa  218  7e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1302  ribosomal protein S2  50.75 
 
 		 199 aa  218  8.999999999999998e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.29354  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0759  30S ribosomal protein S2  52.08 
 
 		 220 aa  217  1e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.817066  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0907  30S ribosomal protein S2  51.56 
 
 		 220 aa  216  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1826  30S ribosomal protein S2  51.79 
 
 		 268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2514  30S ribosomal protein S2  53.41 
 
 		 267 aa  212  2.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2393  30S ribosomal protein S2  48 
 
 		 214 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000018478  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2599  30S ribosomal protein S2  51.02 
 
 		 259 aa  211  7.999999999999999e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1810  30S ribosomal protein S2  53.07 
 
 		 205 aa  206  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2215  30S ribosomal protein S2  52.27 
 
 		 203 aa  206  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2378  30S ribosomal protein S2  47.96 
 
 		 202 aa  204  7e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00361654  normal  0.260163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1423  30S ribosomal protein S2  51.74 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.017125 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1237  30S ribosomal protein S2  45 
 
 		 202 aa  202  3e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.161578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0316  30S ribosomal protein S2  42.62 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2892  30S ribosomal protein S2  50.57 
 
 		 202 aa  181  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00129354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13682  predicted protein  44.1 
 
 		 220 aa  177  9e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03172  40S ribosomal protein S0 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8F8]  42.61 
 
 		 293 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.51633 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04340  40S ribosomal protein S0, putative  42.11 
 
 		 292 aa  161  7e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.220661  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12355  Ribosomal protein Sa, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  39.13 
 
 		 290 aa  149  4e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.30496  normal  0.113443 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76999  ribosomal protein S0A  39.66 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.937942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  28.26 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  26.97 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  28.26 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  27.63 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1966  ribosomal protein S2  27.8 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  26.13 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  25.31 
 
 		 246 aa  72  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1780  30S ribosomal protein S2  26.45 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000158872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  26.58 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  26.13 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  26.13 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  25.66 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0648  ribosomal protein S2  28.19 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  25.22 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  26.45 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1153  30S ribosomal protein S2  26.61 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  26.11 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  26.11 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  26.32 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  27.27 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  25.68 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1049  30S ribosomal protein S2  24.71 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0905437  normal  0.331293 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  26.48 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  27.65 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0532  30S ribosomal protein S2  29.95 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00675401  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  24.14 
 
 		 257 aa  67  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  24.77 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  26.32 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  25.22 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  24.45 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  25.22 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  25.22 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  25.22 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  26.7 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  25.4 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  25.22 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  25.22 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1004  ribosomal protein S2  29.44 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.663705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  25.22 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  25 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  25.79 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  25.79 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  24.78 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3517  ribosomal protein S2  27.52 
 
 		 420 aa  65.9  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  25.79 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3194  ribosomal protein S2  25.1 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.758099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  26.24 
 
 		 251 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  24.89 
 
 		 258 aa  65.1  0.0000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  24.32 
 
 		 288 aa  65.1  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  24.34 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  25.23 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1810  30S ribosomal protein S2  27.56 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.544221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  26.01 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  24.78 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  26.11 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  24.78 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  24.89 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1832  30S ribosomal protein S2  26.07 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000152831  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  25.68 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1262  30S ribosomal protein S2  24.26 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000765471  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1094  30S ribosomal protein S2  25.34 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.240704  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3528  30S ribosomal protein S2  24.89 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.421739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2019  30S ribosomal protein S2  27.36 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418742 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  25 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1398  SSU ribosomal protein S2P  25 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000184086  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2578  30S ribosomal protein S2  24.89 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  24.78 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>