More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2115 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  100 
 
 		 300 aa  590  1e-168  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  69.57 
 
 		 300 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  40.96 
 
 		 295 aa  239  4e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0942  signal transduction protein  36.9 
 
 		 307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1886  hypothetical protein  33.33 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0754  signal transduction protein  34.78 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284841  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2102  signal transduction protein  34.13 
 
 		 292 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1922  signal transduction protein  35.49 
 
 		 293 aa  172  5e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2165  hypothetical protein  33.9 
 
 		 291 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.758559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0640  hypothetical protein  34.47 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1735  signal transduction protein  36.54 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.281156  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  37.12 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  36.91 
 
 		 286 aa  159  6e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1742  signal transduction protein  35.57 
 
 		 286 aa  159  6e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12379 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0054  putative signal transduction protein with CBS domains  33.22 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1625  signal transduction protein  32.88 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1049  signal transduction protein  32.54 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1067  signal transduction protein  32.77 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2936  signal transduction protein  32.07 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000290592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0897  signal transduction protein  32.88 
 
 		 303 aa  152  7e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1153  signal transduction protein  33.33 
 
 		 288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0936  Protein of unknown function DUF293  38.1 
 
 		 177 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0850424  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4532  transcriptional regulator, TrmB  32.4 
 
 		 177 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3672  Protein of unknown function DUF293  35.12 
 
 		 173 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.829255  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2269  Protein of unknown function DUF293  35.06 
 
 		 177 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0304  Protein of unknown function DUF293  34.83 
 
 		 177 aa  102  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.480647  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2734  Protein of unknown function DUF293  32.74 
 
 		 177 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.645133 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2771  transcriptional regulator, TrmB  31.52 
 
 		 177 aa  95.9  7e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1169  Protein of unknown function DUF293  31.52 
 
 		 176 aa  90.9  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.896672  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2105  Protein of unknown function DUF293  31.71 
 
 		 178 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0300972  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  35.9 
 
 		 909 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  32.62 
 
 		 909 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  30.47 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  37.5 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  37.82 
 
 		 132 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  28.1 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  29.49 
 
 		 904 aa  73.2  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  35.04 
 
 		 903 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.19 
 
 		 903 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  33.57 
 
 		 865 aa  72  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.19 
 
 		 903 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  35.43 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  34.43 
 
 		 769 aa  71.2  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  32.03 
 
 		 890 aa  70.5  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  31.06 
 
 		 873 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  37.17 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  28.1 
 
 		 366 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  33.09 
 
 		 880 aa  68.9  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  32.81 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.35 
 
 		 877 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  29.17 
 
 		 149 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  28.97 
 
 		 907 aa  67  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  32.82 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  30.56 
 
 		 907 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  29.45 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  34.43 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  28.08 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  35 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  31.4 
 
 		 502 aa  65.9  0.0000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  30.58 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  33.62 
 
 		 845 aa  65.1  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  30.32 
 
 		 154 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  29.8 
 
 		 152 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2287  CBS domain containing membrane protein  30.25 
 
 		 135 aa  65.1  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146345  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  24.66 
 
 		 161 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1209  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 		 499 aa  65.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000206103  hitchhiker  0.00000852941 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  32.5 
 
 		 503 aa  65.1  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  33.61 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  32.77 
 
 		 131 aa  64.7  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  26.42 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0653  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.26 
 
 		 500 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  33.04 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2784  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.82 
 
 		 495 aa  64.3  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.757104  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  30.66 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1947  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.94 
 
 		 500 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  35.43 
 
 		 513 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0911  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.5 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  35.43 
 
 		 513 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  32.23 
 
 		 502 aa  64.3  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  34.55 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  29.45 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0735  putative signal transduction protein with CBS domains  32.23 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14806  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.75 
 
 		 873 aa  63.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  29.46 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2063  protein of unknown function UPF0074  26.06 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  31.15 
 
 		 867 aa  62.8  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  32.03 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1446  signal transduction protein  30.08 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.697131  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  29.2 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  27.27 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3311  CBS domain-containing protein  32.26 
 
 		 141 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.881932 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.45 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  28.21 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.11 
 
 		 580 aa  61.6  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  31.45 
 
 		 877 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.45 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1231  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 		 137 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.022182  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  32.76 
 
 		 511 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  29.46 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>