More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2104 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  100 
 
 
476 aa  954  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  51.74 
 
 
473 aa  486  1e-136  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  39.21 
 
 
515 aa  292  9e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  31.76 
 
 
671 aa  225  2e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  34.84 
 
 
510 aa  224  3e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  32.65 
 
 
519 aa  214  2e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  33.17 
 
 
682 aa  200  4e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  29.52 
 
 
492 aa  200  4e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  30.9 
 
 
542 aa  199  6e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  29.03 
 
 
492 aa  198  2e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  36.39 
 
 
572 aa  197  3e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  29.97 
 
 
556 aa  197  5e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  32.04 
 
 
577 aa  189  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  28.81 
 
 
545 aa  188  1e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  32.39 
 
 
609 aa  188  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  31.93 
 
 
749 aa  187  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  30.73 
 
 
654 aa  187  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  29.73 
 
 
722 aa  184  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  29.9 
 
 
549 aa  183  5e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  30.51 
 
 
489 aa  182  1e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  31.92 
 
 
797 aa  182  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  37.96 
 
 
591 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  32.1 
 
 
491 aa  181  3e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
692 aa  181  3e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  33.03 
 
 
547 aa  179  9e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  34.02 
 
 
549 aa  177  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  34.55 
 
 
583 aa  176  1e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  37.5 
 
 
558 aa  176  1e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  27.27 
 
 
551 aa  175  2e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  30 
 
 
791 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  31.04 
 
 
628 aa  171  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  28.84 
 
 
991 aa  171  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  31.87 
 
 
770 aa  170  6e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  29.33 
 
 
546 aa  170  6e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  28.29 
 
 
546 aa  170  7e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  28.01 
 
 
557 aa  167  3e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  27.62 
 
 
546 aa  167  3e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  30.48 
 
 
610 aa  167  3e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  28.61 
 
 
547 aa  167  5e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  32.89 
 
 
311 aa  166  7e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1197  type II secretion system protein E  30.69 
 
 
483 aa  165  1e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.585907  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  31.5 
 
 
604 aa  165  2e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  29.11 
 
 
543 aa  164  2e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  30.89 
 
 
512 aa  165  2e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  29.12 
 
 
640 aa  164  4e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  29.79 
 
 
546 aa  163  6e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  31.14 
 
 
1255 aa  162  9e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  30.73 
 
 
847 aa  162  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  30.05 
 
 
831 aa  162  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  34.83 
 
 
612 aa  162  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  29.16 
 
 
559 aa  160  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  28.8 
 
 
557 aa  160  6e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  29.32 
 
 
557 aa  160  7e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  33.99 
 
 
513 aa  159  7e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  31.48 
 
 
1335 aa  156  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  30.63 
 
 
1319 aa  156  7e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  28.29 
 
 
549 aa  156  7e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  28.98 
 
 
557 aa  155  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  29.62 
 
 
620 aa  154  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  29.44 
 
 
622 aa  152  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  28.34 
 
 
617 aa  151  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  28.65 
 
 
618 aa  150  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  30.95 
 
 
548 aa  149  1e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  30.69 
 
 
552 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  30.1 
 
 
552 aa  147  5e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  30.1 
 
 
553 aa  142  9e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  30.1 
 
 
553 aa  142  9e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  30.1 
 
 
553 aa  142  9e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  30.1 
 
 
553 aa  142  9e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  32.78 
 
 
544 aa  142  1e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  39.02 
 
 
412 aa  142  2e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  34 
 
 
444 aa  137  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  33.64 
 
 
454 aa  135  2e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  33.64 
 
 
453 aa  134  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  31.27 
 
 
452 aa  134  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  29.37 
 
 
460 aa  132  1e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  28.15 
 
 
450 aa  131  2e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7220  type II secretion system protein E  35.75 
 
 
632 aa  131  2e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177916  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5621  type II secretion system protein E  35.75 
 
 
632 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  28.15 
 
 
452 aa  130  5e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  34.96 
 
 
423 aa  130  5e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  30.03 
 
 
462 aa  130  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  34.84 
 
 
500 aa  129  9e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  29.83 
 
 
477 aa  129  1e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  31.37 
 
 
463 aa  129  1e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  32.93 
 
 
449 aa  129  1e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  32 
 
 
455 aa  129  1e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  32.36 
 
 
455 aa  129  1e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  34.1 
 
 
456 aa  129  1e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  31.37 
 
 
455 aa  129  2e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  31.37 
 
 
455 aa  128  2e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  34.1 
 
 
459 aa  128  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  31.27 
 
 
472 aa  127  4e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  32.59 
 
 
464 aa  127  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  27.1 
 
 
463 aa  127  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  27.1 
 
 
465 aa  127  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  8.47512e-06 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  31.09 
 
 
467 aa  127  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  33.98 
 
 
411 aa  126  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  31.27 
 
 
473 aa  126  7e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  31.6 
 
 
454 aa  126  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>