More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2077 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0097  cysteinyl-tRNA synthetase  66.74 
 
 
470 aa  692    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2077  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
465 aa  964    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.786603 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0902  cysteinyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 
474 aa  508  1e-143  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 
478 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
466 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 
478 aa  404  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
485 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 
478 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 
466 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 
481 aa  393  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
468 aa  392  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
476 aa  393  1e-108  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 
476 aa  389  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
480 aa  388  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 
476 aa  389  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 
487 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
475 aa  386  1e-106  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 
480 aa  388  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
455 aa  386  1e-106  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 
458 aa  382  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
465 aa  382  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 
466 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
465 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
465 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
465 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
465 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 
457 aa  384  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 
470 aa  382  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
465 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 
457 aa  384  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
465 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
465 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
500 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
460 aa  380  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
460 aa  380  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 
486 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 
494 aa  381  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  42 
 
 
484 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0064  cysteinyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
469 aa  379  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00940017  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
466 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 
466 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 
472 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 
493 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 
463 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 
474 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
465 aa  375  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  42 
 
 
453 aa  377  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
465 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
465 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 
477 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
485 aa  373  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1376  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 
479 aa  371  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.0031117  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
469 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 
479 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
487 aa  369  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
461 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
472 aa  369  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
461 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
461 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 
459 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 
481 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 
465 aa  368  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 
476 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 
468 aa  367  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 
474 aa  365  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
465 aa  365  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 
493 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
461 aa  364  2e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
461 aa  364  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 
458 aa  363  3e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 
460 aa  363  3e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 
459 aa  363  4e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 
485 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
485 aa  362  6e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 
461 aa  362  9e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 
472 aa  362  9e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 
459 aa  361  1e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 
461 aa  361  1e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 
465 aa  361  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 
485 aa  360  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
461 aa  361  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35130  cysteinyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 
459 aa  359  4e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.782995 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 
466 aa  359  5e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1181  cysteinyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
493 aa  359  7e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00250228  hitchhiker  0.0000333718 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
461 aa  359  7e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 
460 aa  358  8e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 
456 aa  358  8e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
470 aa  358  9.999999999999999e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 
461 aa  358  9.999999999999999e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0679  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 
470 aa  358  9.999999999999999e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2233  cysteinyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 
501 aa  358  1.9999999999999998e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.056881  normal  0.890291 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 
459 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 
459 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 
466 aa  358  1.9999999999999998e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 
459 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
459 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
460 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 
460 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 
505 aa  356  3.9999999999999996e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>