More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2006 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_2006  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 
455 aa  921    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1719  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  49.89 
 
 
443 aa  443  1e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0722  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.72 
 
 
456 aa  239  8e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00721708  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  34 
 
 
445 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.71 
 
 
437 aa  210  5e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.42 
 
 
458 aa  209  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.07 
 
 
443 aa  207  4e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0043  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.25 
 
 
463 aa  204  2e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.68 
 
 
474 aa  201  3e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.19 
 
 
458 aa  199  9e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.69 
 
 
458 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.33 
 
 
458 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.42 
 
 
464 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1106  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.14 
 
 
485 aa  179  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00736821  normal  0.260401 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1875  hypothetical protein  31.92 
 
 
466 aa  176  8e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0977  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.22 
 
 
444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00101033  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0277  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.74 
 
 
442 aa  172  9e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00851915  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  29.04 
 
 
467 aa  171  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1846  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.14 
 
 
459 aa  170  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0233195 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.13 
 
 
470 aa  168  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.73 
 
 
460 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.4 
 
 
459 aa  168  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1293  TldD/PmbA family protein  28.09 
 
 
460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00519979  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1643  TldD protein  28.57 
 
 
477 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416782  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  31.49 
 
 
475 aa  167  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0510  microcin-processing peptidase 2 (TldD)  28.42 
 
 
477 aa  166  8e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00345987  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.38 
 
 
483 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2390  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.61 
 
 
446 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.738622 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  28.11 
 
 
460 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.39 
 
 
462 aa  162  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.57 
 
 
462 aa  160  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2693  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.08 
 
 
442 aa  161  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  28.51 
 
 
460 aa  159  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.09 
 
 
476 aa  159  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.87 
 
 
462 aa  158  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.42 
 
 
461 aa  158  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3619  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.52 
 
 
463 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2489  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.52 
 
 
463 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0397  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.15 
 
 
460 aa  157  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0503933 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3846  microcin-processing peptidase 2  31.54 
 
 
486 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.91 
 
 
458 aa  155  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3958  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.19 
 
 
489 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09191  putative modulator of DNA gyrase; TldD  28.98 
 
 
474 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.507824  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3909  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.27 
 
 
486 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.18 
 
 
454 aa  152  8e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3987  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.27 
 
 
486 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10461  putative modulator of DNA gyrase; TldD  29.59 
 
 
469 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157688  hitchhiker  0.0011828 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0403  TldD/PmbA family protein  27.72 
 
 
472 aa  152  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  29.62 
 
 
481 aa  152  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0778  hypothetical protein  29.81 
 
 
445 aa  151  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.111344  unclonable  0.000000000000258626 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.95 
 
 
470 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.25 
 
 
491 aa  150  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.1 
 
 
460 aa  150  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0957  putative modulator of DNA gyrase; TldD  27.83 
 
 
474 aa  150  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.405602  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.56 
 
 
460 aa  150  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.3 
 
 
464 aa  149  8e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0739  microcin-processing peptidase 2  29.25 
 
 
471 aa  149  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3911  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.35 
 
 
467 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.484753 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14421  putative modulator of DNA gyrase; TldD  26.98 
 
 
481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.33 
 
 
464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.09 
 
 
469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0364  putative modulator of DNA gyrase; TldD  38.2 
 
 
469 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2763  microcin-processing peptidase 2  32.57 
 
 
490 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2754  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.92 
 
 
489 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.9 
 
 
475 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4478  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.2 
 
 
465 aa  146  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3429  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.87 
 
 
489 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10261  putative modulator of DNA gyrase; TldD  35.61 
 
 
474 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0152  tldD protein  39.08 
 
 
467 aa  145  1e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09221  putative modulator of DNA gyrase; TldD  28.02 
 
 
481 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000227286 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2687  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.87 
 
 
489 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0100  microcin-processing peptidase 2  37.82 
 
 
477 aa  144  2e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.884188  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0567  microcin-processing peptidase 2  28.92 
 
 
480 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2841  tldD protein  27.51 
 
 
481 aa  145  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  35.16 
 
 
480 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0221  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.32 
 
 
475 aa  144  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2043  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.55 
 
 
486 aa  144  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3456  DNA gyrase modulator peptidase U62  27.87 
 
 
464 aa  144  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.258485  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0998  tldD protein  36.4 
 
 
472 aa  144  4e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.555962  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0565  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.97 
 
 
490 aa  144  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.153604 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  32.08 
 
 
483 aa  143  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1127  microcin-processing peptidase 2  28.39 
 
 
489 aa  143  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10251  putative modulator of DNA gyrase; TldD  37.34 
 
 
474 aa  143  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334911  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0465  tldD protein, putative  27.92 
 
 
470 aa  143  8e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.902755  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2337  microcin-processing peptidase 2  27.95 
 
 
473 aa  143  8e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.652541  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0490  protein TldD  27.94 
 
 
481 aa  142  8e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  32.65 
 
 
481 aa  142  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.65 
 
 
481 aa  142  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  29.65 
 
 
458 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.53 
 
 
477 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0470  putative tldD protein  27.92 
 
 
470 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259571  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0893  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.06 
 
 
475 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  34.77 
 
 
480 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.96 
 
 
473 aa  141  3e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.41 
 
 
497 aa  141  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0825  putative peptidase TldD  29.09 
 
 
475 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1476  DNA gyrase modulator peptidase U62  31.8 
 
 
490 aa  140  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002390  TldD protein probably a protease  25.76 
 
 
481 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1015  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.82 
 
 
450 aa  140  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00168617  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3731  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.29 
 
 
482 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>