More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1965 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 191 aa  372  1e-102  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1679  orotate phosphoribosyltransferase  57.67 
 
 		 195 aa  229  2e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  41.94 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  41.71 
 
 		 192 aa  138  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  42.61 
 
 		 193 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  47.02 
 
 		 173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0289  orotate phosphoribosyltransferase  40.54 
 
 		 201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000476622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2296  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  39.13 
 
 		 479 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2347  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  39.13 
 
 		 479 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.159703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1589  orotate phosphoribosyltransferase  41.3 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  35.85 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1671  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  38.01 
 
 		 482 aa  104  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0957  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  36.11 
 
 		 477 aa  104  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 166 aa  104  7e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  35.37 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  36.13 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0376  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  36.02 
 
 		 500 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  36.31 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6143  orotate phosphoribosyltransferase  35.4 
 
 		 176 aa  99.8  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360288  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0127  orotate phosphoribosyltransferase  34.09 
 
 		 213 aa  98.6  5e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00677892  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0559  orotate phosphoribosyltransferase  36.2 
 
 		 178 aa  97.8  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0841  orotate phosphoribosyltransferase  36.14 
 
 		 167 aa  96.3  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.637586 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19418  Uridine 5'- monophosphate synthase  34.83 
 
 		 474 aa  96.3  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102475  normal  0.110461 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  36.48 
 
 		 186 aa  94.7  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  33.53 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0532  orotate phosphoribosyltransferase  33.97 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10387  orotate phosphoribosyltransferase  34.34 
 
 		 179 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.32666e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.76 
 
 		 451 aa  92  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  34.57 
 
 		 178 aa  92  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0690  orotate phosphoribosyltransferase  33.76 
 
 		 180 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0532  orotate phosphoribosyltransferase  33.97 
 
 		 180 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00117498  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2783  orotate phosphoribosyltransferase  38.85 
 
 		 174 aa  91.3  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1051  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 207 aa  91.3  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02932  orotate phosphoribosyltransferase  36.78 
 
 		 233 aa  91.3  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.434684  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2507  orotate phosphoribosyltransferase  35.22 
 
 		 227 aa  91.3  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  33.73 
 
 		 170 aa  91.3  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0263  orotate phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 		 211 aa  90.5  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  33.76 
 
 		 179 aa  90.1  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0750  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 180 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  35.85 
 
 		 185 aa  89.7  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0107  orotate phosphoribosyltransferase  36.72 
 
 		 232 aa  89  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3931  orotate phosphoribosyltransferase  32.95 
 
 		 210 aa  89  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2662  orotate phosphoribosyltransferase  41.88 
 
 		 207 aa  89  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  35.85 
 
 		 185 aa  89  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2531  orotate phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 		 210 aa  88.6  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0801  orotate phosphoribosyltransferase  33.97 
 
 		 185 aa  88.6  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1456  orotate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 183 aa  87.8  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351938  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3641  orotate phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 		 210 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3624  orotate phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 		 210 aa  87.8  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3927  orotate phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 		 210 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3733  orotate phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 		 210 aa  87.8  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191128  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  38.06 
 
 		 191 aa  87.8  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4021  orotate phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 		 210 aa  87.8  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  35.85 
 
 		 185 aa  87.8  9e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3896  orotate phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 		 210 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000349219 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1108  orotate phosphoribosyltransferase  33.73 
 
 		 172 aa  87.4  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.10081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1261  orotate phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3980  orotate phosphoribosyltransferase  36.11 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  36.55 
 
 		 176 aa  87.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1159  orotate phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.712635  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3709  orotate phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0928059  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0138  orotate phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 		 229 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0981  orotate phosphoribosyltransferase  33.12 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4858  orotate phosphoribosyltransferase  34.34 
 
 		 187 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0512  orotate phosphoribosyltransferase  34.94 
 
 		 194 aa  85.5  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  37.04 
 
 		 221 aa  85.5  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1784  orotate phosphoribosyltransferase  35.76 
 
 		 215 aa  85.5  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.474409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1921  orotate phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 		 207 aa  84.7  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1046  orotate phosphoribosyltransferase  29.94 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0756339  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0153  orotate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1785  orotate phosphoribosyltransferase  37.9 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1094  orotate phosphoribosyltransferase  30.41 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0402  orotate phosphoribosyltransferase  37.9 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0566  orotate phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0442  orotate phosphoribosyltransferase  37.34 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.297345  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0057  orotate phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1929  orotate phosphoribosyltransferase  43.52 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0430613  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2463  orotate phosphoribosyltransferase  30.81 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081584 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1741  orotate phosphoribosyltransferase  33.52 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0662938  normal  0.536983 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  34.34 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1205  orotate phosphoribosyltransferase  35.22 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.118025  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0580  orotate phosphoribosyltransferase  43.52 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2181  orotate phosphoribosyltransferase  37.74 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.134132  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  33.53 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0115  orotate phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0134  orotate phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0130  orotate phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2360  orotate phosphoribosyltransferase  35.93 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.166662 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1476  orotate phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19167  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0219  orotate phosphoribosyltransferase  33.12 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.744558  hitchhiker  0.000000000190609 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0546  orotate phosphoribosyltransferase  29.73 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0294  orotate phosphoribosyltransferase  32.18 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2669  orotate phosphoribosyltransferase  30.57 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0244  orotate phosphoribosyltransferase  33.54 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110652 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0236  orotate phosphoribosyltransferase  33.54 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  32.95 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1777  orotate phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 		 226 aa  81.3  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.693313  normal  0.186434 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2045  orotate phosphoribosyltransferase  29.65 
 
 		 232 aa  81.3  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  33.54 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2789  orotate phosphoribosyltransferase  31.68 
 
 		 228 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>