More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1943 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 285 aa  569  1e-161  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.919043 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  71.68 
 
 		 286 aa  425  1e-118  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  50.7 
 
 		 294 aa  288  6e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  49.65 
 
 		 282 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  48.59 
 
 		 282 aa  279  4e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  47.54 
 
 		 282 aa  265  8.999999999999999e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  47.7 
 
 		 283 aa  263  2e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  37.11 
 
 		 289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  39.58 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  38.19 
 
 		 282 aa  186  5e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  37.76 
 
 		 293 aa  185  6e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  35.66 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  36.84 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  38.19 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  35.66 
 
 		 288 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 		 306 aa  179  4e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  35.66 
 
 		 288 aa  179  4e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  36.71 
 
 		 288 aa  178  7e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  35.91 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  37.67 
 
 		 290 aa  175  8e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  35.76 
 
 		 284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  35.19 
 
 		 300 aa  169  4e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  36.49 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  35.56 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  36.62 
 
 		 283 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  32.99 
 
 		 299 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1745  ATP phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  32.99 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  32.99 
 
 		 290 aa  149  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2536  ATP phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1854  ATP phosphoribosyltransferase  32.99 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1657  ATP phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 		 298 aa  149  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22344  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2178  ATP phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 		 331 aa  149  5e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1800  ATP phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 		 332 aa  149  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  32.65 
 
 		 299 aa  149  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 		 299 aa  149  8e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2329  ATP phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2177  ATP phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2012  ATP phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2227  ATP phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 		 299 aa  146  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.446391  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 		 291 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 		 299 aa  146  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2074  ATP phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 		 324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2525  ATP phosphoribosyltransferase  30.85 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2428  ATP phosphoribosyltransferase  30.85 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3169  ATP phosphoribosyltransferase  30.85 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  32.57 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  32.87 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 		 299 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0097  ATP phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 		 299 aa  142  7e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000183123  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0578  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  32.8 
 
 		 338 aa  142  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  32.28 
 
 		 286 aa  142  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 		 299 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2196  ATP phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 		 299 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 		 299 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2250  ATP phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  0.235977 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  32.21 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  0.00000000491094 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0702  ATP phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  34.63 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  34.45 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1638  ATP phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0528843  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  31.86 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1616  ATP phosphoribosyltransferase  30.51 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.120755 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2856  ATP phosphoribosyltransferase  36.07 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245977  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1213  ATP phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1041  ATP phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 		 297 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 		 292 aa  139  6e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 289 aa  137  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0405  ATP phosphoribosyltransferase  31.99 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  32.04 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  31.53 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  29.53 
 
 		 305 aa  136  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2631  ATP phosphoribosyltransferase  31.53 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  0.97074 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  35.25 
 
 		 291 aa  136  4e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00832  ATP phosphoribosyltransferase  31.63 
 
 		 304 aa  136  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000340807  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 		 287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  29.15 
 
 		 299 aa  135  7.000000000000001e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  31.89 
 
 		 290 aa  135  8e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1769  ATP phosphoribosyltransferase  28.47 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1584  ATP phosphoribosyltransferase  28.47 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01118  ATP phosphoribosyltransferase  31.53 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  30.53 
 
 		 286 aa  133  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>