146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1933 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1933  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  100 
 
 
284 aa  563  1e-160  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1647  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  54.29 
 
 
282 aa  292  5e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.114853  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0995  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  35.48 
 
 
278 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0176059  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0950  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  35.48 
 
 
278 aa  143  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1040  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  36.23 
 
 
279 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1730  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  35.13 
 
 
278 aa  136  4e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1697  prenyltransferase  43.43 
 
 
279 aa  132  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0977  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  33.33 
 
 
278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.92785  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  31.49 
 
 
281 aa  124  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1142  UbiA prenyltransferase  34.07 
 
 
267 aa  123  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1863  prenyltransferase  32.75 
 
 
289 aa  122  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.959148  normal  0.340007 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1449  UbiA prenyltransferase  38.04 
 
 
284 aa  115  6e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.260951  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1016  UbiA prenyltransferase  36.13 
 
 
284 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  31.25 
 
 
282 aa  106  5e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  33.94 
 
 
283 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0771  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  30.2 
 
 
259 aa  103  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0487917  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2544  prenyltransferase  34.53 
 
 
281 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0636  prenyltransferase  31.41 
 
 
277 aa  96.7  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3311  prenyltransferase  32.84 
 
 
291 aa  95.9  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1733  UbiA prenyltransferase  33.85 
 
 
276 aa  94  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1843  prenyltransferase  33.09 
 
 
279 aa  94  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.183334  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  30.35 
 
 
283 aa  90.5  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3485  UbiA prenyltransferase  28.74 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2079  prenyltransferase  32.16 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.728738  normal  0.183793 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0625  prenyltransferase  28.62 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.24131  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04595  hypothetical protein  30.36 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.311519  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2480  prenyltransferase  31.16 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0220727  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2954  prenyltransferase  31.34 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1693  prenyltransferase  29.61 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00802705  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0958  UbiA prenyltransferase  35.39 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1338  prenyltransferase  26.74 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1385  UbiA prenyltransferase  26.13 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0949152  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12008  Maf-like protein  29.43 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.528538  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1958  prenyltransferase  28.63 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0740  UbiA prenyltransferase  30.56 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.572168 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0749  UbiA prenyltransferase  31.41 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.870578  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2757  UbiA prenyltransferase  29.86 
 
 
324 aa  72.8  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4380  UbiA prenyltransferase  33.33 
 
 
327 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2883  UbiA prenyltransferase  28.73 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0088223 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3992  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.89 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2061  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.16 
 
 
309 aa  65.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2123  UbiA prenyltransferase  36.18 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.905572 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3669  UbiA prenyltransferase  30.97 
 
 
185 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000695269  normal  0.0238668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5365  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.08 
 
 
274 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0827781  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1449  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.36 
 
 
333 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.482254  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1390  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.15 
 
 
334 aa  62.4  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.937819  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0545  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.94 
 
 
330 aa  61.6  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.659162  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0002  tocopherol phytyltransferase  26.34 
 
 
299 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0602  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.82 
 
 
330 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.171113  normal  0.0295962 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1742  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.42 
 
 
276 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0306  UbiA prenyltransferase  26.67 
 
 
288 aa  59.7  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4820  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.23 
 
 
295 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0428449 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0630  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.49 
 
 
330 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.774634  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1155  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.16 
 
 
376 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.142622  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0555  UbiA prenyltransferase  27.78 
 
 
290 aa  59.3  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1145  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.09 
 
 
333 aa  59.3  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0627  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.47 
 
 
303 aa  58.9  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0911  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.78 
 
 
300 aa  58.9  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2084  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.03 
 
 
339 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.296271  normal  0.748804 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1302  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.32 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3530  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.42 
 
 
301 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.47035 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0583  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.88 
 
 
320 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1998  bacteriochlorophyll c synthase  26.15 
 
 
333 aa  57.4  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.451912 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1605  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.88 
 
 
325 aa  57  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5287  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.53 
 
 
295 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111529  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3747  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.65 
 
 
297 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7263  UbiA prenyltransferase  29.57 
 
 
300 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000688363  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1852  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.57 
 
 
294 aa  57  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409299 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3714  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.23 
 
 
315 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1719  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.89 
 
 
297 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.641378  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0165  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.57 
 
 
303 aa  55.8  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1089  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.98 
 
 
333 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0941  bacteriochlorophyll c synthase  25.61 
 
 
337 aa  55.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1105  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.04 
 
 
299 aa  55.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.359039  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2286  UbiA prenyltransferase  36.36 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.3473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0429  UbiA prenyltransferase  27.22 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.910101 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0160  UbiA prenyltransferase  27.87 
 
 
291 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000799272  hitchhiker  0.000000000000598028 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0209  bacteriochlorophyll c synthase  25.58 
 
 
334 aa  54.7  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1782  UbiA prenyltransferase  23.08 
 
 
247 aa  53.9  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0708  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.42 
 
 
332 aa  53.9  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.630035  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0020  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  33.33 
 
 
343 aa  53.5  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04241  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.87 
 
 
316 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2632  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  34.13 
 
 
310 aa  52.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2738  predicted protein  24.89 
 
 
235 aa  52.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6422  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.17 
 
 
300 aa  52.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3341  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.21 
 
 
337 aa  52.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.03622 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2360  bacteriochlorophyll c synthase  27.5 
 
 
333 aa  52.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.663632  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2172  bacteriochlorophyll c synthase  28.12 
 
 
333 aa  52.4  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46085  predicted protein  28.64 
 
 
423 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.232641  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0368  bacteriochlorophyll c synthase  25.67 
 
 
335 aa  51.6  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.259035  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0427  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.36 
 
 
315 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0986  UbiA prenyltransferase  28.81 
 
 
292 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.665477  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0876  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.89 
 
 
326 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1236  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.46 
 
 
318 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04901  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.78 
 
 
315 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1016  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.66 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3752  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.38 
 
 
304 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  hitchhiker  0.000466186 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0238  bacteriochlorophyll c synthase  24.24 
 
 
334 aa  50.4  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.325704  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04831  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.76 
 
 
315 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.652512  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04521  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.76 
 
 
315 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>