More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1917 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1630  ATP synthase, A subunit  81.42 
 
 
592 aa  1013    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.173193  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1917  V-type ATP synthase subunit A  100 
 
 
591 aa  1198    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000535851  normal  0.804968 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0065  V-type ATP synthase subunit A  54.59 
 
 
586 aa  669    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2089  V-type ATP synthase subunit A  55.34 
 
 
594 aa  641    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2319  V-type ATP synthase subunit A  56.15 
 
 
593 aa  640    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31761  hitchhiker  0.000245697 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3072  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  51.79 
 
 
589 aa  642    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0549  V-type ATP synthase subunit A  52.89 
 
 
586 aa  653    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0298  V-type ATP synthase subunit A  52.55 
 
 
586 aa  652    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.980479 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2267  V-type ATP synthase subunit A  54.86 
 
 
589 aa  673    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1243  V-type ATP synthase subunit A  53.24 
 
 
578 aa  639    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1890  V-type ATP synthase subunit A  53.05 
 
 
591 aa  652    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1609  V-type ATP synthase subunit A  53.05 
 
 
591 aa  652    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.061044  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19400  V-type ATP synthase subunit A  52.57 
 
 
590 aa  637    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2345  V-type ATP synthase subunit A  56.62 
 
 
588 aa  642    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.233944 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1615  V-type ATP synthase subunit A  52.72 
 
 
586 aa  652    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110915  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1262  ATP synthase, A subunit  57.26 
 
 
582 aa  687    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2364  ATP synthase, A subunit  56.59 
 
 
590 aa  675    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1691  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  54.19 
 
 
592 aa  695    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.658723 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0705  V-type ATP synthase subunit A  55.15 
 
 
593 aa  648    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00787453 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0367  V-type ATP synthase subunit A  52.89 
 
 
586 aa  654    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1961  V-type ATP synthase subunit A  54.31 
 
 
594 aa  634  1e-180  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.731363  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1501  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  54.58 
 
 
589 aa  634  1e-180  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0287  V-type ATP synthase subunit A  55.13 
 
 
584 aa  630  1e-179  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0217  V-type ATP synthase subunit A  54.06 
 
 
595 aa  630  1e-179  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2677  V-type ATP synthase subunit A  54.58 
 
 
588 aa  628  1e-179  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.169554  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0858  H(+)-transporting two-sector ATPase  52.2 
 
 
569 aa  625  1e-178  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0256  H(+)-transporting two-sector ATPase  50 
 
 
588 aa  625  1e-178  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0342  V-type ATP synthase subunit A  51.53 
 
 
601 aa  626  1e-178  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1183  V-type ATP synthase subunit A  54.95 
 
 
582 aa  624  1e-177  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.100711  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0386  V-type ATP synthase subunit A  51.8 
 
 
578 aa  618  1e-176  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.938389  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1770  V-type ATP synthase subunit A  54.04 
 
 
588 aa  621  1e-176  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1686  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  50.08 
 
 
585 aa  617  1e-175  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0961  H(+)-transporting two-sector ATPase  51.02 
 
 
578 aa  615  9.999999999999999e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3353  ATP synthase, A subunit  50.6 
 
 
587 aa  609  1e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1453  H(+)-transporting two-sector ATPase  49.83 
 
 
576 aa  599  1e-170  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156481  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1759  V-type ATP synthase subunit A  51.05 
 
 
584 aa  601  1e-170  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1281  V-type ATP synthase subunit A  50.52 
 
 
586 aa  601  1e-170  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.684599  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1222  V-type ATP synthase subunit A  54.41 
 
 
581 aa  599  1e-170  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.264618  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1371  ATP synthase, A subunit  50.52 
 
 
587 aa  595  1e-169  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1437  V-type ATP synthase subunit A  50.26 
 
 
587 aa  595  1e-169  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1102  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  50.51 
 
 
586 aa  594  1e-168  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1609  V-type ATP synthase subunit A  51.27 
 
 
576 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2047  V-type ATP synthase subunit A  48.62 
 
 
582 aa  580  1e-164  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0517  H(+)-transporting two-sector ATPase  48.65 
 
 
594 aa  581  1e-164  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2083  V-type ATP synthase subunit A  50.25 
 
 
591 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117647  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50597  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  48.57 
 
 
617 aa  565  1e-160  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.353964  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3442  V-type ATP synthase subunit A  45.98 
 
 
588 aa  564  1.0000000000000001e-159  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1011  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  47.92 
 
 
582 aa  560  1e-158  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0281  V-type ATP synthase subunit A  48.9 
 
 
591 aa  551  1e-156  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02210  endodeoxyribonuclease, putative  47.47 
 
 
618 aa  555  1e-156  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2668  V-type ATP synthase subunit A  50.92 
 
 
579 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.367334  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2763  V-type ATP synthase subunit A  51.1 
 
 
579 aa  532  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0129183  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1202  V-type ATP synthase subunit A  50.92 
 
 
579 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27923  predicted protein  48.46 
 
 
623 aa  530  1e-149  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143267  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2564  V-type ATP synthase subunit A  49.63 
 
 
578 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.370873 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0422  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit, central region  44.26 
 
 
524 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1683  V-type ATP synthase subunit A  45.85 
 
 
589 aa  442  1e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00187142  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3462  H(+)-transporting two-sector ATPase  44.94 
 
 
575 aa  444  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.543302 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08021  hypothetical protein similar to V-type H+-ATPase subunit A (Eurofung)  52.66 
 
 
413 aa  430  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000635616 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2903  V-type ATP synthase subunit A  44.01 
 
 
607 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0094  V-type ATP synthase subunit A  43.53 
 
 
575 aa  426  1e-118  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1827  V-type ATP synthase subunit A  40.7 
 
 
589 aa  426  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3217  V-type ATP synthase subunit A  44.01 
 
 
607 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0582  V-type ATP synthase subunit A  41.05 
 
 
591 aa  382  1e-104  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1803  V-type ATP synthase subunit A  40.79 
 
 
584 aa  381  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1550  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.56 
 
 
587 aa  372  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75615  Vacuolar H+-ATPase V1 sector, subunit A  46.91 
 
 
1065 aa  307  4.0000000000000004e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4072  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.15 
 
 
471 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.77 
 
 
471 aa  141  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.339538  normal  0.476467 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1265  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.06 
 
 
471 aa  140  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0512  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.06 
 
 
471 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.399895 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.77 
 
 
473 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.47 
 
 
468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.47 
 
 
468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  30 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.18 
 
 
473 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.18 
 
 
469 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  28.74 
 
 
470 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.18 
 
 
469 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.18 
 
 
469 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.18 
 
 
469 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.18 
 
 
469 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.18 
 
 
469 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.88 
 
 
464 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2325  ATP synthase F1, beta subunit  30.24 
 
 
462 aa  130  6e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0462267  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3074  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.03 
 
 
458 aa  130  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.88 
 
 
468 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.1 
 
 
465 aa  130  9.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.88 
 
 
468 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.36 
 
 
484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.91 
 
 
484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0008  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.14 
 
 
460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.366806  normal  0.022382 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2165  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.75 
 
 
459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0141  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.93 
 
 
457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.773497  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.03 
 
 
458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.73 
 
 
476 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4194  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.09 
 
 
460 aa  128  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.821346  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3305  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.63 
 
 
459 aa  128  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384561  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2382  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.89 
 
 
476 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.48 
 
 
465 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>