More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1902 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1305  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  60.05 
 
 
1128 aa  1299    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1902  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
1152 aa  2256    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165011  normal  0.0801476 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1086  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.25 
 
 
500 aa  293  2e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0284  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  37.24 
 
 
517 aa  268  4e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000106102 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1087  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.25 
 
 
691 aa  241  6.999999999999999e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1629  NADH dehydrogenase (quinone)  41.25 
 
 
476 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.22379  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0285  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  31.95 
 
 
692 aa  234  1e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000361477 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0650  NADH dehydrogenase (quinone)  37.85 
 
 
476 aa  231  5e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208373  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0654  NADH dehydrogenase (quinone)  41.41 
 
 
474 aa  219  2e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0519  NADH dehydrogenase (quinone)  38.52 
 
 
476 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1280  NADH dehydrogenase (quinone)  31.5 
 
 
657 aa  214  9e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000385592 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0520  NADH dehydrogenase (quinone)  34.26 
 
 
620 aa  202  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0653  NADH dehydrogenase (quinone)  32.15 
 
 
611 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1628  NADH dehydrogenase (quinone)  35.42 
 
 
617 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0386908  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0651  NADH dehydrogenase (quinone)  33.1 
 
 
616 aa  193  2e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.415661  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  33.85 
 
 
636 aa  185  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1667  NADH dehydrogenase subunit L  29.71 
 
 
612 aa  177  7e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2282  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.41 
 
 
425 aa  177  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.335323 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.41 
 
 
641 aa  176  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4550  NADH dehydrogenase subunit L  33.33 
 
 
695 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0852267  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  30.84 
 
 
701 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0192  NADH dehydrogenase subunit L  31.26 
 
 
610 aa  176  2.9999999999999996e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.61 
 
 
642 aa  175  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2096  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.95 
 
 
726 aa  175  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.83 
 
 
725 aa  175  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.540916 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1566  NADH dehydrogenase subunit L  28.32 
 
 
643 aa  174  7.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0374  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.3 
 
 
625 aa  174  9e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1606  NADH dehydrogenase (ubiquinone), L subunit  29.74 
 
 
653 aa  174  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0292  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  29.21 
 
 
642 aa  172  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  29.7 
 
 
688 aa  173  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0557  NADH-quinone oxidoreductase chain L  29.61 
 
 
653 aa  173  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.03 
 
 
643 aa  172  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0149  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.31 
 
 
618 aa  172  5e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000427063  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.58 
 
 
656 aa  171  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  27.75 
 
 
620 aa  171  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.99 
 
 
637 aa  171  8e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.84 
 
 
654 aa  169  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0321  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.58 
 
 
425 aa  169  2e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.583446  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0808  NADH dehydrogenase subunit L  29.36 
 
 
661 aa  169  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1160  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.61 
 
 
671 aa  169  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0554  NADH dehydrogenase I, L subunit  26.47 
 
 
621 aa  168  5e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.445121  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0813  NADH dehydrogenase subunit L  29.36 
 
 
661 aa  168  6.9999999999999995e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  32.73 
 
 
654 aa  167  8e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3405  NADH dehydrogenase subunit L  30.67 
 
 
617 aa  167  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0475  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.87 
 
 
622 aa  167  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.230809 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0932  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.53 
 
 
642 aa  167  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.23 
 
 
652 aa  167  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1434  NADH dehydrogenase subunit L  30.46 
 
 
600 aa  167  1.0000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_802  NADH:quinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)  32.35 
 
 
654 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  27.43 
 
 
630 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1281  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.27 
 
 
488 aa  166  3e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000193774 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1817  NADH dehydrogenase subunit L  29.55 
 
 
640 aa  166  3e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000815464  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0550  NADH dehydrogenase subunit L  31.09 
 
 
636 aa  165  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.297459  normal  0.844264 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1800  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.08 
 
 
429 aa  165  4.0000000000000004e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.916161 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2874  NADH dehydrogenase subunit L  31.87 
 
 
697 aa  165  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429312  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2387  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  27.75 
 
 
666 aa  165  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00790686  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1235  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  27.62 
 
 
627 aa  165  6e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1272  NADH dehydrogenase subunit L  29.35 
 
 
666 aa  164  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288124  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3287  NADH dehydrogenase subunit L  32.18 
 
 
697 aa  164  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33354  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  27.03 
 
 
614 aa  164  1e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.17 
 
 
628 aa  164  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2209  NADH dehydrogenase subunit L  29.91 
 
 
683 aa  164  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.48 
 
 
681 aa  163  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5064  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.46 
 
 
649 aa  163  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3384  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.49 
 
 
654 aa  163  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.31001  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5413  NADH dehydrogenase subunit L  27.89 
 
 
620 aa  163  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0789  NADH dehydrogenase subunit L  29.85 
 
 
654 aa  162  3e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0323982  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0480  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.33 
 
 
639 aa  162  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.6 
 
 
642 aa  162  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4054  NADH dehydrogenase subunit L  31.32 
 
 
652 aa  162  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.431336 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2412  NADH dehydrogenase subunit L  28.98 
 
 
664 aa  162  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33518  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.2 
 
 
667 aa  162  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.65 
 
 
667 aa  162  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0476  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  25.67 
 
 
621 aa  162  5e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0461902  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1364  NADH dehydrogenase subunit L  29.57 
 
 
666 aa  161  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.703678  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.89 
 
 
671 aa  161  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0920  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.46 
 
 
639 aa  161  7e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5090  NADH dehydrogenase subunit L  30.7 
 
 
620 aa  161  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1727  NADH dehydrogenase subunit L  28.72 
 
 
663 aa  160  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4452  NADH dehydrogenase subunit L  31.35 
 
 
651 aa  160  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.221921 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5383  NADH dehydrogenase subunit L  30.07 
 
 
620 aa  160  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.0362e-16 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1102  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.5 
 
 
650 aa  160  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0391  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.75 
 
 
649 aa  160  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1739  NADH dehydrogenase subunit L  29.39 
 
 
596 aa  160  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.409991  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.61 
 
 
642 aa  160  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1327  NADH dehydrogenase subunit L  27.71 
 
 
685 aa  160  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0169357 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0985  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.57 
 
 
624 aa  160  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.07 
 
 
654 aa  159  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.259071  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4974  NADH dehydrogenase subunit L  30.07 
 
 
620 aa  159  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1518  NADH dehydrogenase subunit L  26.74 
 
 
613 aa  159  3e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.282876  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1553  NADH dehydrogenase subunit L  29.71 
 
 
596 aa  159  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00128293  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.32 
 
 
710 aa  159  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0660  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  30.15 
 
 
687 aa  159  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1919  NADH dehydrogenase subunit L  29.35 
 
 
596 aa  159  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0146018  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.89 
 
 
639 aa  159  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.89 
 
 
639 aa  159  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3182  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.89 
 
 
639 aa  159  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2694  NADH-quinone oxidoreductase chain L  29.66 
 
 
657 aa  159  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1076  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.93 
 
 
553 aa  159  4e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.031536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4992  NADH dehydrogenase subunit L  29.84 
 
 
620 aa  158  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>