More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1857 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1857  nucleotidyl transferase  100 
 
 
220 aa  445  1.0000000000000001e-124  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.58805 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0287  Nucleotidyl transferase  58.74 
 
 
234 aa  274  9e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  49.34 
 
 
237 aa  214  9e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1138  nucleotidyl transferase  54.79 
 
 
227 aa  214  9e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0843  nucleotidyl transferase  47.98 
 
 
222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000793597 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  49.32 
 
 
230 aa  211  5.999999999999999e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0370  nucleotidyl transferase  50.68 
 
 
227 aa  211  7e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.357076 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1337  nucleotidyl transferase  50.45 
 
 
228 aa  211  1e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0683407  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1757  nucleotidyl transferase  50.68 
 
 
228 aa  208  6e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0492  nucleotidyl transferase  49.32 
 
 
230 aa  207  7e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000162703 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3317  Nucleotidyl transferase  38.33 
 
 
243 aa  158  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2143  putative guanyltransferase  37.55 
 
 
240 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.187528  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  37.5 
 
 
348 aa  141  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  37.56 
 
 
361 aa  139  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  37.1 
 
 
361 aa  137  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0708  Nucleotidyl transferase  37.17 
 
 
334 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.509912  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  37.56 
 
 
361 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  35.53 
 
 
784 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  35.53 
 
 
784 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  35.53 
 
 
784 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  35.53 
 
 
784 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  35.53 
 
 
784 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  35.53 
 
 
784 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  34.21 
 
 
784 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  35.09 
 
 
784 aa  131  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  34.21 
 
 
784 aa  131  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  34.65 
 
 
784 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  38.42 
 
 
818 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  37.04 
 
 
349 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  34.7 
 
 
370 aa  128  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  33.62 
 
 
841 aa  127  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  33.48 
 
 
828 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  30.47 
 
 
828 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  32.48 
 
 
843 aa  126  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
785 aa  126  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
830 aa  125  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0238  D,D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase  38.89 
 
 
408 aa  124  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.546722 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  31.88 
 
 
840 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  31.06 
 
 
832 aa  122  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  31.03 
 
 
836 aa  122  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  31.03 
 
 
836 aa  121  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  31.91 
 
 
832 aa  122  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  33.73 
 
 
347 aa  121  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3557  nucleotidyl transferase  38.12 
 
 
238 aa  121  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  37.56 
 
 
347 aa  121  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  31.91 
 
 
836 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  34.33 
 
 
820 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  31.49 
 
 
836 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  30.6 
 
 
835 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1968  nucleotidyltransferase family protein  33.33 
 
 
476 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  31.78 
 
 
712 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  33.83 
 
 
843 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2335  putative sugar-phosphate nucleotide transferase  33.62 
 
 
352 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0321237  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0738  Nucleotidyl transferase  38.36 
 
 
346 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0293389  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  34.8 
 
 
362 aa  120  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  32.84 
 
 
842 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  36.05 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  32.84 
 
 
842 aa  119  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  28.45 
 
 
830 aa  119  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  33.63 
 
 
820 aa  119  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  34.5 
 
 
818 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  34.5 
 
 
810 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  30.6 
 
 
835 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  36.41 
 
 
411 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  30.34 
 
 
343 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  35.02 
 
 
411 aa  118  7e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0885  Nucleotidyl transferase  33.04 
 
 
229 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.83 
 
 
842 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  31.33 
 
 
827 aa  117  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  31.51 
 
 
833 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  31.44 
 
 
392 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.41 
 
 
393 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3175  Nucleotidyl transferase  33.48 
 
 
245 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673633  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0598  nucleotidyl transferase  29.74 
 
 
348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.534705  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  33.48 
 
 
367 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  38.04 
 
 
393 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  34.83 
 
 
816 aa  115  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  34.56 
 
 
411 aa  116  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  30.6 
 
 
835 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  30.97 
 
 
835 aa  115  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5131  Nucleotidyl transferase  34.05 
 
 
243 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0744  nucleotidyl transferase  34.82 
 
 
364 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.196844 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  33.04 
 
 
387 aa  115  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  30.47 
 
 
821 aa  115  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1374  mannose-1-phosphate guanyltransferase  34.08 
 
 
364 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4031  nucleotidyl transferase  33.18 
 
 
245 aa  115  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2394  nucleotidyl transferase  33.04 
 
 
346 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  31.88 
 
 
828 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  33.66 
 
 
366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3094  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  32.92 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1231  flagellin modification protein PtmE, putative sugar-phosphate nucleotide transferase  31.72 
 
 
345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000208573  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  31.7 
 
 
387 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2657  nucleotidyl transferase  33.2 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2384  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  33.2 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05586  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (EC 2.7.7.13)(GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase)(GDP-mannose pyrophosphorylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B1J4]  31.42 
 
 
364 aa  112  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  33.66 
 
 
832 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  30.08 
 
 
841 aa  113  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0541  nucleotidyl transferase  34.43 
 
 
238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0633  Nucleotidyl transferase  31.47 
 
 
353 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2192  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  32.08 
 
 
256 aa  112  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00604297  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>