197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1785 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 180 aa  360  7.0000000000000005e-99  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  51.38 
 
 		 194 aa  189  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  41.53 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  42.78 
 
 		 181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  37.64 
 
 		 187 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  46.1 
 
 		 186 aa  133  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  40 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1741  2'-5' RNA ligase  41.34 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000285675 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  36.52 
 
 		 189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  39.61 
 
 		 181 aa  110  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  35.06 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  36.26 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  36.76 
 
 		 177 aa  103  9e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  33.16 
 
 		 180 aa  100  8e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  37.5 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  32.96 
 
 		 192 aa  98.2  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  32.04 
 
 		 189 aa  97.1  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  36.9 
 
 		 194 aa  96.7  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  32.07 
 
 		 194 aa  95.1  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  34.08 
 
 		 185 aa  94.4  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  34.78 
 
 		 179 aa  93.6  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  34.57 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  35.03 
 
 		 186 aa  91.7  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  30.73 
 
 		 171 aa  90.9  8e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  28.72 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  29.26 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  31.18 
 
 		 187 aa  88.2  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  32.24 
 
 		 200 aa  87.8  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  33.7 
 
 		 184 aa  87.4  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  33.15 
 
 		 174 aa  87  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  32.76 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  32.6 
 
 		 174 aa  86.7  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  34.52 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  32.24 
 
 		 190 aa  85.1  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  30.77 
 
 		 193 aa  85.1  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  33.51 
 
 		 185 aa  84.7  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 183 aa  84.3  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  32.8 
 
 		 186 aa  84.3  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  32.6 
 
 		 174 aa  84.3  9e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  32.76 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  35.36 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  38.85 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  28.89 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  35.91 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  34.83 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1290  2'-5' RNA ligase  28.04 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189928  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  32.02 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  28.8 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  31.33 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  30.94 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  34.36 
 
 		 190 aa  80.9  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  30.59 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  28.98 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  32 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  29.07 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  34.64 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  36.18 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  35.53 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  29.19 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  31.13 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  35.62 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  32.56 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  34.73 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0080  2'-5' RNA ligase  30.05 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.91428  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  31.87 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1157  2'-5' RNA ligase  28.8 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  34.25 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  32.98 
 
 		 298 aa  74.3  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  30.56 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  34.23 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  32.04 
 
 		 183 aa  72  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  27.17 
 
 		 189 aa  70.9  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1659  2'-5' RNA ligase  32.05 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000321406  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  30.05 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1707  2'-5' RNA ligase  31.95 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.553995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8791  2'-5' RNA ligase  33.14 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  27.75 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0528  2',5' RNA ligase  29.48 
 
 		 178 aa  67  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  27.93 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  30.23 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1636  2'-5' RNA ligase  25.95 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0904  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0022796 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  27.75 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0370  hypothetical protein  28.3 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0261  2'-5' RNA ligase  26.26 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00684061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  29.86 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  28.89 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0420  2'-5' RNA ligase  27.66 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0821  2'-5' RNA ligase  29.81 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  27.48 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  27.75 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1002  2'-5' RNA ligase  26.92 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000523375  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02479  3'-5' RNA ligase  28.36 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  34.62 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0746  2'-5' RNA ligase  38.24 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.836735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  27.45 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2137  2',5' RNA ligase  32.41 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0111  2'-5' RNA ligase  32.61 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>