More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1757 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1950  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  72.23 
 
 
447 aa  640    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910344  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  100 
 
 
446 aa  898    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.941567  normal  0.290924 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0296  GTP-binding signal recognition particle  45.62 
 
 
449 aa  387  1e-106  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000583511  normal  0.0555503 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0917  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  46.61 
 
 
449 aa  382  1e-105  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000000145882  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0865  signal recognition particle protein Srp54  45.35 
 
 
450 aa  380  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0440978  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1260  signal recognition particle protein Srp54  45.35 
 
 
450 aa  380  1e-104  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0597  GTP-binding signal recognition particle  46.35 
 
 
433 aa  381  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000223356  hitchhiker  0.00000371893 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1726  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.18 
 
 
431 aa  379  1e-104  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.878395 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0799  signal recognition particle protein Srp54  45.13 
 
 
450 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1474  signal recognition particle protein Srp54  45.93 
 
 
446 aa  377  1e-103  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.570422  decreased coverage  0.000118802 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1519  GTP-binding signal recognition particle  44.94 
 
 
433 aa  374  1e-102  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.262746  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1119  signal recognition particle protein Srp54  46.35 
 
 
450 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.227466  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3023  signal recognition particle protein Srp54  44.03 
 
 
437 aa  372  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0025  signal recognition particle protein Srp54  45.35 
 
 
450 aa  363  3e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205386  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1769  GTP-binding signal recognition particle  43.48 
 
 
433 aa  362  6e-99  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0023858 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0502  GTP-binding signal recognition particle  44.2 
 
 
431 aa  362  6e-99  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0747031  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0141  signal recognition particle protein Srp54  42.18 
 
 
439 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1964  signal recognition particle protein Srp54  44.55 
 
 
443 aa  359  5e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0544  signal recognition particle protein Srp54  45.06 
 
 
440 aa  359  6e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0717053  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1877  signal recognition particle protein Srp54  44.29 
 
 
441 aa  348  8e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.189511 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0918  signal recognition particle protein Srp54  41.63 
 
 
443 aa  347  3e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0369  signal recognition particle protein Srp54  41.69 
 
 
444 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1261  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  39.19 
 
 
469 aa  330  4e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0531  GTP-binding signal recognition particle  43.05 
 
 
442 aa  317  2e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  40.43 
 
 
469 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  40.89 
 
 
443 aa  312  5.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73416  Signal recognition particle 54 kDa protein  40.99 
 
 
561 aa  311  1e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0128602 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0496  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  37.67 
 
 
464 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.50914 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.58 
 
 
446 aa  309  5e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  40.53 
 
 
446 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1802  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  37.44 
 
 
464 aa  305  9.000000000000001e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  42.13 
 
 
479 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  41.78 
 
 
445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1226  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  38.43 
 
 
468 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.78 
 
 
447 aa  304  3.0000000000000004e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13417  predicted protein  39.82 
 
 
510 aa  303  5.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  42.09 
 
 
444 aa  303  5.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  40.98 
 
 
450 aa  301  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08246  hypothetical protein similar to srpA gene product (Broad)  40.9 
 
 
542 aa  301  2e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0951188 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0260  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  38.14 
 
 
463 aa  300  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  38.3 
 
 
449 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  38.98 
 
 
449 aa  297  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  38.98 
 
 
449 aa  297  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  38.98 
 
 
449 aa  297  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  38.98 
 
 
449 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  38.98 
 
 
449 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  38.67 
 
 
446 aa  297  3e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  42.82 
 
 
453 aa  296  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  38.75 
 
 
449 aa  296  5e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  38.75 
 
 
449 aa  296  5e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  39.19 
 
 
439 aa  296  6e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  38.75 
 
 
449 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  38.75 
 
 
449 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  38.75 
 
 
449 aa  295  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  40.89 
 
 
452 aa  294  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  38.98 
 
 
449 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.81 
 
 
447 aa  293  3e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  40.68 
 
 
444 aa  293  6e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602256  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  37.91 
 
 
455 aa  292  9e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  36.57 
 
 
441 aa  291  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  38.55 
 
 
455 aa  291  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.81 
 
 
490 aa  292  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  38.55 
 
 
455 aa  291  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  37.93 
 
 
518 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  38.84 
 
 
453 aa  291  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.38 
 
 
449 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  38.66 
 
 
446 aa  289  6e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  41.12 
 
 
446 aa  289  7e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  37.41 
 
 
442 aa  288  1e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  36.22 
 
 
449 aa  288  1e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  38.6 
 
 
453 aa  288  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26018  IISP family transporter: Signal recognition particle 54 kDa protein (SRP54)  38.34 
 
 
513 aa  287  2e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  36.51 
 
 
442 aa  288  2e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  39.48 
 
 
448 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  36.36 
 
 
449 aa  286  4e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  37.04 
 
 
443 aa  286  5.999999999999999e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0983  signal recognition particle protein  36.71 
 
 
525 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0432973  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  37.73 
 
 
443 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  38.55 
 
 
448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  38.84 
 
 
520 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  38.43 
 
 
449 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2081  signal recognition particle protein  35.78 
 
 
517 aa  284  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.14 
 
 
443 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  40.24 
 
 
476 aa  284  3.0000000000000004e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0882  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.19 
 
 
492 aa  283  5.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.553698  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  37.06 
 
 
439 aa  283  6.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  37.53 
 
 
445 aa  283  6.000000000000001e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.89 
 
 
481 aa  283  6.000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  36.97 
 
 
449 aa  283  6.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.89 
 
 
452 aa  282  9e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  38.66 
 
 
453 aa  282  9e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.03 
 
 
470 aa  281  1e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000640801  normal  0.0289565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  37.09 
 
 
440 aa  282  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5930  signal recognition particle protein  38.8 
 
 
518 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.411186  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.7 
 
 
443 aa  282  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1142  signal recognition particle protein  35.91 
 
 
485 aa  281  1e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0433759  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1771  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.78 
 
 
496 aa  281  2e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2535  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.51 
 
 
483 aa  281  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00293209  normal  0.012093 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  38.07 
 
 
444 aa  280  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  37.47 
 
 
512 aa  280  4e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>