218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1752 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  86.3 
 
 		 482 aa  839    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  100 
 
 		 460 aa  939    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  63.85 
 
 		 484 aa  605  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  63.42 
 
 		 498 aa  600  1e-170  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  62.77 
 
 		 484 aa  598  1e-170  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  62.34 
 
 		 484 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  61.17 
 
 		 482 aa  566  1e-160  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  58.1 
 
 		 484 aa  550  1e-155  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  54.55 
 
 		 480 aa  529  1e-149  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  54.55 
 
 		 480 aa  531  1e-149  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  54.55 
 
 		 480 aa  529  1e-149  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  55.63 
 
 		 484 aa  525  1e-148  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  54.23 
 
 		 480 aa  525  1e-148  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  53.36 
 
 		 482 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  53.15 
 
 		 500 aa  508  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  54.55 
 
 		 486 aa  508  9.999999999999999e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  51.84 
 
 		 486 aa  484  1e-135  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  49.02 
 
 		 486 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1684  hypothetical protein  51.19 
 
 		 485 aa  464  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1619  hypothetical protein  50.11 
 
 		 485 aa  464  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.691717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  50.11 
 
 		 486 aa  462  1e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2726  hypothetical protein  49.46 
 
 		 493 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1393  hypothetical protein  49.89 
 
 		 485 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  49.46 
 
 		 486 aa  457  1e-127  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  47.94 
 
 		 474 aa  451  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  48.37 
 
 		 474 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  48.59 
 
 		 473 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25152  predicted protein  47.17 
 
 		 514 aa  438  9.999999999999999e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0747524  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  49.02 
 
 		 476 aa  435  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  49.89 
 
 		 477 aa  437  1e-121  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  49.46 
 
 		 481 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0989  protein of unknown function UPF0027  47.1 
 
 		 486 aa  433  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  47.61 
 
 		 477 aa  434  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  47.16 
 
 		 477 aa  434  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3271  protein of unknown function UPF0027  46.88 
 
 		 486 aa  432  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  50.22 
 
 		 480 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  47.72 
 
 		 478 aa  431  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  46.97 
 
 		 486 aa  429  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  45.77 
 
 		 472 aa  429  1e-119  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  45.77 
 
 		 477 aa  429  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  48.48 
 
 		 477 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2142  hypothetical protein  45.57 
 
 		 485 aa  428  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.053171  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  49.87 
 
 		 963 aa  427  1e-118  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  46.77 
 
 		 488 aa  428  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  49.89 
 
 		 477 aa  423  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  46.54 
 
 		 488 aa  421  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  48.7 
 
 		 486 aa  420  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0195  hypothetical protein  48.59 
 
 		 476 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.739539  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  46.26 
 
 		 475 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  49.77 
 
 		 432 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  48.81 
 
 		 477 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  46.32 
 
 		 476 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  46.1 
 
 		 476 aa  413  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  47.29 
 
 		 477 aa  414  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  48.49 
 
 		 476 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  45 
 
 		 443 aa  413  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  48.6 
 
 		 476 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2359  hypothetical protein  47.94 
 
 		 476 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442678 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  46.96 
 
 		 475 aa  404  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2024  protein of unknown function UPF0027  44.56 
 
 		 502 aa  394  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.445146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2399  hypothetical protein  48.81 
 
 		 472 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.722236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2548  hypothetical protein  48.37 
 
 		 472 aa  393  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0808238  decreased coverage  0.00000419114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  48.37 
 
 		 465 aa  386  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  43.51 
 
 		 473 aa  382  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  51.17 
 
 		 988 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3852  hypothetical protein  45.99 
 
 		 476 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  49.04 
 
 		 484 aa  376  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  44.81 
 
 		 473 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  45.28 
 
 		 487 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  45.28 
 
 		 487 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  45.28 
 
 		 479 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  44.85 
 
 		 488 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  41.74 
 
 		 478 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2027  protein of unknown function UPF0027  46.54 
 
 		 475 aa  353  4e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  39.87 
 
 		 462 aa  330  4e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  42.12 
 
 		 447 aa  328  9e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  33.68 
 
 		 451 aa  225  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  31.56 
 
 		 396 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  32.89 
 
 		 466 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  32.17 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  30.62 
 
 		 411 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  30.42 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  28.88 
 
 		 398 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  30.8 
 
 		 428 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  29.09 
 
 		 398 aa  157  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  30.51 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  31.07 
 
 		 407 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  27.08 
 
 		 411 aa  155  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  30.58 
 
 		 407 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  27.08 
 
 		 411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  29.25 
 
 		 398 aa  153  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  30.58 
 
 		 407 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  30.58 
 
 		 407 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5608  hypothetical protein  30.69 
 
 		 511 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30311  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  28.7 
 
 		 409 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  29.16 
 
 		 399 aa  152  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  30.24 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  30.25 
 
 		 398 aa  151  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  29.65 
 
 		 406 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  27.8 
 
 		 404 aa  150  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>