More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1710 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1851  thermosome  83.93 
 
 		 559 aa  933    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  59.21 
 
 		 558 aa  647    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  100 
 
 		 562 aa  1113    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  59.13 
 
 		 558 aa  605  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  56.58 
 
 		 545 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  58.68 
 
 		 560 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  59.47 
 
 		 554 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  57.41 
 
 		 553 aa  596  1e-169  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  58.68 
 
 		 553 aa  592  1e-168  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  56.31 
 
 		 551 aa  585  1e-166  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  54.05 
 
 		 570 aa  569  1e-161  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  54.81 
 
 		 539 aa  569  1e-161  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  52.34 
 
 		 543 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  54.68 
 
 		 535 aa  558  1e-157  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  52.72 
 
 		 554 aa  550  1e-155  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  52.14 
 
 		 557 aa  546  1e-154  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  51.31 
 
 		 555 aa  544  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  52.26 
 
 		 540 aa  543  1e-153  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  52.26 
 
 		 553 aa  542  1e-153  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  51.31 
 
 		 542 aa  544  1e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  54.12 
 
 		 548 aa  534  1e-150  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  50.55 
 
 		 543 aa  523  1e-147  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  51.87 
 
 		 551 aa  524  1e-147  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  53.75 
 
 		 550 aa  520  1e-146  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  53.92 
 
 		 549 aa  521  1e-146  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  53 
 
 		 552 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  53.56 
 
 		 554 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  48.18 
 
 		 543 aa  515  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  50.75 
 
 		 551 aa  514  1e-144  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  51.69 
 
 		 552 aa  513  1e-144  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  51.4 
 
 		 553 aa  513  1e-144  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  49.81 
 
 		 542 aa  505  1e-141  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  49.62 
 
 		 545 aa  504  1e-141  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  49.43 
 
 		 542 aa  501  1e-140  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  47.74 
 
 		 560 aa  501  1e-140  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  48.87 
 
 		 543 aa  496  1e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  48.88 
 
 		 547 aa  498  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  46.27 
 
 		 559 aa  487  1e-136  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  49.45 
 
 		 541 aa  481  1e-134  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  45.52 
 
 		 558 aa  476  1e-133  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  44.92 
 
 		 563 aa  472  1e-132  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  46.48 
 
 		 552 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.61 
 
 		 532 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  44.3 
 
 		 557 aa  461  9.999999999999999e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.14 
 
 		 530 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  43.31 
 
 		 554 aa  446  1.0000000000000001e-124  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  46.8 
 
 		 500 aa  442  1e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.42 
 
 		 536 aa  445  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  44.42 
 
 		 561 aa  443  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  43.21 
 
 		 529 aa  432  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  44.91 
 
 		 558 aa  434  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  43.58 
 
 		 527 aa  428  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  42.78 
 
 		 548 aa  413  1e-114  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  42.31 
 
 		 537 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  41.15 
 
 		 555 aa  398  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  39.7 
 
 		 541 aa  381  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  39.66 
 
 		 547 aa  377  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  40.34 
 
 		 528 aa  378  1e-103  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  36.84 
 
 		 538 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  40.45 
 
 		 536 aa  366  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  39.33 
 
 		 519 aa  368  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  40.26 
 
 		 548 aa  363  5.0000000000000005e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  36.35 
 
 		 527 aa  362  1e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  38.65 
 
 		 550 aa  360  3e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  37.99 
 
 		 546 aa  360  5e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  39.26 
 
 		 536 aa  359  6e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  39.38 
 
 		 535 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  39.21 
 
 		 525 aa  357  3.9999999999999996e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  35.78 
 
 		 567 aa  356  6.999999999999999e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  37.13 
 
 		 528 aa  354  2.9999999999999997e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  39.56 
 
 		 548 aa  350  5e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  39.23 
 
 		 527 aa  350  6e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  39.29 
 
 		 525 aa  348  1e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  39.19 
 
 		 558 aa  347  4e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  36.12 
 
 		 553 aa  346  7e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  39.16 
 
 		 529 aa  346  7e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  36.12 
 
 		 553 aa  346  7e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  34.41 
 
 		 559 aa  343  5e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  36.81 
 
 		 568 aa  337  2.9999999999999997e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  37.13 
 
 		 553 aa  333  4e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  35.69 
 
 		 570 aa  333  6e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  38.91 
 
 		 533 aa  332  1e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  37.48 
 
 		 542 aa  329  7e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  35.92 
 
 		 542 aa  328  1.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  37.02 
 
 		 551 aa  325  1e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  35.82 
 
 		 577 aa  306  9.000000000000001e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  34.45 
 
 		 530 aa  300  4e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.316899 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  32.65 
 
 		 560 aa  294  2e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  34.25 
 
 		 539 aa  291  3e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.470693 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  32.77 
 
 		 523 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  35.66 
 
 		 527 aa  283  6.000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  33.77 
 
 		 558 aa  283  7.000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  32.48 
 
 		 552 aa  282  9e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  32.45 
 
 		 541 aa  281  3e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  32.89 
 
 		 531 aa  279  1e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  32.17 
 
 		 563 aa  276  6e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19801  predicted protein  33.46 
 
 		 534 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289192  normal  0.0151262 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29714  predicted protein  33.46 
 
 		 534 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191135  hitchhiker  0.0018905 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  32.29 
 
 		 547 aa  269  1e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  34.15 
 
 		 526 aa  268  2e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>