54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1661 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1661  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  509  1e-143  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.32781  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1902  protein of unknown function DUF75  58.4 
 
 
248 aa  311  6.999999999999999e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0774  hypothetical protein  35.29 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179453  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0720  hypothetical protein  27.43 
 
 
234 aa  95.5  6e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0926  hypothetical protein  27.04 
 
 
248 aa  92.8  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0007  hypothetical protein  26.41 
 
 
236 aa  90.9  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121063  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1086  3-isopropylmalate dehydratase  26.61 
 
 
248 aa  89.7  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2010  hypothetical protein  27.66 
 
 
237 aa  88.6  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1927  hypothetical protein  27.47 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.655814  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0076  hypothetical protein  26.14 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0058  hypothetical protein  29.02 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0692  protein of unknown function DUF75  26.5 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0161  hypothetical protein  25.11 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.110174 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0342  protein of unknown function DUF75  27.39 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0721  hypothetical protein  24.68 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.538394  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0790  protein of unknown function DUF75  28.39 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2829  protein of unknown function DUF75  26.96 
 
 
245 aa  77  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.626247  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0667  protein of unknown function DUF75  26.32 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1741  hypothetical protein  23.81 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0583  hypothetical protein  25.97 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2034  protein of unknown function DUF75  26.64 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1402  hypothetical protein  26.79 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0921  hypothetical protein  25.2 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1058  hypothetical protein  26.38 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3816  protein of unknown function DUF75  26.57 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0659933  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0859  hypothetical protein  25.33 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.776803  hitchhiker  0.00442614 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1486  protein of unknown function DUF75  27.59 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.243377  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1797  hypothetical protein  26.13 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1250  protein of unknown function DUF75  23.73 
 
 
240 aa  61.2  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1531  protein of unknown function DUF75  22.37 
 
 
246 aa  60.5  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.687731  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2882  protein of unknown function DUF75  23.6 
 
 
251 aa  60.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.728218 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0226  hypothetical protein  24.9 
 
 
255 aa  58.9  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1950  hypothetical protein  22.87 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.622804 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  25.32 
 
 
276 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0357  hypothetical protein  26.36 
 
 
247 aa  56.6  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  26.18 
 
 
276 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1007  protein of unknown function DUF75  24.07 
 
 
250 aa  55.5  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2792  protein of unknown function DUF75  21.83 
 
 
250 aa  55.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.147305  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2273  hypothetical protein  24.22 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.222464  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  24.89 
 
 
276 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3654  protein of unknown function DUF75  24.4 
 
 
252 aa  52.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1565  3-isopropylmalate dehydratase  22.41 
 
 
256 aa  52  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2223  hypothetical protein  24.53 
 
 
273 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.37331  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1126  hypothetical protein  23.33 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0647  hypothetical protein  23.66 
 
 
237 aa  49.7  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0765  hypothetical protein  22.88 
 
 
276 aa  49.7  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.174527  normal  0.0509855 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1550  hypothetical protein  29.27 
 
 
304 aa  49.3  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.705196  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1398  hypothetical protein  22.91 
 
 
261 aa  49.3  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139952  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0906  hypothetical protein  22.55 
 
 
274 aa  47.4  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.992976  normal  0.453754 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1150  protein of unknown function DUF75  22.91 
 
 
251 aa  47.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.13291  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0414  hypothetical protein  20.17 
 
 
255 aa  46.6  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.270771  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1998  hypothetical protein  21.57 
 
 
274 aa  47  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0959  protein of unknown function DUF75  20.09 
 
 
256 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.405373  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0198  hypothetical protein  19.72 
 
 
257 aa  42.7  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>