More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1653 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1653  phosphoglycerate kinase  100 
 
 
407 aa  803    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.973793  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1614  Phosphoglycerate kinase  68.25 
 
 
415 aa  574  1.0000000000000001e-163  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1789  phosphoglycerate kinase  68.25 
 
 
412 aa  572  1.0000000000000001e-162  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0925666  normal  0.515243 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0773  phosphoglycerate kinase  44.39 
 
 
409 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.1233  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0495  phosphoglycerate kinase  39.07 
 
 
419 aa  311  2e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0845  phosphoglycerate kinase  40.1 
 
 
414 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37156  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0780  phosphoglycerate kinase  39.31 
 
 
414 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.281028  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0817  phosphoglycerate kinase  41.6 
 
 
404 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0043  phosphoglycerate kinase  39.6 
 
 
414 aa  298  1e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212818  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1138  phosphoglycerate kinase  39.31 
 
 
414 aa  297  2e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.927128  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1711  phosphoglycerate kinase  42 
 
 
408 aa  295  9e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0322554 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0744  phosphoglycerate kinase  41.15 
 
 
411 aa  294  1e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.333208 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3562  phosphoglycerate kinase  39.8 
 
 
413 aa  295  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.300765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1808  phosphoglycerate kinase  38.81 
 
 
412 aa  290  2e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0633  phosphoglycerate kinase  40.45 
 
 
408 aa  291  2e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3327  Phosphoglycerate kinase  40.74 
 
 
404 aa  288  9e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1600  Phosphoglycerate kinase  40.69 
 
 
408 aa  286  4e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0731  phosphoglycerate kinase  40.05 
 
 
408 aa  285  8e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1345  phosphoglycerate kinase  38.81 
 
 
413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0608  Phosphoglycerate kinase  40.4 
 
 
409 aa  281  1e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2342  phosphoglycerate kinase  37.22 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.480216 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2674  phosphoglycerate kinase  37.47 
 
 
407 aa  265  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.667783 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1251  phosphoglycerate kinase  35.47 
 
 
405 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0290  phosphoglycerate kinase  38.5 
 
 
388 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1194  phosphoglycerate kinase  36.32 
 
 
408 aa  258  1e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.622987  normal  0.0429324 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0500  phosphoglycerate kinase  37.28 
 
 
408 aa  249  7e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2372  phosphoglycerate kinase  38.48 
 
 
407 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.504326 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3795  Phosphoglycerate kinase  37.07 
 
 
402 aa  237  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2549  Phosphoglycerate kinase  35.54 
 
 
407 aa  230  3e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0534  Phosphoglycerate kinase  36.17 
 
 
405 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70067  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0914  Phosphoglycerate kinase  37.44 
 
 
389 aa  206  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  35.31 
 
 
397 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0744  phosphoglycerate kinase  34.58 
 
 
397 aa  201  3e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  35.99 
 
 
400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3335  phosphoglycerate kinase  33.58 
 
 
397 aa  199  7.999999999999999e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515635 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  35.06 
 
 
393 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  34.2 
 
 
396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  34.44 
 
 
396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  33.98 
 
 
395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_651  phosphoglycerate kinase  34.74 
 
 
397 aa  197  3e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  33.97 
 
 
396 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  34.88 
 
 
394 aa  196  8.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  34.07 
 
 
393 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  35.05 
 
 
443 aa  195  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  34.63 
 
 
650 aa  194  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6037  Phosphoglycerate kinase  34.41 
 
 
395 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  34.13 
 
 
403 aa  194  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  34.13 
 
 
398 aa  194  3e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  33.25 
 
 
396 aa  193  5e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0674  phosphoglycerate kinase  34.08 
 
 
397 aa  192  8e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  34.31 
 
 
393 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  35.31 
 
 
393 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  32.61 
 
 
646 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2199  Phosphoglycerate kinase  34.24 
 
 
395 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000332645  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0944  Phosphoglycerate kinase  34.4 
 
 
395 aa  189  7e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  33.5 
 
 
397 aa  189  8e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  33.5 
 
 
397 aa  189  9e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  33.01 
 
 
395 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1398  Phosphoglycerate kinase  33.66 
 
 
398 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  33.25 
 
 
395 aa  188  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1540  phosphoglycerate kinase  31.95 
 
 
395 aa  187  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0574001  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0226  phosphoglycerate kinase  32.54 
 
 
404 aa  186  4e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.846581  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  32.76 
 
 
394 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  33.25 
 
 
394 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  35.85 
 
 
402 aa  187  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3127  Phosphoglycerate kinase  32.12 
 
 
395 aa  187  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2059  Phosphoglycerate kinase  34.47 
 
 
395 aa  187  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0612926  normal  0.253988 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0303  phosphoglycerate kinase  33.25 
 
 
393 aa  186  5e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  34.72 
 
 
399 aa  186  6e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  34.49 
 
 
394 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0928  phosphoglycerate kinase  33.41 
 
 
403 aa  186  7e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.356711  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  34.47 
 
 
399 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1084  phosphoglycerate kinase  31.3 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  33.01 
 
 
395 aa  184  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1729  phosphoglycerate kinase  33.74 
 
 
395 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3097  phosphoglycerate kinase  34.24 
 
 
399 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767989  normal  0.141125 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1257  Phosphoglycerate kinase  32.68 
 
 
399 aa  183  4.0000000000000006e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  34.31 
 
 
394 aa  183  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  33.66 
 
 
396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1979  phosphoglycerate kinase  32.54 
 
 
399 aa  183  6e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.577028  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  32.62 
 
 
687 aa  183  6e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  33.17 
 
 
396 aa  182  7e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0028  phosphoglycerate kinase  32.41 
 
 
394 aa  182  8.000000000000001e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1671  phosphoglycerate kinase  33.5 
 
 
395 aa  182  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3324  phosphoglycerate kinase  34.71 
 
 
399 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  33.25 
 
 
401 aa  182  1e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3651  phosphoglycerate kinase  32.2 
 
 
400 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2170  Phosphoglycerate kinase  33.91 
 
 
399 aa  182  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5607  phosphoglycerate kinase  31.93 
 
 
397 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2388  Phosphoglycerate kinase  33.57 
 
 
392 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  32.76 
 
 
392 aa  181  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf530  phosphoglycerate kinase  33.01 
 
 
397 aa  181  2e-44  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0418919  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3076  phosphoglycerate kinase  32.93 
 
 
396 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0432  phosphoglycerate kinase  33.5 
 
 
401 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1992  phosphoglycerate kinase  32.67 
 
 
395 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771555  normal  0.436943 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15210  phosphoglycerate kinase  32.84 
 
 
400 aa  180  4e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00329101  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0798  phosphoglycerate kinase  33.08 
 
 
396 aa  180  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2016  phosphoglycerate kinase  32.27 
 
 
395 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  31.23 
 
 
394 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  34.86 
 
 
655 aa  180  4.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>