More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1650 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1611  Glycine hydroxymethyltransferase  77.14 
 
 		 433 aa  718    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1650  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 431 aa  895    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0346  serine hydroxymethyltransferase  50.23 
 
 		 431 aa  441  9.999999999999999e-123  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0045  serine hydroxymethyltransferase  50.84 
 
 		 430 aa  424  1e-117  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0231458 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0014  serine hydroxymethyltransferase  52.42 
 
 		 430 aa  419  1e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1090  serine hydroxymethyltransferase  50.97 
 
 		 430 aa  412  1e-114  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0048  serine hydroxymethyltransferase  51.21 
 
 		 429 aa  414  1e-114  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0061  Glycine hydroxymethyltransferase  45.61 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1046  serine hydroxymethyltransferase  45.74 
 
 		 429 aa  363  3e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1793  serine hydroxymethyltransferase  42.12 
 
 		 440 aa  341  1e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3351  Glycine hydroxymethyltransferase  38.1 
 
 		 445 aa  261  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0411175  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0929  Glycine hydroxymethyltransferase  33.66 
 
 		 440 aa  252  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.802509  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3925  Glycine hydroxymethyltransferase  36.57 
 
 		 417 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.991608  decreased coverage  0.00651172 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0271  Glycine hydroxymethyltransferase  33.8 
 
 		 358 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2079  serine hydroxymethyltransferase  31.8 
 
 		 445 aa  222  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.172467  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0729  serine hydroxymethyltransferase  33.75 
 
 		 415 aa  209  7e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  34.07 
 
 		 423 aa  209  7e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  34.92 
 
 		 415 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1917  serine hydroxymethyltransferase  35.19 
 
 		 430 aa  208  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.584505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  34.38 
 
 		 415 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  34.14 
 
 		 415 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  34.14 
 
 		 415 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0775  serine hydroxymethyltransferase  34.14 
 
 		 415 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0739852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  34.14 
 
 		 415 aa  206  8e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  34.53 
 
 		 431 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  34.94 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0700  serine hydroxymethyltransferase  34.53 
 
 		 431 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0504784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  36.27 
 
 		 417 aa  205  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2311  Glycine hydroxymethyltransferase  33.82 
 
 		 466 aa  205  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314902  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0765  serine hydroxymethyltransferase  33.98 
 
 		 415 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186767  normal  0.156833 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1231  serine hydroxymethyltransferase  35.91 
 
 		 417 aa  204  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2680  serine hydroxymethyltransferase  33.84 
 
 		 508 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  35.77 
 
 		 417 aa  203  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3363  serine hydroxymethyltransferase  34.53 
 
 		 415 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5200  serine hydroxymethyltransferase  34.53 
 
 		 415 aa  202  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  32.76 
 
 		 417 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  33.41 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  33.41 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  33.41 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  33.41 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0678  serine hydroxymethyltransferase  33.25 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.478588 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  33.41 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  33.41 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2449  serine hydroxymethyltransferase  34.34 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0722  serine hydroxymethyltransferase  32.75 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59476  normal  0.142236 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  34.47 
 
 		 422 aa  201  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  33.41 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3895  serine hydroxymethyltransferase  33.65 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  34.93 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2305  serine hydroxymethyltransferase  32.93 
 
 		 434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  33.5 
 
 		 420 aa  201  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3366  Glycine/serine hydroxymethyltransferase  32.69 
 
 		 391 aa  201  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.532531  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  34.1 
 
 		 418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  33.67 
 
 		 422 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1537  serine hydroxymethyltransferase  33.17 
 
 		 435 aa  200  3.9999999999999996e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4508  serine hydroxymethyltransferase  32.34 
 
 		 412 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.732205 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1887  Glycine hydroxymethyltransferase  34.91 
 
 		 419 aa  199  6e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  35.09 
 
 		 417 aa  199  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  35.09 
 
 		 417 aa  199  7e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  35.52 
 
 		 417 aa  199  7.999999999999999e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2754  serine hydroxymethyltransferase  34.37 
 
 		 415 aa  199  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2242  glycine hydroxymethyltransferase  31.48 
 
 		 420 aa  199  9e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0554627 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2930  serine hydroxymethyltransferase  35.58 
 
 		 417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2710  serine hydroxymethyltransferase  35.58 
 
 		 417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0218  serine hydroxymethyltransferase  32.31 
 
 		 419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0240245  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2755  serine hydroxymethyltransferase  35.58 
 
 		 417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.418331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2817  serine hydroxymethyltransferase  35.58 
 
 		 417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2796  serine hydroxymethyltransferase  35.58 
 
 		 417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  33.25 
 
 		 412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  33.25 
 
 		 412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0790  serine hydroxymethyltransferase  33.42 
 
 		 415 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0629  serine hydroxymethyltransferase  32.97 
 
 		 432 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  34.63 
 
 		 417 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  34.84 
 
 		 417 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  32.61 
 
 		 415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  34.84 
 
 		 417 aa  197  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0617  serine hydroxymethyltransferase  33.59 
 
 		 415 aa  197  3e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3638  serine hydroxymethyltransferase  34.13 
 
 		 417 aa  197  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  34.84 
 
 		 417 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  34.21 
 
 		 417 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2096  glycine hydroxymethyltransferase  33.67 
 
 		 425 aa  196  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.835184  normal  0.0355089 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  33.08 
 
 		 416 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  33.76 
 
 		 414 aa  196  5.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0055  serine hydroxymethyltransferase  33.42 
 
 		 424 aa  196  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  32.82 
 
 		 413 aa  196  6e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0307  serine hydroxymethyltransferase  32.1 
 
 		 414 aa  196  6e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.209874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3135  serine hydroxymethyltransferase  32.84 
 
 		 434 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  34.59 
 
 		 417 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1649  serine hydroxymethyltransferase  32.45 
 
 		 434 aa  196  9e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3769  Glycine hydroxymethyltransferase  31.19 
 
 		 417 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal  0.168004 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4822  serine hydroxymethyltransferase  32.92 
 
 		 424 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  34.21 
 
 		 417 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  34.17 
 
 		 411 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  34.21 
 
 		 417 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3036  serine hydroxymethyltransferase  35.58 
 
 		 417 aa  196  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.603855  normal  0.847682 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  33.97 
 
 		 417 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  34.12 
 
 		 415 aa  194  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2938  serine hydroxymethyltransferase  32.04 
 
 		 421 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  32.75 
 
 		 432 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  33.25 
 
 		 420 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>