33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1628 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1628  translation initiation factor IF-6  100 
 
 		 223 aa  441  1e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000860601  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1323  translation initiation factor eIF-6  56.05 
 
 		 223 aa  251  6e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3914  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0474  translation initiation factor IF-6  43.24 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1608  translation initiation factor IF-6  40.19 
 
 		 220 aa  154  8e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1826  translation initiation factor IF-6  37.85 
 
 		 221 aa  145  6e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.644834 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0199  translation initiation factor IF-6  38.39 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0856043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1567  translation initiation factor IF-6  37.1 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0458  translation initiation factor IF-6  40.19 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1662  translation initiation factor IF-6  36.11 
 
 		 221 aa  143  3e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0459  translation initiation factor IF-6  35.62 
 
 		 219 aa  142  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.410986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0998  translation initiation factor IF-6  34.68 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0113  translation initiation factor IF-6  36.07 
 
 		 217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0237  translation initiation factor IF-6  35.75 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1232  translation initiation factor eIF-6  33.33 
 
 		 221 aa  131  6.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.747719 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1818  translation initiation factor eIF-6  34.4 
 
 		 221 aa  128  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0235  translation initiation factor eIF-6  34.25 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0028  translation initiation factor eIF-6  34.25 
 
 		 218 aa  115  6e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1882  translation initiation factor IF-6  32.13 
 
 		 220 aa  112  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0937333 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0826  translation initiation factor IF-6  31.05 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00606754  normal  0.97826 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1076  translation initiation factor IF-6  33.18 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1478  translation initiation factor IF-6  33.79 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000242124  hitchhiker  0.000577571 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_66051  predicted protein  32.24 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0865921  normal  0.408575 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0889  translation initiation factor IF-6  31.8 
 
 		 227 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1058  translation initiation factor IF-6  31.8 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00650  eukaryotic translation initiation factor 6 (eif-6), putative  33.18 
 
 		 245 aa  105  8e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1968  translation initiation factor IF-6  32.86 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119613  eukaryotic translation initiation factor 6  31.78 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.514842  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1616  translation initiation factor IF-6  31.34 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24493  predicted protein  31.36 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.608395  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0540  translation initiation factor IF-6  31.13 
 
 		 221 aa  101  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000169194  normal  0.901506 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08824  translation initiation factor eIF-6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06010)  29.44 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00475287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3020  translation initiation factor IF-6  30.41 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0125  translation initiation factor IF-6  28.31 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.079136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>