254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1578 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1578  purine phosphorylase family 1  100 
 
 
238 aa  483  1e-135  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00464289 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0520  purine or other phosphorylase family 1  68.51 
 
 
236 aa  341  5.999999999999999e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3914  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0062  purine phosphorylases family protein 1  49.79 
 
 
237 aa  229  2e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1546  purine phosphorylase family 1  46.41 
 
 
238 aa  219  1.9999999999999999e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0539686  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0060  purine phosphorylases family protein 1  44.96 
 
 
239 aa  202  4e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0126  purine phosphorylases family protein 1  44.39 
 
 
242 aa  168  9e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1572  purine phosphorylases family protein 1  47.06 
 
 
222 aa  158  6e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0814  purine phosphorylase family protein 1  47.06 
 
 
221 aa  157  1e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1527  S-methyl-5-thioadenosine phosphorylase  37.04 
 
 
241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2318  purine or other phosphorylase family 1  35.94 
 
 
241 aa  152  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0603  purine phosphorylase family 1  45.81 
 
 
222 aa  151  8e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0567  Purine-nucleoside phosphorylase  37.38 
 
 
242 aa  146  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0606  purine-nucleoside phosphorylase  38.39 
 
 
236 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0610  purine phosphorylases family protein 1  44.12 
 
 
244 aa  142  7e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.807102  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2962  Purine-nucleoside phosphorylase  35.5 
 
 
242 aa  141  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266203  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2072  purine or other phosphorylase family 1  34.31 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0304  purine phosphorylase family 1  36.56 
 
 
262 aa  137  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06138  hypothetical protein  33.78 
 
 
243 aa  129  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2504  uridine phosphorylase  35.62 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0463  purine nucleoside phosphorylase  37.5 
 
 
233 aa  128  8.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0259121  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2947  purine nucleoside phosphorylase  35.59 
 
 
232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000334  N-Ribosylnicotinamide phosphorylase  36.36 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00958039  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2832  purine nucleoside phosphorylase  36.94 
 
 
235 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111726  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3108  purine nucleoside phosphorylase  37.22 
 
 
234 aa  126  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3654  uridine phosphorylase  35.86 
 
 
243 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0545  purine phosphorylase family 1  35.35 
 
 
244 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1793  purine nucleoside phosphorylase  32.87 
 
 
232 aa  121  8e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000806796  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1240  uridine phosphorylase  36.28 
 
 
290 aa  121  8e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.719216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1518  purine nucleoside phosphorylase  33.8 
 
 
235 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1344  purine nucleoside phosphorylase  33.33 
 
 
235 aa  119  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1863  purine nucleoside phosphorylase  33.33 
 
 
235 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0598  uridine phosphorylase  32.79 
 
 
275 aa  119  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1588  purine nucleoside phosphorylase  33.33 
 
 
235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0326912  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0092  purine nucleoside phosphorylase  32.88 
 
 
236 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1372  purine nucleoside phosphorylase  33.33 
 
 
235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.896759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1345  purine nucleoside phosphorylase  33.33 
 
 
235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1386  purine nucleoside phosphorylase  33.33 
 
 
235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1483  purine nucleoside phosphorylase  33.33 
 
 
235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0799  purine nucleoside phosphorylase  35.78 
 
 
234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.467388  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3827  purine nucleoside phosphorylase  33.33 
 
 
235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000284162 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1555  purine nucleoside phosphorylase  33.33 
 
 
235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000650002 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1624  purine nucleoside phosphorylase  33.33 
 
 
235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3488  purine phosphorylase family protein 1  34.34 
 
 
241 aa  118  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0602  purine nucleoside phosphorylase  33.79 
 
 
239 aa  118  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0824  purine nucleoside phosphorylase  33.79 
 
 
239 aa  118  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.02467  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2464  purine or other phosphorylase family 1  33.33 
 
 
278 aa  118  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2420  purine nucleoside phosphorylase  33.33 
 
 
236 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0295  purine nucleoside phosphorylase  31.25 
 
 
232 aa  118  9e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1497  purine nucleoside phosphorylase  32.44 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.153254  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0550  purine or other phosphorylase family 1  35.35 
 
 
244 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1187  purine nucleoside phosphorylase  32.87 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.562168  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3794  purine phosphorylases family protein 1  35.35 
 
 
244 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1318  purine nucleoside phosphorylase  31.47 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000021408  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1596  purine phosphorylases family protein 1  33.17 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0754  uridine phosphorylase  33.8 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0818347  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0083  purine nucleoside phosphorylase  33.04 
 
 
245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0506882  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1651  uridine phosphorylase  36.36 
 
 
258 aa  115  5e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4297  uridine phosphorylase, putative  34.85 
 
 
241 aa  115  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0004  uridine phosphorylase  34.38 
 
 
243 aa  115  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000523211  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1391  purine nucleoside phosphorylase  31.02 
 
 
235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000867516  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3449  purine nucleoside phosphorylase  33.79 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1652  purine nucleoside phosphorylase  30.56 
 
 
235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000543003  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0938  purine or other phosphorylase family 1  29.55 
 
 
275 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.686275 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0962  purine or other phosphorylase family 1  32.39 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0469  uridine phosphorylase  35 
 
 
261 aa  113  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0396786  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3375  purine nucleoside phosphorylase  33.79 
 
 
236 aa  113  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.284651 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1978  purine nucleoside phosphorylase  33.94 
 
 
234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331725  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6136  purine nucleoside phosphorylase  33.62 
 
 
235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3330  purine nucleoside phosphorylase  33.79 
 
 
241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0817178  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0828  purine-nucleoside phosphorylase  33.96 
 
 
243 aa  112  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1597  uridine phosphorylase  34.7 
 
 
261 aa  112  5e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.585092 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0963  purine or other phosphorylase family 1  32.26 
 
 
271 aa  112  6e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1837  uridine phosphorylase  34.25 
 
 
261 aa  112  6e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.748158 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1005  purine nucleoside phosphorylase  33.79 
 
 
236 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.622952  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3546  purine nucleoside phosphorylase  33.79 
 
 
236 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.799796  hitchhiker  0.000820133 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3495  purine nucleoside phosphorylase  31.51 
 
 
239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0127  purine nucleoside phosphorylase  33.67 
 
 
235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.391631  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0900  uridine phosphorylase  34.31 
 
 
238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.768164  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0976  purine nucleoside phosphorylase  33.79 
 
 
236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392055 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3624  purine nucleoside phosphorylase  31.51 
 
 
239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0122  purine nucleoside phosphorylase  33.67 
 
 
235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000853984  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1221  purine nucleoside phosphorylase  33.33 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1040  purine nucleoside phosphorylase  33.33 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.540297  hitchhiker  0.00000698922 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1105  purine nucleoside phosphorylase  33.33 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182057 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1044  purine nucleoside phosphorylase  33.33 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179251 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1831  uridine phosphorylase  31.6 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2812  purine nucleoside phosphorylase  33.33 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0651432  unclonable  0.00000308017 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0635  purine nucleoside phosphorylase  33.33 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04260  purine nucleoside phosphorylase  32.42 
 
 
239 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3614  purine nucleoside phosphorylase  32.42 
 
 
239 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4619  purine nucleoside phosphorylase  32.42 
 
 
239 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4931  purine nucleoside phosphorylase  32.42 
 
 
239 aa  110  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4137  uridine phosphorylase  34.03 
 
 
247 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04226  hypothetical protein  32.42 
 
 
239 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3672  purine nucleoside phosphorylase  32.42 
 
 
239 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.398843 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5899  purine nucleoside phosphorylase  32.42 
 
 
239 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4983  purine nucleoside phosphorylase  32.42 
 
 
239 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4933  purine nucleoside phosphorylase  32.42 
 
 
239 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857632  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2819  purine nucleoside phosphorylase  33.33 
 
 
236 aa  109  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1028  purine nucleoside phosphorylase  32.88 
 
 
236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.263223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>