136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1560 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1560  biotin/lipoate A/B protein ligase  100 
 
 		 344 aa  683    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0396798 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2086  biotin/lipoate A/B protein ligase  63.37 
 
 		 344 aa  448  1e-125  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  36.59 
 
 		 530 aa  199  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0931  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.22 
 
 		 343 aa  186  6e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000248179  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2206  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.78 
 
 		 360 aa  182  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2173  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.43 
 
 		 356 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.679039  decreased coverage  0.000000000726509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2545  lipoate-protein ligase A, putative  33.43 
 
 		 356 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0642  Lipoate--protein ligase  35.33 
 
 		 363 aa  176  5e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336498  normal  0.0925855 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1480  lipoate-protein ligase  32.5 
 
 		 364 aa  137  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.521497  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2034  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.98 
 
 		 366 aa  135  8e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1002  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.8 
 
 		 362 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  35.32 
 
 		 245 aa  116  6e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1053  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.53 
 
 		 357 aa  107  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1097  lipoate-protein ligase A family protein  25.56 
 
 		 276 aa  99.4  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.61 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  27.52 
 
 		 329 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  27.52 
 
 		 329 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  27.52 
 
 		 329 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  27.52 
 
 		 329 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  27.52 
 
 		 329 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  27.52 
 
 		 329 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.18 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3768  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.81 
 
 		 329 aa  95.1  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  27.52 
 
 		 329 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.52 
 
 		 329 aa  94.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.48 
 
 		 326 aa  94.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  25.47 
 
 		 326 aa  93.6  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  27.18 
 
 		 329 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  27.85 
 
 		 329 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.59 
 
 		 329 aa  93.2  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1514  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.08 
 
 		 261 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1006  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.85 
 
 		 329 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0882  lipoate-protein ligase A  28.17 
 
 		 329 aa  90.1  6e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.93 
 
 		 349 aa  90.1  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.49 
 
 		 329 aa  89.7  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1591  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.56 
 
 		 276 aa  89  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00744993  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1624  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.56 
 
 		 276 aa  89  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.997358  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1014  lipoate-protein ligase  28.06 
 
 		 329 aa  87.8  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00464071  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  30.36 
 
 		 349 aa  86.3  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1974  lipoate-protein ligase  28.24 
 
 		 332 aa  86.3  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1677  lipoate-protein ligase  27.68 
 
 		 337 aa  86.3  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0374805  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.86 
 
 		 261 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  28.51 
 
 		 257 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0616  lipoate-protein ligase A family protein  26.07 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0052  lipoate-protein ligase  29.55 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1086  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.3 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000389692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1108  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.3 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000525877  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0847  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.96 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.918447  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  25.85 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  26.38 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1542  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.21 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0449  lipoate-protein ligase  26.5 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0102299  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0682  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.06 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0153413  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11650  lipoate-protein ligase A  28.45 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2647  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  27.87 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.179015  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.26 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0980  lipoate-protein ligase A  31.22 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.28 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0881  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.91 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0333925  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1939  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.19 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  unclonable  0.000000010218 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0736  lipoate-protein ligase  26.98 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05080  lipoate-protein ligase  25.21 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.341449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.24 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1428  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.64 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.24 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1551  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  24.05 
 
 		 331 aa  75.9  0.0000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.23083  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0450  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.87 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  25.35 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1879  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.72 
 
 		 365 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459014 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1506  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.05 
 
 		 240 aa  72  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  24.43 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  24.43 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  24.43 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  24.43 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  24.43 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  24.43 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  24.43 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  24.43 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  24.43 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2379  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.67 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.35 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.05 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0399  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.9 
 
 		 266 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1701  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.32 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.407225  normal  0.0224551 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09720  lipoate-protein ligase A  27.5 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331543  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2894  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.16 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0224  lipoate-protein ligase  23.93 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0393  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.79 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.50261 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1549  CO dehydrogenase beta subunit/acetyl-CoA synthase epsilon subunit  19.8 
 
 		 667 aa  63.9  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1056  lipoate-protein ligase A  25.18 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0070  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.48 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0396  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.77 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2343  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.43 
 
 		 510 aa  60.5  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.855949  hitchhiker  0.000773035 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2721  lipoate-protein ligase A, putative  32.43 
 
 		 510 aa  60.5  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.966244  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0379  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  26.52 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2168  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.19 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00545206  hitchhiker  0.000000520925 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0376  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.7 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0386  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.7 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1172  Lipoate--protein ligase  25.1 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.260617 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1007  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.32 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.235088 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>