67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1558 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1558  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 355 aa  738    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0417812 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2088  Radical SAM domain protein  76.37 
 
 		 351 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0592  Radical SAM domain protein  36.69 
 
 		 371 aa  244  9.999999999999999e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000649486  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0445  radical SAM family protein  37.82 
 
 		 349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0644  Radical SAM domain protein  37.2 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.14053  normal  0.0928811 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2204  radical SAM domain protein  35.5 
 
 		 383 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2543  radical SAM domain protein  35.04 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2171  Radical SAM domain protein  35.04 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00159358  decreased coverage  0.000000000651126 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1052  Radical SAM domain protein  34.33 
 
 		 366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0919  Radical SAM domain protein  32.01 
 
 		 308 aa  162  1e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000116556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0705  radical SAM domain-containing protein  31.18 
 
 		 283 aa  151  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0681  radical SAM domain-containing protein  31.18 
 
 		 283 aa  149  7e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1520  Radical SAM domain protein  32.22 
 
 		 310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1508  radical SAM domain-containing protein  30.11 
 
 		 266 aa  125  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0962  radical SAM domain-containing protein  28.52 
 
 		 290 aa  115  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0912  radical SAM domain-containing protein  28.25 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0033  radical SAM domain-containing protein  24.92 
 
 		 296 aa  102  8e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.531209  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  29.25 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2823  biotin synthase  23.53 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  21.79 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  21.79 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0058  biotin synthase  24.29 
 
 		 334 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.618139 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  23.73 
 
 		 344 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 353 aa  50.1  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  25.24 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14871  biotin synthase  23.26 
 
 		 345 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.598492 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  25.74 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03970  biotin synthase, putative  23.39 
 
 		 388 aa  47.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.299072  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  22.13 
 
 		 350 aa  47.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  22.52 
 
 		 338 aa  46.6  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0655  biotin synthase  22.87 
 
 		 345 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.477951  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2885  Radical SAM domain protein  26.89 
 
 		 405 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806461  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  26.36 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2890  biotin synthase  24.49 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  24.43 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  20.68 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06643  biotin synthase (Eurofung)  21.63 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3644  biotin synthase  24.88 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4622  biotin synthase  23.91 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151493 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0719  biotin synthase  21.91 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2292  biotin synthase  22.08 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  20.36 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0838  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.78 
 
 		 365 aa  43.9  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.195743  normal  0.168484 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  21.69 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2846  biotin synthase  22.8 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.699161  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  22.8 
 
 		 359 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0057  Radical SAM domain protein  25.19 
 
 		 367 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.0888986 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 		 360 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0301  radical SAM family Fe-S protein  27.01 
 
 		 206 aa  43.9  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.239452  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  24.53 
 
 		 362 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  25 
 
 		 359 aa  43.5  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2934  biotin synthase  22.4 
 
 		 339 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2320  biotin synthase  22.4 
 
 		 339 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0133468  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2949  biotin synthase  22.4 
 
 		 339 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.992954 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6278  biotin synthase  22.4 
 
 		 340 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1662  radical SAM family Fe-S protein  30.38 
 
 		 327 aa  43.1  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  23.61 
 
 		 364 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46799  predicted protein  24.6 
 
 		 311 aa  43.1  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.970391 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  23.25 
 
 		 328 aa  43.1  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2983  biotin synthase  22.4 
 
 		 339 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1394  biotin synthase  23.79 
 
 		 333 aa  43.1  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.44 
 
 		 362 aa  43.1  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6661  radical SAM domain-containing protein  30.91 
 
 		 337 aa  42.7  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000604358  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11991  biotin synthase  23.24 
 
 		 335 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.496147  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12001  biotin synthase  23.24 
 
 		 314 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.678797  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  21.6 
 
 		 360 aa  42.7  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2197  radical SAM family protein  26.51 
 
 		 330 aa  42.7  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804971  normal  0.445705 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>