39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1550 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1550  DsrE family protein  100 
 
 		 133 aa  279  1e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2096  DsrE family protein  89.47 
 
 		 133 aa  251  2.0000000000000002e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0963  DsrE family protein  34.68 
 
 		 127 aa  83.6  7e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.153749  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1671  DsrE family protein  38.66 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0639  DsrE family protein  28.15 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0564243 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63360  hypothetical protein  27.05 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0926031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  27.27 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2176  hypothetical protein  27.78 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000345804 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2548  hypothetical protein  27.78 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2209  hypothetical protein  28.79 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0161912  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5517  hypothetical protein  27.27 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1286  hypothetical protein  31 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2643  DsrE family protein  27.27 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0166482  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2499  hypothetical protein  24.26 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.638714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1074  DsrE family protein  27.41 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000610155  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0966  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.41 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.498786  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  23.14 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0031  hypothetical protein  23.08 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000221456  normal  0.0655494 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2556  hypothetical protein  23.72 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177725  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2186  hypothetical protein  23.72 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0361535  hitchhiker  0.0000000354849 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  20.83 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1753  hypothetical protein  28.1 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1226  DsrE family protein  27.59 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.306048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0059  hypothetical protein  22.81 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0575  hypothetical protein  39.34 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000240912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3384  hypothetical protein  37.14 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1083  hypothetical protein  27.62 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.712894  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2900  DsrE family protein  27.48 
 
 		 129 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0037  hypothetical protein  22.22 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.151182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0039  hypothetical protein  22.75 
 
 		 169 aa  41.2  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000944942  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1840  hypothetical protein  22.22 
 
 		 170 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.381099  normal  0.11418 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0776  hypothetical protein  44.9 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0401032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1141  hypothetical protein  28.32 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1185  hypothetical protein  25.81 
 
 		 192 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.491301  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0884  DsrE family protein  26.55 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2326  hypothetical protein  22.16 
 
 		 169 aa  40.4  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.3184  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0123  hypothetical protein  21.3 
 
 		 169 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1961  hypothetical protein  22.16 
 
 		 169 aa  40  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000557384  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1244  hypothetical protein  27.27 
 
 		 122 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>