More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1513 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1513  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 
405 aa  832    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0963227  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0294  IS605 family transposase OrfB  46.57 
 
 
424 aa  367  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.414871  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0459  IS605 family transposase OrfB  44.72 
 
 
401 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1117  IS605 family transposase OrfB  42.4 
 
 
395 aa  311  2e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.148504  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2202  transposase, IS605 OrfB family  37.6 
 
 
417 aa  223  7e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2849  transposase, IS605 OrfB family  37.22 
 
 
402 aa  218  1e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3190  transposase, IS605 OrfB family  36.86 
 
 
429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2571  transposase, IS605 OrfB family  35.6 
 
 
413 aa  212  7.999999999999999e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0628  transposase, IS605 OrfB family  36.62 
 
 
411 aa  211  1e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2454  transposase, IS605 OrfB family  36.7 
 
 
395 aa  212  1e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.1066  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3651  IS605 family transposase OrfB  37.47 
 
 
380 aa  211  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166379  normal  0.432603 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3397  transposase, IS605 OrfB family  35.68 
 
 
407 aa  209  8e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2213  transposase IS605 OrfB family  35.12 
 
 
376 aa  206  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0601  transposase, IS605 OrfB family  36.64 
 
 
399 aa  206  8e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000137299  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2438  transposase, IS605 OrfB family  36.24 
 
 
391 aa  205  1e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.258594  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2156  transposase, IS605 OrfB family  36.2 
 
 
393 aa  204  2e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3927  transposase, IS605 OrfB family  34.06 
 
 
409 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.770218  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.45 
 
 
361 aa  204  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3051  transposase, IS605 OrfB family  34.91 
 
 
432 aa  202  6e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0812  transposase, IS605 OrfB family  35.04 
 
 
418 aa  202  6e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.639137  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2680  transposase, IS605 OrfB family  34.49 
 
 
413 aa  202  6e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.430379  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2549  transposase, IS605 OrfB family  35.54 
 
 
370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.735833  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2076  IS605 family transposase OrfB  35.42 
 
 
380 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0597  transposase, IS605 OrfB family  36.22 
 
 
374 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000997644  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2840  transposase, IS605 OrfB family  34.88 
 
 
413 aa  191  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.249005  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2633  transposase, IS605 OrfB family  35.81 
 
 
372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.56671  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2509  transposase, IS605 OrfB family  32.89 
 
 
421 aa  188  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0386  IS605 family transposase OrfB  32.05 
 
 
394 aa  187  3e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2314  transposase, IS605 OrfB family  32.73 
 
 
419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  33.88 
 
 
406 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2321  transposase, IS605 OrfB family  34.27 
 
 
374 aa  184  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3187  transposase, IS605 OrfB family  36.87 
 
 
380 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.742933 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2012  transposase, IS605 OrfB family  33.61 
 
 
362 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.27721  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  34.4 
 
 
370 aa  179  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0739  transposase, IS605 OrfB family  36.22 
 
 
380 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  32.91 
 
 
424 aa  178  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  33.6 
 
 
370 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2181  transposase, IS605 OrfB family  36.63 
 
 
380 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.538688 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  41.5 
 
 
403 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0285  IS891/IS1136/IS1341 transposase  31.84 
 
 
461 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.310253  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  34.5 
 
 
405 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3089  transposase, IS605 OrfB family  34.71 
 
 
406 aa  173  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.154586 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  32.45 
 
 
404 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1764  IS605 family transposase OrfB  37.05 
 
 
402 aa  172  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1629  IS605 family transposase OrfB  37.05 
 
 
402 aa  172  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2479  transposase, IS605 OrfB family  31.76 
 
 
388 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1563  IS605 family transposase OrfB  36.95 
 
 
402 aa  172  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0201  IS605 family transposase OrfB  31.2 
 
 
385 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000194492  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0388  IS891/IS1136/IS1341 transposase  33.7 
 
 
373 aa  170  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  33.15 
 
 
383 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  32.2 
 
 
404 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4972  IS891/IS1136/IS1341 transposase  32.84 
 
 
402 aa  169  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1199  transposase, IS605 OrfB family  35.07 
 
 
380 aa  169  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000673457  hitchhiker  0.00797435 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  33.15 
 
 
383 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  31.69 
 
 
363 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  32.35 
 
 
373 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4737  IS605 family transposase OrfB  37.39 
 
 
371 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0289  transposase, IS605 OrfB family  40.77 
 
 
380 aa  166  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3396  IS605 family transposase OrfB  36.71 
 
 
385 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000848869  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  33.33 
 
 
368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  32.79 
 
 
370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1657  transposase  38.37 
 
 
311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3231  putative transposase IS605 family  33.25 
 
 
411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.963843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0822  putative transposase IS605 family  33.25 
 
 
411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0682059 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  29.78 
 
 
381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  31.97 
 
 
403 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  31.97 
 
 
403 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  31.97 
 
 
403 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  31.97 
 
 
403 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  31.15 
 
 
363 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  31.49 
 
 
394 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  31.49 
 
 
394 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1464  transposase, IS605 OrfB family  31.15 
 
 
363 aa  162  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4234  IS605 family transposase OrfB  35.57 
 
 
299 aa  162  7e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00596003 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  30.85 
 
 
383 aa  162  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2754  transposase, IS605 OrfB family  31.15 
 
 
363 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  31.69 
 
 
403 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  33.42 
 
 
383 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0319  transposase  38.24 
 
 
304 aa  161  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.484329  normal  0.853888 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2858  transposase, IS605 OrfB family  30.97 
 
 
376 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.551858  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  33.42 
 
 
383 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  33.52 
 
 
383 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  33.42 
 
 
383 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  33.42 
 
 
383 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2736  transposase, IS605 OrfB family  35.83 
 
 
391 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.312474 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  29.74 
 
 
381 aa  160  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2689  transposase, IS605 OrfB family  31.15 
 
 
363 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0256  ISHa1675 transposase B  33.15 
 
 
413 aa  160  4e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1726  ISHa1675 transposase B  33.15 
 
 
413 aa  160  4e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.773087  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  31.69 
 
 
408 aa  160  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1254  ISHa1675 transposase B  33.15 
 
 
413 aa  160  4e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0163601  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  33.42 
 
 
383 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  33.42 
 
 
383 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0457  transposase, IS605 OrfB family  30.87 
 
 
363 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.196449 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  30.58 
 
 
395 aa  159  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0155  transposase, IS605 OrfB family  35.33 
 
 
466 aa  159  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565863  normal  0.100643 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1517  transposase, IS605 OrfB family  40.77 
 
 
371 aa  159  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  32.25 
 
 
370 aa  159  8e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3850  transposase, IS605 OrfB family  30.87 
 
 
363 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104951  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3554  transposase, IS605 OrfB family  30.87 
 
 
363 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>