More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1512 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  100 
 
 		 467 aa  928    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  66.09 
 
 		 471 aa  619  1e-176  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  45.09 
 
 		 459 aa  356  5.999999999999999e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2879  General substrate transporter  44.73 
 
 		 465 aa  333  3e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  41.48 
 
 		 469 aa  327  3e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  40.34 
 
 		 477 aa  318  1e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1618  major facilitator transporter  42.34 
 
 		 458 aa  301  1e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0727  phosphate transporter  41.56 
 
 		 442 aa  297  3e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0831  putative iorganic phosphate transporter  41.56 
 
 		 442 aa  296  6e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0471  putative iorganic phosphate transporter  41.33 
 
 		 441 aa  290  4e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1718  phosphate transporter  41.33 
 
 		 443 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.140032  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03960  phosphate transporter, putative  37.33 
 
 		 555 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.362408  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82453  inorganic phosphate transporter, transmembrane protein  33 
 
 		 555 aa  244  1.9999999999999999e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.10716  normal  0.589163 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0866  general substrate transporter  39.02 
 
 		 458 aa  241  2.9999999999999997e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.580989  normal  0.629225 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  31.78 
 
 		 476 aa  227  4e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1434  General substrate transporter  33.26 
 
 		 460 aa  207  3e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0846  general substrate transporter  33.05 
 
 		 442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1598  general substrate transporter  32.97 
 
 		 456 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0615669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  31.24 
 
 		 471 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0426  major facilitator transporter  32.98 
 
 		 452 aa  186  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  31.1 
 
 		 465 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 		 465 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 427 aa  169  8e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1265  General substrate transporter  29.3 
 
 		 451 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  29.29 
 
 		 458 aa  164  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  29.29 
 
 		 458 aa  164  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 423 aa  159  8e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  28.6 
 
 		 463 aa  153  8e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  31.36 
 
 		 477 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  27.31 
 
 		 446 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39515  predicted protein  27.71 
 
 		 623 aa  140  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 451 aa  140  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  25 
 
 		 443 aa  139  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  27.4 
 
 		 499 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 474 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  25 
 
 		 443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  25 
 
 		 443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  25 
 
 		 443 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  25 
 
 		 443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  25 
 
 		 443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  28.51 
 
 		 455 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  25 
 
 		 443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4244  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 467 aa  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  27.93 
 
 		 455 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0341  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 508 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  28.77 
 
 		 457 aa  132  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  25.11 
 
 		 468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  25.11 
 
 		 468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  24.95 
 
 		 447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  24.89 
 
 		 468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  28.18 
 
 		 476 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  24.89 
 
 		 468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  24.89 
 
 		 468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  24.95 
 
 		 451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17265  predicted protein  27.23 
 
 		 663 aa  131  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.98 
 
 		 472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 434 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 479 aa  130  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  26.36 
 
 		 445 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 467 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  26.46 
 
 		 464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  25.86 
 
 		 452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  27.59 
 
 		 452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  28.76 
 
 		 459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46692  predicted protein  27.36 
 
 		 566 aa  129  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 474 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  27.47 
 
 		 478 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  26.08 
 
 		 438 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 473 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 474 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 474 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  26.51 
 
 		 399 aa  123  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 467 aa  123  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  27.39 
 
 		 478 aa  123  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  27.39 
 
 		 478 aa  123  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  27.39 
 
 		 478 aa  123  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  27.39 
 
 		 478 aa  123  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 467 aa  123  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 441 aa  123  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  26.64 
 
 		 453 aa  123  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 474 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  26.77 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  27.03 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  27.03 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  26.77 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  27.03 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  27.03 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.58 
 
 		 474 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  27.39 
 
 		 478 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  26.51 
 
 		 399 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  26.77 
 
 		 399 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  27.18 
 
 		 478 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  28.53 
 
 		 438 aa  121  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>