154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1391 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1391  deoxyUTP pyrophosphatase  100 
 
 
159 aa  328  2e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.45866  unclonable  0.000000274623 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0746  deoxycytidine triphosphate deaminase (dcD-2)  58.97 
 
 
159 aa  203  9e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0671531  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0151  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.33 
 
 
172 aa  87.4  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00954201 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1825  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.14 
 
 
176 aa  86.3  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0453985  decreased coverage  0.0000000000000312471 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1293  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.14 
 
 
176 aa  84.7  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2075  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.62 
 
 
176 aa  83.6  9e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0523695 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1171  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.51 
 
 
196 aa  82  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.165857  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0140  deoxycytidine triphosphate deaminase  39.1 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1021  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.34 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0208189 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0525  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.32 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3391  hypothetical protein  31.21 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60120  putative deoxycytidine deaminase  28.99 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000424193  hitchhiker  0.0000000073225 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0561  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.57 
 
 
177 aa  61.6  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2832  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.51 
 
 
182 aa  60.8  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288402  normal  0.526357 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0744  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.51 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00363492  hitchhiker  0.00401854 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1297  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.62 
 
 
186 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0559  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.56 
 
 
186 aa  57  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1566  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.57 
 
 
186 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000380625  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1529  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.01 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2308  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.87 
 
 
186 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0910  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  36.11 
 
 
170 aa  55.1  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0187783  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0445  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.82 
 
 
203 aa  54.7  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.272127  normal  0.513401 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1484  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.88 
 
 
186 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1309  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.88 
 
 
186 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1302  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.45 
 
 
186 aa  54.3  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1129  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  31.48 
 
 
177 aa  53.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297941  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0767  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.92 
 
 
187 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0102509  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0827  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.39 
 
 
180 aa  53.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119841  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01700  dCTP deaminase  29.01 
 
 
182 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35480  dCTP deaminase  26.83 
 
 
191 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0890  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.28 
 
 
191 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1552  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.85 
 
 
190 aa  52.8  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0147  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.55 
 
 
194 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1249  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.66 
 
 
179 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0415  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  28.3 
 
 
170 aa  52  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.054799  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2714  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.36 
 
 
195 aa  52.4  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0448  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.28 
 
 
191 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.468429  normal  0.993437 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0752  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  34.21 
 
 
171 aa  51.6  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0123121 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0430  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.15 
 
 
186 aa  51.2  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2932  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.92 
 
 
196 aa  50.8  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0882  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.59 
 
 
183 aa  50.8  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0216441  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0085  dUTPase  31.11 
 
 
163 aa  50.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2046  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.11 
 
 
194 aa  50.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.416857  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0394  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  27.67 
 
 
170 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000865558  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4541  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.15 
 
 
196 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_358  deoxyuridine 5-prime-triphosphate nucleotidohydrolase, dUTP pyrophosphatase  27.85 
 
 
170 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000735952  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2616  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.46 
 
 
193 aa  49.7  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4349  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.49 
 
 
199 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.756279  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0021  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.97 
 
 
196 aa  49.7  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324355  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1658  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.46 
 
 
193 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1733  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.46 
 
 
193 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00151185  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1763  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.46 
 
 
193 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0121906  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2112  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.42 
 
 
191 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.24843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0244  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.79 
 
 
191 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2217  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.46 
 
 
193 aa  49.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5912  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.7 
 
 
196 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3664  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.27 
 
 
191 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2243  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.14 
 
 
194 aa  48.9  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19090  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.67 
 
 
188 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0211916 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1477  dCTP deaminase  28.31 
 
 
178 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1646  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.67 
 
 
188 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3823  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.81 
 
 
192 aa  48.9  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2412  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.71 
 
 
200 aa  48.9  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25230  deoxycytidine triphosphate deaminase  23.78 
 
 
197 aa  48.5  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.493678  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1576  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.11 
 
 
194 aa  48.5  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2462  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.36 
 
 
193 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000265475  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4243  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.49 
 
 
191 aa  47.8  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2455  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.36 
 
 
193 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000233187  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0292  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.33 
 
 
145 aa  47.8  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.21459  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2575  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.36 
 
 
193 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.109993  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1889  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.36 
 
 
193 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.0428491 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1008  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.13 
 
 
185 aa  47.8  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216038  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1186  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.78 
 
 
184 aa  47.8  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.33 
 
 
201 aa  47.4  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0097  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  26.88 
 
 
157 aa  47.4  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  26.53 
 
 
194 aa  47.4  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.767695  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2441  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.83 
 
 
194 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.145517 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0146  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.06 
 
 
184 aa  47  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0395  2-deoxycytidine 5-triphosphate deaminase  32.04 
 
 
193 aa  47  0.0001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.610625  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1408  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.37 
 
 
188 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.390363  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26270  deoxycytidine triphosphate deaminase  22.52 
 
 
194 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3880  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.04 
 
 
188 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8794  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.77 
 
 
216 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.022766  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1470  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.11 
 
 
199 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1100  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.27 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3189  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.16 
 
 
191 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4412  deoxycytidine triphosphate deaminase  24.36 
 
 
191 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491521  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0075  dCTP deaminase  24.75 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0143028 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0554  deoxycytidine triphosphate deaminase  24.75 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.059854  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1140  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.27 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0341669  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1785  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.78 
 
 
188 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000678653  normal  0.0149108 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0239  deoxycytidine triphosphate deaminase  25 
 
 
201 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.588762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4312  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.27 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2679  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.7 
 
 
193 aa  45.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18990  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.35 
 
 
193 aa  45.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.27567  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0053  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.47 
 
 
188 aa  45.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1043  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.98 
 
 
207 aa  45.1  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000608448  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3877  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.67 
 
 
193 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1700  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.5 
 
 
191 aa  45.4  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000175213  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0993  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.39 
 
 
185 aa  44.7  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>