234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1346 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1346  major facilitator transporter  100 
 
 		 382 aa  747    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.217122  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2110  major facilitator superfamily MFS_1  65.75 
 
 		 371 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0505965  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0852  major facilitator transporter  43.86 
 
 		 380 aa  267  2e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.498161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0504  major facilitator transporter  40.36 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 424 aa  126  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  29.17 
 
 		 429 aa  125  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 424 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 430 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 437 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 437 aa  124  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 436 aa  122  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 436 aa  122  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 441 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 437 aa  121  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 432 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  31.83 
 
 		 436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 437 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  26.98 
 
 		 447 aa  113  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  27.32 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 443 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 416 aa  104  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 431 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 444 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2503  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 436 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 408 aa  97.8  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1924  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 458 aa  97.8  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  26.87 
 
 		 441 aa  97.1  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 		 432 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 		 432 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  24 
 
 		 432 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 439 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 428 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  25.07 
 
 		 438 aa  94.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 		 416 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 433 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 430 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  24.86 
 
 		 443 aa  90.1  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  25 
 
 		 430 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 421 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 438 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 429 aa  89  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  27.12 
 
 		 447 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3800  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 446 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 425 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 421 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0674  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 417 aa  86.3  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201376  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0879  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  21.94 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6027  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 447 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.246055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  24.82 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.886987 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  24.51 
 
 		 441 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  23.7 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 418 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  22.75 
 
 		 450 aa  79.7  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  23.4 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1366  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 419 aa  76.3  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  24.79 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  24.79 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  24.79 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  25.97 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  24.52 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  23.65 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  24.52 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  24.52 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  24.52 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  24.52 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  23.75 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  22.6 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  22.99 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  23.99 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  26.1 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  26.1 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  21.82 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2490  oxalate/formate antiporter, putative  24.81 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>