20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1324 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1324  flagella assembly protein J-like protein  100 
 
 		 475 aa  940    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000149145  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0127  Type II secretion system F domain protein  44.71 
 
 		 473 aa  402  1e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.366598  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1964  flagellar assembly protein J  24.09 
 
 		 517 aa  96.7  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.607678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0353  flagellar assembly protein J  22.78 
 
 		 539 aa  83.6  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.584912  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1575  flagellar assembly protein J  20.84 
 
 		 551 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00843715  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  19.58 
 
 		 574 aa  64.7  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0996  flagellar assembly protein J  19.16 
 
 		 558 aa  63.2  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.448004  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  18.14 
 
 		 581 aa  60.8  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0976  flagellar assembly protein J  19.21 
 
 		 558 aa  60.1  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.73678  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1731  flagellar assembly protein J  18.3 
 
 		 558 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.8602  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3411  Type II secretion system F domain protein  19.95 
 
 		 577 aa  57.8  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  19.7 
 
 		 582 aa  58.2  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0949  flagellar assembly protein J  17.73 
 
 		 558 aa  57.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0105  flagellar assembly protein J  21.51 
 
 		 534 aa  57.4  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.461814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1317  Type II secretion system F domain protein  17.96 
 
 		 554 aa  56.6  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.89339  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1341  flagellar assembly protein J  19.42 
 
 		 546 aa  55.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279936 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  18.06 
 
 		 578 aa  54.3  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0268  flagellar assembly protein J  19.58 
 
 		 558 aa  52.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.439303  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1861  flagellar assembly protein J  18.58 
 
 		 545 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0948  flagellar assembly protein J  20.98 
 
 		 532 aa  43.5  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0756318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>