More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1312 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 450 aa  873    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  55.61 
 
 		 459 aa  481  1e-134  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  31.52 
 
 		 526 aa  182  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  27.85 
 
 		 492 aa  123  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  27.85 
 
 		 492 aa  123  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 492 aa  123  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  31.65 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  30.17 
 
 		 479 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  30.17 
 
 		 479 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  28.01 
 
 		 475 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 		 490 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  26.24 
 
 		 483 aa  99.8  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  28.03 
 
 		 484 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  28.49 
 
 		 485 aa  97.8  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  30.3 
 
 		 487 aa  97.1  6e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  30.3 
 
 		 482 aa  96.3  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 		 495 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  25.44 
 
 		 495 aa  94  5e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  28.62 
 
 		 467 aa  92  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1984  amino acid permease-associated region  27.06 
 
 		 468 aa  89  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  28.06 
 
 		 443 aa  88.6  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 501 aa  87.8  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  24.75 
 
 		 442 aa  86.7  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 497 aa  86.7  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1492  amino acid transporter  24.59 
 
 		 447 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.0000000000000168224 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  26.01 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  27.06 
 
 		 487 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  28.38 
 
 		 484 aa  86.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6094  amino acid permease-associated region  26.3 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1513  amino acid transporter  24.36 
 
 		 447 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.490527  hitchhiker  0.0000000124915 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  25.48 
 
 		 506 aa  85.5  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1476  amino acid transporter  24.19 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202307  normal  0.161402 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1792  amino acid transporter  24.36 
 
 		 447 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000593149  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  27.88 
 
 		 485 aa  84  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  26.32 
 
 		 516 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  26.16 
 
 		 493 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  26.7 
 
 		 510 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  26.7 
 
 		 510 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  26.7 
 
 		 510 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  25.98 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1963  amino acid transporter  23.65 
 
 		 447 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.041678  hitchhiker  0.00000000765672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  25.99 
 
 		 513 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  27.14 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  26.32 
 
 		 510 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  30.12 
 
 		 497 aa  79.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  24.91 
 
 		 464 aa  79.7  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  27.49 
 
 		 463 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1819  amino acid permease-associated region  26.45 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.757233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  28 
 
 		 509 aa  77  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  27.06 
 
 		 462 aa  74.7  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  24.26 
 
 		 486 aa  75.1  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  26.71 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  26.71 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  26.71 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3068  amino acid permease-associated region  29.23 
 
 		 506 aa  73.6  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3425  amino acid permease-associated region  24.48 
 
 		 456 aa  73.6  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1373  amino acid permease-associated region  26.51 
 
 		 484 aa  73.2  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0348286 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6016  amino acid permease-associated region  26.28 
 
 		 463 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  24.09 
 
 		 474 aa  73.2  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  26.26 
 
 		 488 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  25.36 
 
 		 510 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  26.61 
 
 		 490 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  26.71 
 
 		 516 aa  72.4  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3079  amino acid permease-associated region  25.25 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1182  amino acid permease-associated region  28.47 
 
 		 472 aa  70.9  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.616059 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2573  amino acid permease-associated region  23.16 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 527 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  24.64 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  23.56 
 
 		 455 aa  70.5  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 		 455 aa  70.1  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  25.06 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  25.08 
 
 		 453 aa  69.7  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2586  amino acid ABC transporter permease  23.47 
 
 		 470 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163018  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3067  amino acid permease-associated region  26.45 
 
 		 498 aa  69.7  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3130  amino acid permease-associated region  23.47 
 
 		 460 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3252  amino acid permease-associated region  23.47 
 
 		 464 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal  0.223004 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  25.06 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  25.36 
 
 		 509 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3528  amino acid permease-associated region  23.76 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2641  amino acid permease family protein  25 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000039324 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4371  amino acid permease-associated region  23.76 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670873  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1318  amino acid transporter  22.52 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00693769  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3995  amino acid permease-associated region  23.76 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140691  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6959  amino acid permease-associated region  22.2 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1529  amino acid permease-associated region  22.2 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327796  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 		 485 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  23.13 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6300  amino acid permease-associated region  22.2 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.819384 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  22.73 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0250  amino acid permease-associated region  26.97 
 
 		 466 aa  67.8  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.4961 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  24.22 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  27.4 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1945  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0388376  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  27.9 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  24.49 
 
 		 449 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1629  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 		 485 aa  67  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2988  amino acid permease family protein  24.84 
 
 		 428 aa  67  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.013802  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  23.28 
 
 		 461 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  23.06 
 
 		 461 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3213  amino acid permease family protein  24.84 
 
 		 428 aa  67  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>