261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1310 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  100 
 
 
216 aa  440  1e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  37.8 
 
 
226 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  38.86 
 
 
237 aa  129  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  37.32 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  35.41 
 
 
227 aa  123  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  40.57 
 
 
209 aa  121  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2262  cyclase family protein  33.94 
 
 
236 aa  121  9e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  37.26 
 
 
226 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  35.89 
 
 
213 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  35.89 
 
 
213 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  30.48 
 
 
215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  35.85 
 
 
210 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  32.86 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  31.9 
 
 
213 aa  116  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  29.49 
 
 
216 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  34.74 
 
 
210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  30.43 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  34.55 
 
 
220 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  30.52 
 
 
212 aa  107  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0623  cyclase family protein  34.39 
 
 
220 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  29.61 
 
 
201 aa  103  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  28.97 
 
 
219 aa  103  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0641  cyclase, putative  36.49 
 
 
208 aa  102  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0675  cyclase, putative  36.49 
 
 
208 aa  102  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  29.31 
 
 
238 aa  102  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  33.33 
 
 
207 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  34.1 
 
 
209 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  33.65 
 
 
215 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  31.02 
 
 
291 aa  99.8  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  26.07 
 
 
214 aa  99  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  30.48 
 
 
213 aa  98.6  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1418  cyclase family protein  33.33 
 
 
205 aa  98.2  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0662308  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  30.73 
 
 
214 aa  98.2  9e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  29.09 
 
 
377 aa  98.2  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0059  cyclase family protein  31.6 
 
 
213 aa  97.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  27.63 
 
 
237 aa  96.7  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  30.56 
 
 
222 aa  97.4  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  31.46 
 
 
213 aa  96.3  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  30.99 
 
 
216 aa  96.3  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  29.46 
 
 
272 aa  95.9  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  32.26 
 
 
215 aa  96.3  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  30.83 
 
 
264 aa  95.9  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  28.91 
 
 
217 aa  95.9  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  32.24 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  27.19 
 
 
275 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  27.19 
 
 
275 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  30.14 
 
 
223 aa  93.2  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  29.44 
 
 
210 aa  92.8  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  29.47 
 
 
215 aa  92.8  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_581  cyclase  31.94 
 
 
209 aa  92.4  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  31.46 
 
 
204 aa  92.4  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  29.41 
 
 
219 aa  92.4  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0669  hypothetical protein  31.6 
 
 
176 aa  92  6e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  29.2 
 
 
261 aa  91.7  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  31.34 
 
 
216 aa  91.7  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  31.22 
 
 
280 aa  91.7  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  24.88 
 
 
213 aa  90.9  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0711  cyclase, putative  28.97 
 
 
255 aa  89.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.442327  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1966  putative cyclase  26.54 
 
 
213 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0789774  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  28.04 
 
 
209 aa  89.4  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2577  cyclase family protein  26.54 
 
 
213 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  29.44 
 
 
210 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  31.92 
 
 
205 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  28.04 
 
 
221 aa  87.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  28.5 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  28.97 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  28.5 
 
 
210 aa  87  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  32.23 
 
 
210 aa  86.7  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0140  cyclase family protein  29.6 
 
 
264 aa  86.7  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  28.5 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  28.5 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  31.06 
 
 
280 aa  86.7  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2301  putative cyclase  32.09 
 
 
217 aa  86.3  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.285068  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2601  arylformamidase  26.07 
 
 
213 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  28.5 
 
 
210 aa  85.9  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5908  putative cyclase  27.23 
 
 
213 aa  85.5  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  28.5 
 
 
210 aa  85.9  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  28.7 
 
 
217 aa  85.5  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2625  cyclase family protein  26.07 
 
 
213 aa  85.5  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  28.5 
 
 
210 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  33.49 
 
 
205 aa  85.5  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0720  arylformamidase  27.7 
 
 
213 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  28.97 
 
 
209 aa  84  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  28.97 
 
 
209 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0353  cyclase, putative  27.92 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  28.23 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  28.97 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  31.6 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1055  cyclase, putative  27.92 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  28.97 
 
 
209 aa  84  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0100  arylformamidase  27.92 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0282167  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  26.64 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0652  arylformamidase  27.92 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.228367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2487  arylformamidase  27.92 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  28.5 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0894  arylformamidase  26.89 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.329738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  28.99 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0897  arylformamidase  26.79 
 
 
242 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102698  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  31.12 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  31.12 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>