248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1219 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  100 
 
 
390 aa  797    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  70.15 
 
 
396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  33.92 
 
 
407 aa  196  6e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  33.92 
 
 
433 aa  188  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  33.67 
 
 
444 aa  186  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  33.33 
 
 
437 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  33.42 
 
 
441 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  35.44 
 
 
407 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  33.66 
 
 
430 aa  178  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  32.38 
 
 
455 aa  176  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  31.67 
 
 
413 aa  173  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  32 
 
 
430 aa  172  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  31.46 
 
 
426 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  32.08 
 
 
431 aa  170  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  34.39 
 
 
412 aa  169  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  33.17 
 
 
407 aa  169  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  31.94 
 
 
405 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  33.5 
 
 
408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  33.5 
 
 
408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  31.55 
 
 
438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  33.5 
 
 
408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  30.96 
 
 
459 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  33.93 
 
 
402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  33.33 
 
 
423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  31.55 
 
 
431 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  32.68 
 
 
416 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  33.17 
 
 
445 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  32.52 
 
 
411 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  32.78 
 
 
434 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  32.36 
 
 
429 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  31.08 
 
 
470 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  32.85 
 
 
419 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  32.45 
 
 
421 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  32.04 
 
 
403 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  31.58 
 
 
404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  31.52 
 
 
407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  31.54 
 
 
413 aa  153  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  32.26 
 
 
414 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  32.31 
 
 
400 aa  152  8.999999999999999e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  31.09 
 
 
401 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  32.75 
 
 
423 aa  149  8e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  30.22 
 
 
421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  33.61 
 
 
408 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  30.4 
 
 
440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  29.34 
 
 
433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  32.48 
 
 
391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  30.85 
 
 
426 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  30.07 
 
 
417 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  30.07 
 
 
417 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  30.07 
 
 
417 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  31.17 
 
 
433 aa  146  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  30.94 
 
 
413 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  29.73 
 
 
420 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  30.71 
 
 
413 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  31.36 
 
 
411 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  28.4 
 
 
426 aa  144  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  29.66 
 
 
402 aa  144  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  31.37 
 
 
419 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  31.13 
 
 
419 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  29.95 
 
 
413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  31.63 
 
 
417 aa  139  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  30.08 
 
 
445 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  30 
 
 
424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0293  amidohydrolase  27.25 
 
 
415 aa  137  4e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.356604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  31.55 
 
 
425 aa  137  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  30.34 
 
 
478 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  33.33 
 
 
426 aa  136  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  30.3 
 
 
436 aa  136  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  31.95 
 
 
431 aa  135  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  27.83 
 
 
428 aa  135  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  31.22 
 
 
480 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  31.2 
 
 
415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  31.16 
 
 
421 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  29.26 
 
 
444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  29.65 
 
 
410 aa  134  3.9999999999999996e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  30.41 
 
 
456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  29.9 
 
 
432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  28.32 
 
 
443 aa  130  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  32.04 
 
 
411 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  30.38 
 
 
414 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  28.92 
 
 
415 aa  130  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  30.08 
 
 
405 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  30.87 
 
 
412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  29.72 
 
 
419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  32.56 
 
 
428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  29.47 
 
 
445 aa  129  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  32.36 
 
 
393 aa  129  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  29.47 
 
 
412 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  30.83 
 
 
403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  29.68 
 
 
444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  28.57 
 
 
434 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  28.77 
 
 
447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  31.16 
 
 
405 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  28.25 
 
 
432 aa  126  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  29.55 
 
 
412 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  30.73 
 
 
411 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  28.09 
 
 
433 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  29.81 
 
 
448 aa  124  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  29.67 
 
 
461 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  28.33 
 
 
440 aa  123  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>