More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1197 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1197  type II secretion system protein E  100 
 
 		 483 aa  976    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.585907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  33.83 
 
 		 519 aa  211  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  32.38 
 
 		 671 aa  187  5e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  30.02 
 
 		 473 aa  186  6e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  31.69 
 
 		 577 aa  180  5.999999999999999e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  30.49 
 
 		 572 aa  176  8e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  28.09 
 
 		 583 aa  176  8e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  28.01 
 
 		 991 aa  168  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  30.69 
 
 		 476 aa  165  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 510 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  28.03 
 
 		 547 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  31.4 
 
 		 682 aa  164  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  27.48 
 
 		 545 aa  162  9e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  28.11 
 
 		 749 aa  162  9e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  29.27 
 
 		 797 aa  162  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  29.91 
 
 		 513 aa  159  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  28.46 
 
 		 556 aa  158  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  27.97 
 
 		 692 aa  158  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  28.67 
 
 		 654 aa  157  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  27.92 
 
 		 558 aa  157  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  31.25 
 
 		 515 aa  155  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  28.19 
 
 		 791 aa  155  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  29.37 
 
 		 622 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  31.49 
 
 		 609 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  28.57 
 
 		 617 aa  150  6e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  30.72 
 
 		 512 aa  149  9e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  27.4 
 
 		 610 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  28.23 
 
 		 549 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  32.15 
 
 		 1255 aa  146  6e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  29.04 
 
 		 549 aa  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  27.42 
 
 		 722 aa  145  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  27.12 
 
 		 542 aa  144  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  27.7 
 
 		 604 aa  143  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  28.61 
 
 		 551 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  32.13 
 
 		 847 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  28.34 
 
 		 628 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  28.86 
 
 		 618 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  26.49 
 
 		 640 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  34.52 
 
 		 492 aa  139  8.999999999999999e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  30.82 
 
 		 1319 aa  139  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  28.01 
 
 		 620 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  29.09 
 
 		 831 aa  138  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  31.15 
 
 		 1335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  30.42 
 
 		 489 aa  137  6.0000000000000005e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  34.19 
 
 		 492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  27.58 
 
 		 591 aa  134  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  36.33 
 
 		 491 aa  131  3e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  28.85 
 
 		 559 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  31.7 
 
 		 612 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  27.3 
 
 		 557 aa  128  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  26.4 
 
 		 557 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  26.97 
 
 		 547 aa  126  7e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  27.32 
 
 		 557 aa  126  8.000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  26.76 
 
 		 557 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  28.57 
 
 		 770 aa  125  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0031  type II secretion system protein E  25.94 
 
 		 494 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1756  type II secretion system protein E  27.68 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.161423 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  27.01 
 
 		 546 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  29.17 
 
 		 552 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1252  type II secretion system protein E  31.68 
 
 		 435 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.877808  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  26.69 
 
 		 546 aa  110  6e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5826  type II secretion system protein E  30.77 
 
 		 438 aa  110  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  27.01 
 
 		 546 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  26.69 
 
 		 546 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  24.59 
 
 		 549 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  28.24 
 
 		 548 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1034  type II secretion system protein E  29.18 
 
 		 450 aa  108  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  28.8 
 
 		 553 aa  108  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  28.8 
 
 		 553 aa  108  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  28.8 
 
 		 553 aa  108  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  28.8 
 
 		 553 aa  108  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  25.82 
 
 		 543 aa  107  4e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  30.65 
 
 		 552 aa  107  5e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2151  type II secretion system protein E  28.3 
 
 		 494 aa  107  5e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1033  type II secretion system protein E  31.67 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  31.76 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0477  type II secretion system protein E  31.1 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0012388  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  29.19 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0554  type II secretion system protein E  25.89 
 
 		 439 aa  104  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07500  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  31.17 
 
 		 408 aa  104  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0856  type II secretion system protein E  27.85 
 
 		 411 aa  103  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  31.46 
 
 		 390 aa  103  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1739  type II secretion system protein E  29.93 
 
 		 414 aa  103  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1070  type II secretion system protein E  28.4 
 
 		 494 aa  103  6e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0779  type II secretion system protein E  30.5 
 
 		 435 aa  103  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  30.69 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2488  type II secretion system protein E  28.68 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273965 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  27.66 
 
 		 504 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0120  type II/IV secretion system protein  35.32 
 
 		 358 aa  102  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0027  type II secretion system protein E  27.95 
 
 		 494 aa  102  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00644516 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  30.71 
 
 		 463 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  29.02 
 
 		 491 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  29.71 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  31.18 
 
 		 483 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0195  type II secretion system protein E  28.44 
 
 		 650 aa  101  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.617369 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  29.51 
 
 		 311 aa  101  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  31.4 
 
 		 467 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  27.46 
 
 		 477 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  28.14 
 
 		 480 aa  101  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  29.86 
 
 		 472 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>