More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1092 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  100 
 
 
288 aa  588  1e-167  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2191  Pirin domain protein  58.45 
 
 
292 aa  337  9.999999999999999e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1247  pirin domain-containing protein  51.53 
 
 
306 aa  282  4.0000000000000003e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.466295  hitchhiker  0.00358039 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1469  pirin domain-containing protein  49.48 
 
 
298 aa  264  2e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  47.65 
 
 
309 aa  257  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  48.97 
 
 
299 aa  256  3e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  47.65 
 
 
309 aa  255  6e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  49.13 
 
 
296 aa  254  9e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1007  Pirin domain protein  45.64 
 
 
286 aa  250  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3449  pirin domain-containing protein  46.69 
 
 
302 aa  244  9e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  45.39 
 
 
301 aa  242  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  47.87 
 
 
286 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  47.1 
 
 
279 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  43.21 
 
 
289 aa  238  6.999999999999999e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  47.16 
 
 
286 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  46.29 
 
 
286 aa  235  7e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  43.67 
 
 
303 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  42.76 
 
 
302 aa  233  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  43.62 
 
 
303 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  44.76 
 
 
282 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  45.91 
 
 
283 aa  232  6e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  44.33 
 
 
303 aa  231  7.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  43.34 
 
 
290 aa  231  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  42.41 
 
 
285 aa  224  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0684  pirin domain-containing protein  40 
 
 
302 aa  223  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00758399  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  44.84 
 
 
280 aa  223  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  42.55 
 
 
283 aa  222  4.9999999999999996e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  42.45 
 
 
285 aa  221  8e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  44.01 
 
 
283 aa  221  8e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  41.12 
 
 
301 aa  221  9e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0101  Pirin domain protein  41.95 
 
 
300 aa  221  9e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  42.25 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  40.28 
 
 
287 aa  219  6e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  43.62 
 
 
294 aa  216  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  44.68 
 
 
284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  45.03 
 
 
303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  43.75 
 
 
303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  41.75 
 
 
294 aa  216  4e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  41.2 
 
 
285 aa  216  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  39.74 
 
 
312 aa  216  5e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  41.16 
 
 
298 aa  215  8e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  41.43 
 
 
284 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  40.85 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  41.69 
 
 
310 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  42.14 
 
 
284 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  41.16 
 
 
298 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  41.46 
 
 
293 aa  210  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  40.82 
 
 
298 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  41.32 
 
 
307 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  40.64 
 
 
304 aa  209  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0555  Pirin domain protein  40.46 
 
 
302 aa  209  5e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4026  Pirin domain protein  39.79 
 
 
278 aa  209  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  40.21 
 
 
285 aa  208  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  41.75 
 
 
290 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  41.75 
 
 
290 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1678  Pirin domain protein  40.78 
 
 
282 aa  205  7e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  40.21 
 
 
299 aa  205  8e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2756  Pirin domain protein  39.22 
 
 
279 aa  205  9e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  39.58 
 
 
284 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  40.42 
 
 
299 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  40.86 
 
 
283 aa  203  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  38.81 
 
 
284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  42.03 
 
 
274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  38.16 
 
 
277 aa  195  7e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  39.06 
 
 
289 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  37.89 
 
 
279 aa  192  5e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1025  Pirin domain protein  38.52 
 
 
283 aa  189  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  42.18 
 
 
318 aa  188  7e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  40.54 
 
 
290 aa  186  4e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  39.07 
 
 
288 aa  185  8e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  39.38 
 
 
288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0616  pirin  39.65 
 
 
293 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  39.29 
 
 
290 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  39.29 
 
 
290 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  39.29 
 
 
290 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  38.35 
 
 
290 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4604  Pirin domain protein  37.37 
 
 
331 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0130352  hitchhiker  0.0000248585 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1464  Pirin domain protein  38.25 
 
 
282 aa  178  9e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4404  Pirin domain-containing protein  38.65 
 
 
320 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355425  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  40.15 
 
 
288 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  36.4 
 
 
292 aa  175  7e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2574  Pirin-like protein  36.82 
 
 
286 aa  175  7e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  40.15 
 
 
288 aa  175  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1747  pirin family protein  39.62 
 
 
288 aa  175  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  39.3 
 
 
288 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1135  Pirin-like protein  36.97 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120417  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  38.85 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2153  pirin domain-containing protein  40.54 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.099247  normal  0.791413 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0673  Pirin-like  40 
 
 
288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  38.22 
 
 
286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1152  pirin domain-containing protein  40 
 
 
288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1128  pirin domain-containing protein  40 
 
 
288 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.645809  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  38.21 
 
 
290 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34904  predicted protein  37.46 
 
 
301 aa  172  5.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000589  pirin-related protein  36.14 
 
 
282 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0425395  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00280  Pirin-related protein  36.59 
 
 
342 aa  172  6.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  37.86 
 
 
290 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  39.18 
 
 
293 aa  171  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0560  hypothetical protein  39.06 
 
 
288 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  37.86 
 
 
290 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>