More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1005 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 116 aa  234  2e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  57.8 
 
 		 115 aa  131  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  58.18 
 
 		 112 aa  131  3.9999999999999996e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  41.11 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 119 aa  66.6  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  36.08 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  36.08 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  39.53 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 86 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  38.55 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 115 aa  62  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  43.94 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2559  transcriptional regulator, ArsR family  38.2 
 
 		 106 aa  62  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103934  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0771  regulatory protein ArsR  41.86 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00625866  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  35.16 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1965  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  36.56 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  43.84 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 103 aa  60.1  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 117 aa  60.1  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  34.41 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  43.94 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  43.94 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  36.84 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  36.08 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  38.37 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  32.29 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  36.59 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  35.56 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  35.63 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  31.78 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  43.94 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4551  regulatory protein ArsR  38.55 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  43.94 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1707  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000753333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  31.19 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  43.94 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  35.87 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  40.58 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5082  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  42.42 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  40.85 
 
 		 130 aa  57  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 90 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 90 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 		 84 aa  57  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  43.08 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2717  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  36.14 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  35.63 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  43.08 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  35.92 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  42.42 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1714  transcriptional regulator, ArsR family  34.57 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388978  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1755  transcriptional regulator CzrA  29.7 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.952937  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  34 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  31.46 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>