More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0724 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  100 
 
 
169 aa  335  1.9999999999999998e-91  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  64.81 
 
 
166 aa  221  3e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  42.35 
 
 
186 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  40.59 
 
 
186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  42.07 
 
 
192 aa  131  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  38.36 
 
 
176 aa  131  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  42.26 
 
 
179 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1336  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
171 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.723792 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 
179 aa  122  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  43.12 
 
 
177 aa  122  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  40.99 
 
 
180 aa  122  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0830  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 
177 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.66661  normal  0.255619 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 
178 aa  117  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  39.51 
 
 
194 aa  117  7e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1429  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 
176 aa  117  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.742876  normal  0.0486947 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
281 aa  117  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 
178 aa  116  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 
184 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0268  NUDIX hydrolase  38.85 
 
 
165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.880251  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  38.22 
 
 
177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  35.15 
 
 
175 aa  114  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  42.33 
 
 
169 aa  114  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 
182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  40.65 
 
 
171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  35.22 
 
 
172 aa  112  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 
183 aa  112  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1886  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
172 aa  112  3e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.556059 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  39.24 
 
 
214 aa  112  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  38.92 
 
 
185 aa  111  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
190 aa  111  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
196 aa  110  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  37.27 
 
 
185 aa  110  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 
179 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  38.65 
 
 
179 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  38.65 
 
 
179 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  38.65 
 
 
179 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  38.65 
 
 
179 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  38.65 
 
 
179 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  38.65 
 
 
179 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  38.65 
 
 
179 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 
180 aa  110  8.000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  39.26 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  36.88 
 
 
180 aa  108  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  38.04 
 
 
179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  39.49 
 
 
164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  36.2 
 
 
187 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 
179 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  36.2 
 
 
187 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  38.65 
 
 
179 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0600  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 
183 aa  106  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 
187 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
178 aa  106  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  34.73 
 
 
184 aa  105  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 
176 aa  105  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 
182 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  36.31 
 
 
171 aa  105  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  39.85 
 
 
173 aa  105  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0227  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 
185 aa  105  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.282406  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  39.85 
 
 
173 aa  104  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 
184 aa  104  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  33.12 
 
 
180 aa  103  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 
180 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  36.65 
 
 
203 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 
195 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  36.53 
 
 
179 aa  103  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 
180 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 
189 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 
176 aa  102  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  33.76 
 
 
164 aa  101  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
181 aa  100  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 
196 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  34.36 
 
 
204 aa  100  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 
210 aa  100  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  36.65 
 
 
196 aa  100  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 
196 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  35.8 
 
 
183 aa  100  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 
196 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 
199 aa  100  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 
196 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  36.59 
 
 
176 aa  99.4  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 
189 aa  99.8  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 
196 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 
196 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 
173 aa  99  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  35.4 
 
 
205 aa  98.6  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
204 aa  98.6  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
203 aa  98.6  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
186 aa  98.6  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0722  NUDIX hydrolase  32.1 
 
 
184 aa  98.2  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  35.4 
 
 
196 aa  97.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  35.4 
 
 
196 aa  97.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.4 
 
 
196 aa  97.8  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.4 
 
 
196 aa  97.8  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 
171 aa  97.8  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.4 
 
 
196 aa  97.8  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.4 
 
 
196 aa  97.8  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.4 
 
 
196 aa  97.8  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
184 aa  97.4  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>