237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0681 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0166  geranylgeranyl reductase  67.99 
 
 		 453 aa  669    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 453 aa  929    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  37.56 
 
 		 453 aa  316  4e-85  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  39.46 
 
 		 459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  36.05 
 
 		 452 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  38.58 
 
 		 453 aa  301  2e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0811  geranylgeranyl reductase  37.62 
 
 		 453 aa  297  3e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1514  geranylgeranyl reductase  29.42 
 
 		 485 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00785047 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  32.92 
 
 		 395 aa  157  5.0000000000000005e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  26.5 
 
 		 458 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  27.93 
 
 		 391 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2954  geranylgeranyl reductase  28.51 
 
 		 457 aa  124  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0881  geranylgeranyl reductase  27.02 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170951  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  30.21 
 
 		 399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1523  geranylgeranyl reductase  26.96 
 
 		 495 aa  120  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545892  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1413  geranylgeranyl reductase  27.07 
 
 		 456 aa  119  9e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.145276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3127  geranylgeranyl reductase  25.66 
 
 		 458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.541663  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  29.87 
 
 		 398 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  29.92 
 
 		 407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  26.61 
 
 		 406 aa  114  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  28.65 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1377  geranylgeranyl reductase  27.62 
 
 		 467 aa  109  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  28.32 
 
 		 398 aa  107  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2778  geranylgeranyl reductase  26.59 
 
 		 471 aa  103  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  27.81 
 
 		 402 aa  103  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  24.79 
 
 		 408 aa  100  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  25.8 
 
 		 396 aa  94  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  23.43 
 
 		 387 aa  93.2  9e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  26.69 
 
 		 413 aa  87.8  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  24.27 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  27.51 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  23.89 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  27.25 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  27.7 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  28.01 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  24.88 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  25.78 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  28.01 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  24.18 
 
 		 506 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  25.68 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  26.61 
 
 		 435 aa  75.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  27.17 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  26.02 
 
 		 348 aa  76.3  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  25.51 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  27.4 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  25.54 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  24.64 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  25.61 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  25.96 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  24.54 
 
 		 418 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  25.68 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  26.95 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0840  monooxygenase FAD-binding  26.16 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.634419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  26.1 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1774  FAD dependent oxidoreductase  24.92 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.496071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  27.14 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  24.03 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  28.21 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  28.28 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  24.19 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  28.82 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  21.04 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  24.56 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  27.49 
 
 		 409 aa  67  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  23.58 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  23.81 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  21.16 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  25.66 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  24.78 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  25.22 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  25.88 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  21.1 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  22.43 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  24.1 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  25.87 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  23.28 
 
 		 377 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  21.82 
 
 		 378 aa  63.2  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  25.28 
 
 		 421 aa  63.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  24.67 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  24.41 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  22.53 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  21.66 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  26.58 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  25.86 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  23.95 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  24.17 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  22.65 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  24.86 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  23.92 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  24.55 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  27.87 
 
 		 402 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  22.81 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  27 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  23.91 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  22.73 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  26.84 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000406  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  24.31 
 
 		 540 aa  57.8  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.453642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>