More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0661 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  100 
 
 
208 aa  413  1e-114  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  58.25 
 
 
212 aa  244  9e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  38.83 
 
 
205 aa  131  7.999999999999999e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  37.75 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  40.67 
 
 
212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  37.75 
 
 
239 aa  122  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  38.18 
 
 
224 aa  121  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  39.37 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  38.01 
 
 
244 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  39.82 
 
 
239 aa  117  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0245  ribonuclease HII  38.54 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.725917 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  36.32 
 
 
212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1729  ribonuclease HII  41.21 
 
 
209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.110653  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  38.76 
 
 
213 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0608  ribonuclease HII  34.47 
 
 
277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1305  ribonuclease HII  40.2 
 
 
195 aa  114  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.14682  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  39.3 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  37.13 
 
 
212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0312  ribonuclease HII  39.11 
 
 
198 aa  109  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  35.32 
 
 
213 aa  108  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0780  ribonuclease HII  37.24 
 
 
207 aa  102  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0504  ribonuclease HII  35.2 
 
 
205 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  32.18 
 
 
211 aa  94.7  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  38.61 
 
 
210 aa  94.7  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  36.08 
 
 
202 aa  90.5  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  36.08 
 
 
202 aa  90.5  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  31.18 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  37.13 
 
 
218 aa  89  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0985  ribonuclease HII  33.17 
 
 
234 aa  89  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  35.75 
 
 
232 aa  87.8  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  37.66 
 
 
206 aa  87.8  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  32.8 
 
 
198 aa  87.8  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1323  ribonuclease HII  32.84 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.831431  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  37.34 
 
 
245 aa  87  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  34.9 
 
 
232 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  33.68 
 
 
217 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  33.68 
 
 
217 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1263  ribonuclease H  34.73 
 
 
197 aa  86.3  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  33.68 
 
 
214 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  33.68 
 
 
214 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  34.2 
 
 
236 aa  85.5  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  33.68 
 
 
214 aa  85.5  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  35.5 
 
 
203 aa  84.7  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  37.34 
 
 
240 aa  84.7  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  33.68 
 
 
210 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  36.71 
 
 
235 aa  84  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2705  ribonuclease HII  31.58 
 
 
221 aa  84  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283445  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  35.12 
 
 
197 aa  84  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  32.8 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  31.28 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  35.71 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16821  ribonuclease HII  32.38 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  37.13 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  36.13 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  34.39 
 
 
240 aa  82.4  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1541  ribonuclease HII  36.13 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0283248  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  36.13 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  36.13 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  36.13 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  36.13 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2568  ribonuclease HII  36.13 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.446358  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  33.16 
 
 
214 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  35.08 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  34.73 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  35.71 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  34.18 
 
 
226 aa  81.3  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  32.91 
 
 
219 aa  81.6  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0741  ribonuclease HII  31.34 
 
 
228 aa  81.3  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  36.09 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  34.13 
 
 
198 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  32.8 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  34.81 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  32.8 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  38.85 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32830  predicted protein  31.9 
 
 
393 aa  79.7  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  38.85 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  33.53 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  33.17 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  34.13 
 
 
212 aa  79  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  32.32 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  32.65 
 
 
218 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  32.91 
 
 
256 aa  79  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  31.14 
 
 
198 aa  79  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31007  predicted protein  31.66 
 
 
347 aa  78.6  0.00000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.718365  normal  0.389801 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  34.73 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  31.75 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2825  RNase HII  31.76 
 
 
202 aa  77.8  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  35.71 
 
 
198 aa  78.2  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  37.21 
 
 
216 aa  77.8  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  34.46 
 
 
198 aa  77.8  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  33.16 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  33.16 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1495  ribonuclease HII  36.09 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0185949  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16251  ribonuclease HII  30.91 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  32.11 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  31.98 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2888  ribonuclease HII  36.09 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0614829  normal  0.459177 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  32.28 
 
 
277 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1591  Ribonuclease H  32.79 
 
 
250 aa  77  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000306759  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  32.35 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>