More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0650 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  62.34 
 
 
577 aa  733    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  100 
 
 
572 aa  1157    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  40.43 
 
 
519 aa  338  9.999999999999999e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  41.55 
 
 
671 aa  326  7e-88  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  40.25 
 
 
510 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  34.23 
 
 
489 aa  258  3e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  33.54 
 
 
549 aa  249  7e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  32.61 
 
 
491 aa  249  7e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  32.31 
 
 
547 aa  248  1e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  31.46 
 
 
654 aa  246  8e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  33.89 
 
 
558 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  31.58 
 
 
556 aa  241  2e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  36.1 
 
 
492 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  36.34 
 
 
492 aa  240  5e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  32.01 
 
 
545 aa  236  1.0000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  31.11 
 
 
542 aa  234  3e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  29.13 
 
 
791 aa  233  5e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  32.25 
 
 
628 aa  232  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  31.11 
 
 
591 aa  232  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  33.66 
 
 
583 aa  231  2e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  33.02 
 
 
551 aa  231  3e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  33.05 
 
 
991 aa  230  4e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  33.41 
 
 
609 aa  230  5e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  34.38 
 
 
604 aa  228  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  35.21 
 
 
543 aa  228  3e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  31.13 
 
 
549 aa  228  3e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  33.49 
 
 
682 aa  227  4e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  36.34 
 
 
546 aa  224  3e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  35.04 
 
 
831 aa  223  7e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  29.84 
 
 
749 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  29.62 
 
 
797 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  36.02 
 
 
546 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  35.77 
 
 
546 aa  220  5e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  33.42 
 
 
1255 aa  220  5e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  32.13 
 
 
770 aa  220  5e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  36.8 
 
 
546 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  37.13 
 
 
473 aa  218  2e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  34.13 
 
 
692 aa  218  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  35.8 
 
 
547 aa  217  4e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  31.96 
 
 
640 aa  216  9e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  32.33 
 
 
847 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  32.46 
 
 
610 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  31.19 
 
 
515 aa  213  7e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  31.79 
 
 
617 aa  213  9e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  35.96 
 
 
618 aa  212  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  33.83 
 
 
513 aa  211  4e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  33.42 
 
 
1319 aa  210  5e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  30.22 
 
 
512 aa  209  2e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  33.69 
 
 
1335 aa  208  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  34.65 
 
 
549 aa  205  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  33.62 
 
 
622 aa  203  6e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  40.36 
 
 
612 aa  201  3e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  36.39 
 
 
476 aa  197  3e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  35.11 
 
 
311 aa  197  5.000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  30.79 
 
 
559 aa  194  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  33.14 
 
 
620 aa  193  6e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  30.19 
 
 
557 aa  191  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  28.86 
 
 
557 aa  191  4e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  32.95 
 
 
557 aa  187  5e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  27.45 
 
 
722 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  30.82 
 
 
557 aa  179  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1197  type II secretion system protein E  30.49 
 
 
483 aa  176  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.585907  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  33.79 
 
 
552 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  33.51 
 
 
548 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  35.45 
 
 
552 aa  171  4e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  32.15 
 
 
553 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  32.15 
 
 
553 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  32.15 
 
 
553 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  32.15 
 
 
553 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  34.28 
 
 
544 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  31.79 
 
 
487 aa  153  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  34.2 
 
 
442 aa  152  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  29.4 
 
 
449 aa  151  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  34.41 
 
 
468 aa  148  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  32.03 
 
 
463 aa  147  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  34.33 
 
 
444 aa  147  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  36.33 
 
 
452 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
521 aa  146  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  30.53 
 
 
458 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  31.29 
 
 
428 aa  146  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  31.29 
 
 
428 aa  146  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  31.29 
 
 
428 aa  146  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  34.08 
 
 
449 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  31.71 
 
 
478 aa  145  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  31.58 
 
 
498 aa  144  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  30.91 
 
 
463 aa  144  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  31.83 
 
 
412 aa  143  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  33.46 
 
 
472 aa  143  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  31.21 
 
 
466 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  35.58 
 
 
450 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  31.53 
 
 
467 aa  143  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  33.02 
 
 
472 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  32.21 
 
 
480 aa  141  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  30.95 
 
 
445 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  33.02 
 
 
472 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  34.16 
 
 
513 aa  141  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  35.36 
 
 
624 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0628  type II secretion system protein E  34.75 
 
 
521 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  30 
 
 
423 aa  140  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>