More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0426 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0426  major facilitator transporter  100 
 
 		 452 aa  893    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1265  General substrate transporter  60.18 
 
 		 451 aa  538  9.999999999999999e-153  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0866  general substrate transporter  38.05 
 
 		 458 aa  252  1e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.580989  normal  0.629225 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1598  general substrate transporter  37.33 
 
 		 456 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0615669  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1434  General substrate transporter  36.7 
 
 		 460 aa  238  1e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0846  general substrate transporter  33.18 
 
 		 442 aa  202  9.999999999999999e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  32.47 
 
 		 471 aa  187  4e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  32.98 
 
 		 467 aa  186  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1718  phosphate transporter  33.56 
 
 		 443 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.140032  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0471  putative iorganic phosphate transporter  33.56 
 
 		 441 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  30.82 
 
 		 459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0727  phosphate transporter  31.26 
 
 		 442 aa  170  5e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0831  putative iorganic phosphate transporter  31.04 
 
 		 442 aa  168  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 477 aa  166  9e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2879  General substrate transporter  31.43 
 
 		 465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  30.21 
 
 		 463 aa  161  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1618  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 458 aa  158  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  28.29 
 
 		 469 aa  154  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 423 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 427 aa  136  7.000000000000001e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  28.27 
 
 		 476 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 435 aa  126  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03960  phosphate transporter, putative  26.94 
 
 		 555 aa  121  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.362408  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 429 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  26.41 
 
 		 429 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 428 aa  119  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  27.98 
 
 		 446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 432 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82453  inorganic phosphate transporter, transmembrane protein  24.5 
 
 		 555 aa  114  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.10716  normal  0.589163 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  25 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  28.44 
 
 		 480 aa  114  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  26.28 
 
 		 471 aa  114  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 410 aa  114  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0821  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 403 aa  113  8.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 491 aa  113  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  24.94 
 
 		 443 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  24.94 
 
 		 443 aa  110  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  27.29 
 
 		 428 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  27.29 
 
 		 428 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 428 aa  109  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.108427 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  24.94 
 
 		 443 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 443 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 443 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  24.94 
 
 		 443 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  24.94 
 
 		 443 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  24.94 
 
 		 443 aa  109  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 409 aa  109  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 430 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 411 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  28.25 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 410 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 415 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  25.86 
 
 		 438 aa  107  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 415 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  27.15 
 
 		 452 aa  106  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  26.08 
 
 		 459 aa  106  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  25.49 
 
 		 478 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  26.73 
 
 		 445 aa  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 427 aa  103  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 435 aa  103  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 		 472 aa  103  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 409 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  25.39 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  25.8 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  25.8 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  25.8 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  26.41 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01860  phospholipid transporter, putative  25.16 
 
 		 519 aa  102  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  25.8 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  25.57 
 
 		 399 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 382 aa  101  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 415 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  26.19 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 409 aa  100  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 398 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 451 aa  100  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 		 460 aa  99.8  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 423 aa  100  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  24.16 
 
 		 472 aa  99.8  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  25.11 
 
 		 399 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0672  sugar transporter  26.07 
 
 		 493 aa  99  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  27.06 
 
 		 423 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 451 aa  99.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  24.31 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>