More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0394 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0394  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 549 aa  1143    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0606  AMP-dependent synthetase and ligase  47.1 
 
 		 560 aa  491  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1570  acyl-CoA synthetase  45.56 
 
 		 549 aa  463  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1658  acyl-CoA synthetase  43.33 
 
 		 542 aa  449  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.125326  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2093  acyl-CoA synthetase  42.06 
 
 		 542 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100174  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3590  AMP-dependent synthetase and ligase  41.57 
 
 		 547 aa  434  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2052  AMP-dependent synthetase and ligase  45.16 
 
 		 523 aa  434  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2536  acyl-CoA synthetase  41.71 
 
 		 558 aa  434  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2369  acyl-CoA synthetase  42.44 
 
 		 540 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2221  acyl-CoA synthetase  42.16 
 
 		 540 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25250  acyl-CoA synthetase  42.83 
 
 		 540 aa  425  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3817  acyl-CoA synthetase  42.96 
 
 		 539 aa  428  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710335  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3553  acyl-CoA synthetase  41.79 
 
 		 540 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.817597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2329  AMP-dependent synthetase and ligase  43.59 
 
 		 521 aa  422  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.247287  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0900  acyl-CoA synthetase  41.62 
 
 		 540 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0183173  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2080  AMP-dependent synthetase and ligase  42.32 
 
 		 543 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6026  AMP-dependent synthetase and ligase  40.91 
 
 		 550 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09660  acyl-CoA synthetase  41.62 
 
 		 540 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00865902  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4259  AMP-binding protein  41.92 
 
 		 541 aa  419  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3136  AMP-dependent synthetase and ligase  41.54 
 
 		 545 aa  419  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5782  AMP-dependent synthetase and ligase  41.62 
 
 		 550 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3533  acyl-CoA synthetase  42.04 
 
 		 546 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.8024  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4911  AMP-dependent synthetase and ligase  42.33 
 
 		 550 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6506  AMP-dependent synthetase and ligase  40.87 
 
 		 545 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00389964  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2483  AMP-dependent synthetase and ligase  41.54 
 
 		 548 aa  419  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279875  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3250  AMP-dependent synthetase and ligase  40.23 
 
 		 545 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0550813  normal  0.598947 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4191  acyl-CoA synthetase  44.49 
 
 		 550 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4913  AMP-dependent synthetase and ligase  40.23 
 
 		 545 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3713  acyl-CoA synthetase  44.49 
 
 		 550 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5356  AMP-dependent synthetase and ligase  43.37 
 
 		 523 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4096  acyl-CoA synthetase  41.76 
 
 		 547 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0683  AMP-dependent synthetase and ligase  40.77 
 
 		 550 aa  412  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000214245  normal  0.363431 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6221  AMP-dependent synthetase and ligase  41.8 
 
 		 550 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1170  acyl-CoA synthetase  40.33 
 
 		 543 aa  413  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0279011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2463  AMP-dependent synthetase and ligase  42.1 
 
 		 542 aa  413  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591871  normal  0.469505 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4590  acyl-CoA synthetase  40.98 
 
 		 551 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.907923 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1108  acyl-CoA synthetase  40.98 
 
 		 551 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1291  AMP-dependent synthetase and ligase  41.14 
 
 		 550 aa  410  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0896483  normal  0.0414381 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2111  AMP-dependent synthetase and ligase  39.36 
 
 		 560 aa  409  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2709  acyl-CoA synthetase  42.22 
 
 		 549 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0511  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 		 551 aa  409  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2720  acyl-CoA synthetase  42.13 
 
 		 549 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120351  normal  0.897048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3119  acyl-CoA synthetase  42.38 
 
 		 549 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186561  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  40.52 
 
 		 546 aa  410  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6424  AMP-dependent synthetase and ligase  39.82 
 
 		 551 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2684  acyl-CoA synthetase  41.85 
 
 		 549 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2005  acyl-CoA synthetase  41.04 
 
 		 547 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0857661  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  41.33 
 
 		 544 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2689  AMP-dependent synthetase and ligase  41.85 
 
 		 543 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.586965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7038  hypothetical protein  41.45 
 
 		 544 aa  405  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1724  acyl-CoA synthetase  44 
 
 		 556 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0277595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4171  AMP-dependent synthetase and ligase  41.17 
 
 		 543 aa  403  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1686  acyl-CoA synthetase  43.02 
 
 		 553 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4540  AMP-dependent synthetase and ligase  41.17 
 
 		 543 aa  403  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1565  AMP-dependent synthetase and ligase  41.32 
 
 		 543 aa  405  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3222  acyl-CoA synthetase  43.62 
 
 		 550 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.831142  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4071  acyl-CoA synthetase  43.62 
 
 		 550 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4295  acyl-CoA synthetase  43.62 
 
 		 550 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1195  AMP-dependent synthetase and ligase  41 
 
 		 652 aa  402  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.497537  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0993  acyl-CoA synthetase  43.23 
 
 		 553 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.936979  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1394  acyl-CoA synthetase  43.05 
 
 		 553 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.592914  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0180  AMP-dependent synthetase and ligase family protein  38.69 
 
 		 554 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.115712 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0226  acyl-CoA synthetase  41.96 
 
 		 545 aa  401  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00200455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0030  AMP-dependent synthetase and ligase  41.49 
 
 		 541 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2306  acyl-CoA synthetase  43.23 
 
 		 553 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1076  acyl-CoA synthetase  43.23 
 
 		 553 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5768  acyl-CoA synthetase  40.98 
 
 		 544 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.915964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0509  acyl-CoA synthetase  43.05 
 
 		 553 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35940  acyl-CoA synthetase  41.18 
 
 		 548 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0629004  hitchhiker  4.55863e-16 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  40.89 
 
 		 542 aa  395  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.656252  hitchhiker  0.0000000000010579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2795  acyl-CoA synthetase  40.61 
 
 		 548 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0833  AMP-dependent synthetase and ligase  43.25 
 
 		 541 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0919846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0138  acyl-CoA synthetase  42.86 
 
 		 553 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1474  acyl-CoA synthetase  42.86 
 
 		 553 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0024  acyl-CoA synthetase  41.06 
 
 		 544 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.702064 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5039  AMP-dependent synthetase and ligase  40.11 
 
 		 548 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.05602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0063  AMP-dependent synthetase and ligase  39.92 
 
 		 550 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.488746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4310  acyl-CoA synthetase  42.91 
 
 		 550 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.213622 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0019  acyl-CoA synthetase  41.21 
 
 		 544 aa  395  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0193  AMP-dependent synthetase and ligase  38.21 
 
 		 554 aa  393  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4308  acyl-CoA synthetase  40.3 
 
 		 544 aa  389  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.458975  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0254  AMP-dependent synthetase and ligase  41.08 
 
 		 549 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1502  AMP-dependent synthetase and ligase  41.81 
 
 		 545 aa  389  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5939  AMP-dependent synthetase and ligase  39.74 
 
 		 559 aa  385  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.812118  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6109  AMP-dependent synthetase and ligase  39.59 
 
 		 558 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.649133  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1599  AMP-binding protein  40.89 
 
 		 549 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.4226  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6767  acyl-CoA synthetase  42.27 
 
 		 543 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196968  normal  0.258132 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2979  AMP-dependent synthetase and ligase  41.12 
 
 		 543 aa  380  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0673597  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  39.63 
 
 		 548 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2076  AMP-dependent synthetase and ligase  39.93 
 
 		 556 aa  376  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0086171 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2782  acyl-CoA synthetase  41.71 
 
 		 543 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0317959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1435  putative CoA ligase (AMP-forming)  38.78 
 
 		 552 aa  369  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.760271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1498  AMP-dependent synthetase and ligase  39.66 
 
 		 531 aa  359  7e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  38.06 
 
 		 530 aa  350  4e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0787  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 		 549 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.387629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3751  hypothetical protein  37.87 
 
 		 549 aa  339  7e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4009  AMP-dependent synthetase and ligase  37.43 
 
 		 540 aa  330  6e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04201  AMP-binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04270)  36.43 
 
 		 592 aa  323  7e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.475143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2165  AMP-dependent synthetase and ligase  38.05 
 
 		 511 aa  320  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0820  AMP-dependent synthetase and ligase  35.92 
 
 		 538 aa  318  2e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.594452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>