46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0354 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0354  SirA family protein  100 
 
 		 79 aa  154  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0440  SirA family protein  62.67 
 
 		 77 aa  99  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.860171  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2180  SirA family protein  62.67 
 
 		 77 aa  99  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2346  SirA family protein  35.29 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.416048  decreased coverage  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1650  SirA family protein  33.82 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2868  hypothetical protein  32.35 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  30.14 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2418  SirA family protein  33.82 
 
 		 77 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.753437  hitchhiker  0.000838905 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  31.08 
 
 		 80 aa  49.7  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  31.08 
 
 		 80 aa  49.7  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  25.68 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  31.08 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  27.63 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  27.63 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1696  SirA family protein  27.94 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0524  SirA family protein  27.63 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.842922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1784  SirA family protein  30.88 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832592  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2494  SirA family protein  30.88 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.284005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1828  SirA family protein  30.88 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.263187  normal  0.225214 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1791  SirA family protein  30.88 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  23.94 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1912  hypothetical protein  30.88 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  28.38 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  30 
 
 		 76 aa  42.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  29.73 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  25.37 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  29.73 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2083  SirA family protein  28.36 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  28.36 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  27.94 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  27.85 
 
 		 81 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  30 
 
 		 76 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  29.41 
 
 		 79 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  28.38 
 
 		 75 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3888  sulfur transfer protein SirA  27.94 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.9 
 
 		 834 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  28.57 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  28.95 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1311  SirA family protein  33.82 
 
 		 200 aa  40.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  33.82 
 
 		 72 aa  40.4  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  26.47 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  26.47 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  26.47 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  28 
 
 		 84 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  26.32 
 
 		 85 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  26.47 
 
 		 80 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>