210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0296 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0296  rubrerythrin  100 
 
 		 143 aa  293  5e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.585668 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0453  Rubrerythrin  85.21 
 
 		 144 aa  253  6e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0899  Rubrerythrin  67.14 
 
 		 144 aa  200  5e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  66.9 
 
 		 140 aa  197  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  65 
 
 		 146 aa  182  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  65 
 
 		 139 aa  181  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  63.57 
 
 		 146 aa  181  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  63.57 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  63.57 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  63.57 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  63.57 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  63.57 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  63.57 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  63.57 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  63.57 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  63.57 
 
 		 140 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  62.86 
 
 		 140 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  64.29 
 
 		 139 aa  178  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  64.29 
 
 		 139 aa  178  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  64.29 
 
 		 139 aa  178  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  63.04 
 
 		 139 aa  177  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  64.29 
 
 		 140 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  62.14 
 
 		 140 aa  177  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  63.57 
 
 		 140 aa  176  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  63.57 
 
 		 140 aa  176  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  62.77 
 
 		 139 aa  176  7e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  63.57 
 
 		 140 aa  176  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  63.57 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  62.86 
 
 		 140 aa  175  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  61.43 
 
 		 140 aa  174  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  63.5 
 
 		 139 aa  174  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  61.31 
 
 		 140 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  62.04 
 
 		 168 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  61.31 
 
 		 139 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  60.58 
 
 		 139 aa  165  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0059  rubrerythrin  55.64 
 
 		 156 aa  152  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  44.44 
 
 		 191 aa  113  6.9999999999999995e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  47.14 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  42.96 
 
 		 178 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  43.75 
 
 		 191 aa  107  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  44.53 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  43.26 
 
 		 191 aa  105  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  42.76 
 
 		 191 aa  104  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  43.7 
 
 		 168 aa  104  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  42.75 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  43.7 
 
 		 192 aa  103  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  41.26 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  44.12 
 
 		 191 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  44.78 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  42.66 
 
 		 190 aa  101  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  40.14 
 
 		 178 aa  101  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  41.84 
 
 		 178 aa  101  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  40.3 
 
 		 164 aa  100  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  38.62 
 
 		 196 aa  100  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  41.35 
 
 		 165 aa  99.4  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  45.04 
 
 		 164 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  40.43 
 
 		 197 aa  99.8  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  41.35 
 
 		 165 aa  99.4  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  39.29 
 
 		 179 aa  99  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  41.3 
 
 		 191 aa  98.6  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  43.94 
 
 		 166 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  45.86 
 
 		 172 aa  99.4  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  41.01 
 
 		 192 aa  98.2  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  38.19 
 
 		 191 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  42.96 
 
 		 192 aa  98.2  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  43.18 
 
 		 166 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  41.04 
 
 		 166 aa  97.8  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  43.85 
 
 		 167 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  43.38 
 
 		 221 aa  97.4  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  42.65 
 
 		 191 aa  97.4  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  39.31 
 
 		 191 aa  97.4  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  39.29 
 
 		 179 aa  97.1  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  41.79 
 
 		 166 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  42.22 
 
 		 168 aa  96.7  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  40.3 
 
 		 166 aa  95.9  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  43.28 
 
 		 165 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  39.29 
 
 		 179 aa  96.7  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  43.7 
 
 		 168 aa  96.3  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  42.14 
 
 		 178 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2184  rubrerythrin  37.58 
 
 		 243 aa  95.5  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  43.07 
 
 		 178 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  40.15 
 
 		 190 aa  95.5  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1376  rubrerythrin  42.31 
 
 		 161 aa  95.9  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.642256  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  40.71 
 
 		 191 aa  95.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  40 
 
 		 177 aa  94.4  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  43.66 
 
 		 180 aa  94.7  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  42.75 
 
 		 164 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  41.01 
 
 		 192 aa  94.4  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  39.86 
 
 		 190 aa  94  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  41.35 
 
 		 190 aa  93.6  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  39.85 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  42.11 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4424  rubrerythrin  35.98 
 
 		 237 aa  92  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  40.58 
 
 		 190 aa  92  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  34.06 
 
 		 191 aa  91.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0679  Rubrerythrin  38.51 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  38.19 
 
 		 190 aa  90.9  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  37.78 
 
 		 191 aa  90.9  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1511  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  37.95 
 
 		 237 aa  90.9  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  38.35 
 
 		 166 aa  90.9  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>