30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0269 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0269  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  341  2e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000709024  normal  0.121609 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2783  protein of unknown function DUF35  72.73 
 
 		 165 aa  263  1e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.103009  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0268  hypothetical protein  55.56 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00125281  normal  0.120379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2732  hypothetical protein  33.33 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2784  protein of unknown function DUF35  40 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0211194  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3818  protein of unknown function DUF35  31.17 
 
 		 320 aa  73.9  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13554  hypothetical protein  30.19 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3090  protein of unknown function DUF35  30.25 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4634  hypothetical protein  31.37 
 
 		 338 aa  67.8  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4722  hypothetical protein  31.37 
 
 		 338 aa  67.8  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5016  hypothetical protein  31.37 
 
 		 338 aa  67.8  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2839  hypothetical protein  33.55 
 
 		 319 aa  67.4  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11529  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3983  protein of unknown function DUF35  28.66 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.411104  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2642  hypothetical protein  31.43 
 
 		 329 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13056  normal  0.212134 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1538  hypothetical protein  30.67 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1482  nucleic-acid-binding protein containing a Zn- ribbon-like protein  27.63 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5220  hypothetical protein  27.5 
 
 		 330 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146278  normal  0.27671 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3784  protein of unknown function DUF35  29.19 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.0099748  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  46 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3964  protein of unknown function DUF35  31.72 
 
 		 329 aa  50.8  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  36.36 
 
 		 177 aa  50.8  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  38 
 
 		 128 aa  50.4  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  29.49 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2762  hypothetical protein  29.21 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.10983  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  34.18 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  30.38 
 
 		 189 aa  47.8  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  35.48 
 
 		 576 aa  47  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  35.94 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  26.05 
 
 		 130 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  34 
 
 		 130 aa  41.2  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>