77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0153 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0153  glutaredoxin-like domain-containing protein  100 
 
 
230 aa  472  1e-132  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.369669  normal  0.0212592 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1173  glutaredoxin-like domain protein  70.56 
 
 
233 aa  343  9e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.545733  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1569  glutaredoxin-like domain-containing protein  42.22 
 
 
243 aa  159  4e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  unclonable  1.34585e-14 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1507  glutaredoxin-like domain-containing protein  42.98 
 
 
250 aa  153  3e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.499765  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0614  glutaredoxin-like domain-containing protein  41.23 
 
 
244 aa  149  3e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  8.80654e-10 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1697  glutaredoxin-like domain-containing protein  42.92 
 
 
243 aa  149  3e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000123601 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1343  glutaredoxin-like domain-containing protein  40.79 
 
 
249 aa  138  9e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  8.75988e-06  normal  0.962499 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0059  glutaredoxin-like domain-containing protein  33.96 
 
 
221 aa  123  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  8.82966e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0059  glutaredoxin-like domain-containing protein  33.96 
 
 
221 aa  123  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000207157  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0759  glutaredoxin-like domain protein  36.02 
 
 
227 aa  115  4e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2897  glutaredoxin-like domain protein  42.64 
 
 
223 aa  110  2e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.422618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2804  glutaredoxin-like domain protein  42.64 
 
 
223 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.260835  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0856  glutaredoxin-like domain-containing protein  32.31 
 
 
216 aa  109  4e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00205393  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1277  glutaredoxin-like domain protein  29.86 
 
 
216 aa  108  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2727  dehydrogenase, selenocysteine-containing protein  30.66 
 
 
228 aa  105  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.305713  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3623  glutaredoxin-like domain-containing protein  32.84 
 
 
219 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2537  glutaredoxin-like domain protein  30.57 
 
 
215 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1449  glutaredoxin-like domain protein  31.4 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  1.03791e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2049  glutaredoxin-like domain protein  31.14 
 
 
230 aa  99.4  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0051  glutaredoxin-like domain protein  29.82 
 
 
220 aa  99.4  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  normal  0.790118 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3949  glutaredoxin-like domain-containing protein  31.82 
 
 
219 aa  98.6  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0210  AhpF family protein/thioredoxin reductase  32.88 
 
 
550 aa  98.6  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.018  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0326  glutaredoxin-like domain-containing protein  29.65 
 
 
255 aa  97.1  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2697  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.72 
 
 
579 aa  95.5  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2077  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.82 
 
 
602 aa  95.9  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0554  glutaredoxin-like domain-containing protein  31.07 
 
 
220 aa  94.7  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.411962  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1754  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.84 
 
 
547 aa  85.5  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0325052  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18130  glutaredoxin-like domain protein  26.18 
 
 
214 aa  85.1  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.20746e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.63 
 
 
551 aa  82.8  4e-15  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3874  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.7 
 
 
548 aa  82  7e-15  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.697389  normal  0.0433305 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2110  glutaredoxin-like domain protein  29.19 
 
 
213 aa  78.6  9e-14  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.405211  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0021  glutaredoxin-like domain-containing protein  34.82 
 
 
225 aa  74.7  1e-12  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2632  glutaredoxin-like domain protein  33.08 
 
 
227 aa  73.6  3e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0566  glutaredoxin-like domain-containing protein  25.11 
 
 
223 aa  71.2  1e-11  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.443165  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0480  glutaredoxin-like domain protein  31.25 
 
 
187 aa  64.3  2e-09  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.57434e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0785  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  25.62 
 
 
556 aa  61.2  1e-08  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182954  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  24.04 
 
 
555 aa  56.6  3e-07  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1451  Alkyl hydroperoxide reductase, large subunit  22.49 
 
 
569 aa  56.2  4e-07  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1553  hypothetical protein  31.86 
 
 
187 aa  55.8  5e-07  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0385592 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1036  redox-active disulfide protein 1  37.8 
 
 
80 aa  55.5  7e-07  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0941  redox-active disulfide protein 1  35.9 
 
 
80 aa  55.1  9e-07  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.917441  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0908  redox-active disulfide protein 1  36.59 
 
 
80 aa  54.3  2e-06  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.424409 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1773  redox-active disulfide protein 1  36.59 
 
 
80 aa  53.9  2e-06  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0503  redox-active disulfide protein 1  36.14 
 
 
82 aa  53.1  3e-06  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0329  glutaredoxin  35.71 
 
 
85 aa  52  9e-06  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.923788  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2712  hypothetical protein  42.31 
 
 
60 aa  50.1  3e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.821146  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2093  glutaredoxin related protein  31.3 
 
 
186 aa  48.9  7e-05  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1535  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.5 
 
 
526 aa  47.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  6.73423e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1101  NADH dehydrogenase  26.09 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2711  glutaredoxin-like protein  41.07 
 
 
148 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3326  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.52 
 
 
525 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1417  thioredoxin-disulfide reductase  25.53 
 
 
526 aa  45.1  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1145  glutaredoxin  28.57 
 
 
100 aa  45.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0311964 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0047  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  27.43 
 
 
512 aa  44.7  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1403  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  24.56 
 
 
525 aa  45.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0793  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.61 
 
 
521 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.599853 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3518  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase:pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II, active site  24.69 
 
 
521 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.401893  hitchhiker  0.00190824 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0800  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.85 
 
 
525 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3518  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.17 
 
 
528 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0848  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.17 
 
 
528 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0782  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  26.85 
 
 
531 aa  43.5  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0983751  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3639  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.17 
 
 
528 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4879  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  24.06 
 
 
529 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3445  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  26.17 
 
 
528 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0956  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  26.17 
 
 
527 aa  43.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0618  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  26.57 
 
 
520 aa  43.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.309291 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3223  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.72 
 
 
525 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0747  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.53 
 
 
524 aa  43.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.501154  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0870  subunit F of alkyl hydroperoxide reductase  26.85 
 
 
531 aa  42.7  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.037495  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3011  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.83 
 
 
531 aa  43.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.19 
 
 
523 aa  42.7  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653172  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3926  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  27.1 
 
 
520 aa  42.4  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.763175  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3045  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.45 
 
 
523 aa  42.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001043  alkyl hydroperoxide reductase protein F  27.78 
 
 
522 aa  42.4  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.30284  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03190  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  24.03 
 
 
560 aa  42  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2999  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  24.44 
 
 
525 aa  42  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.336504  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0943  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  26.19 
 
 
509 aa  41.6  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>