More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0129 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0129  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
397 aa  817    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.730138  hitchhiker  0.000955625 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0419  glycosyl transferase group 1  70.56 
 
 
413 aa  611  9.999999999999999e-175  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.102155  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1359  glycosyl transferase, group 1  66.92 
 
 
402 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.254886 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0594  glycosyl transferase, group 1  63.78 
 
 
401 aa  543  1e-153  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2083  glycosyl transferase, group 1  49.63 
 
 
411 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1740  glycosyl transferase group 1  49.63 
 
 
411 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163685 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0797  glycosyl transferase, group 1  49.24 
 
 
408 aa  409  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2348  glycosyl transferase, group 1  50.51 
 
 
411 aa  402  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0363579  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3111  trehalose phosphorylase/synthase  49 
 
 
420 aa  398  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0297  glycosyl transferase group 1  47.38 
 
 
411 aa  366  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1763  glycosyl transferase, group 1  44.25 
 
 
419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.410209  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1718  glycosyl transferase group 1  44.05 
 
 
433 aa  351  1e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1192  glycosyl transferase, group 1  46.39 
 
 
410 aa  344  2e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1592  glycosyl transferase, group 1  43.37 
 
 
414 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0955331  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5908  glycosyl transferase group 1  42.86 
 
 
410 aa  331  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2023  glycosyl transferase, group 1  41.38 
 
 
442 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1812  glycosyl transferase, group 1  41.98 
 
 
407 aa  323  3e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0100815  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3082  glycosyl transferase, group 1  43.38 
 
 
474 aa  318  7e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0542  glycosyl transferase group 1  41.27 
 
 
406 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000128948  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0528  glycosyl transferase, group 1  41.37 
 
 
406 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000105595  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2973  glycosyl transferase, group 1  43.22 
 
 
416 aa  306  3e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0451  glycosyl transferase group 1  39.95 
 
 
406 aa  303  3.0000000000000004e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.340856  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3832  glycosyl transferase group 1  40.84 
 
 
417 aa  303  4.0000000000000003e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672883  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1821  glycosyl transferase, group 1  40.31 
 
 
403 aa  300  3e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0709671  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0427  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
460 aa  272  6e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.049978  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1550  glycosyl transferase group 1  35.04 
 
 
398 aa  271  1e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.267317  hitchhiker  0.0000000000000568319 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3637  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
497 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.564588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4094  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
509 aa  183  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108712  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04480  trehalose synthase, putative  28.95 
 
 
734 aa  130  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05021  trehalose synthase (Ccg-9), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12100)  27.08 
 
 
705 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1028  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.95 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1546  glycosyl transferase group 1  31.77 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00289117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.2 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1517  glycosyl transferase, group 1  31.77 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  31.35 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.78 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.2 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  27.2 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  27.2 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.2 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  27.2 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.11 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.78 
 
 
381 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  39.64 
 
 
434 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 
421 aa  63.2  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  28.33 
 
 
650 aa  63.2  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 
405 aa  63.2  0.000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
381 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
378 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
420 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  27.89 
 
 
404 aa  60.5  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3596  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 
393 aa  60.5  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 
375 aa  60.1  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
374 aa  59.3  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  24.9 
 
 
361 aa  59.7  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
355 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  29.63 
 
 
388 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 
406 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0567  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
437 aa  58.2  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.923327  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  36 
 
 
383 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
394 aa  57.8  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  27.14 
 
 
420 aa  57.4  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  26.02 
 
 
416 aa  57  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
435 aa  56.6  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
355 aa  56.6  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.37 
 
 
367 aa  55.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0851  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
416 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0012  a-glycosyltransferase  28.29 
 
 
379 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
379 aa  56.2  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
355 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119517  glycosyl transferase, putative alpha-1,3-mannosyltransferase  22.7 
 
 
480 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
389 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 
390 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
424 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 
386 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1590  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 
468 aa  55.5  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00816719  decreased coverage  0.0063014 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0299  glycosyl transferase, group 1  22.88 
 
 
384 aa  54.7  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120418  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 
377 aa  54.3  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  32.14 
 
 
387 aa  53.9  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  32.64 
 
 
398 aa  53.9  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  23.67 
 
 
385 aa  53.9  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
500 aa  53.9  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0496  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 
381 aa  53.9  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  36 
 
 
384 aa  53.9  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  23.44 
 
 
394 aa  53.9  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1445  glycosyl transferase group 1  23.79 
 
 
379 aa  53.9  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000927133 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  28.33 
 
 
382 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
378 aa  53.1  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
351 aa  53.1  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  28.78 
 
 
392 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
384 aa  53.5  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
401 aa  53.1  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  27.6 
 
 
387 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
365 aa  52.8  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  28.12 
 
 
770 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4575  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
413 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.161634  normal  0.819576 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2100  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 
400 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 
384 aa  52.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>