93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0118 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0118  cytidylate kinase  100 
 
 		 180 aa  362  2e-99  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000087822  hitchhiker  0.0000442728 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1751  cytidylate kinase  52.02 
 
 		 189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0626  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 187 aa  158  5e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1109  cytidylate kinase  46.84 
 
 		 184 aa  144  6e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1364  cytidylate kinase  44.3 
 
 		 184 aa  141  4e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.790143  normal  0.0224769 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2321  cytidylate kinase  43.18 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1729  cytidylate kinase  44.3 
 
 		 184 aa  139  3e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000578527 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1734  cytidylate kinase  41.95 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165208 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0399  cytidylate kinase  47.47 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185017  normal  0.222549 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0898  cytidylate kinase  41.21 
 
 		 181 aa  134  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.136521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1495  cytidylate kinase  40.83 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1813  cytidylate kinase  38.51 
 
 		 192 aa  127  7.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.147241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0270  cytidylate kinase  39.08 
 
 		 191 aa  127  7.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2255  cytidylate kinase  40.12 
 
 		 191 aa  127  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0590  cytidylate kinase  39.34 
 
 		 181 aa  121  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0107  cytidylate kinase  34.83 
 
 		 177 aa  111  5e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.233857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0468  cytidylate kinase  38.24 
 
 		 176 aa  111  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1703  cytidylate kinase  40.38 
 
 		 172 aa  111  7.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.784294  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1945  cytidylate kinase  36.52 
 
 		 203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0083  cytidylate kinase  38.67 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1127  cytidylate kinase  41.18 
 
 		 178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.402231  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0558  cytidylate kinase  39.24 
 
 		 182 aa  107  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.818814  normal  0.184695 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0027  cytidylate kinase  38.85 
 
 		 175 aa  104  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000301148  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1254  cytidylate kinase  33.71 
 
 		 204 aa  102  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0979  cytidylate kinase  38.29 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1499  cytidylate kinase  40.91 
 
 		 174 aa  99.4  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0265  cytidylate kinase  37.14 
 
 		 178 aa  95.9  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1649  cytidylate kinase  36 
 
 		 178 aa  91.7  5e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.73903  normal  0.997406 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2227  cytidylate kinase  34.55 
 
 		 178 aa  90.9  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1087  cytidylate kinase  32.93 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0849  cytidylate kinase  31.76 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0405  cytidylate kinase  28.32 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1866  hypothetical protein  30.34 
 
 		 327 aa  72.4  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.546086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1859  hypothetical protein  28.81 
 
 		 327 aa  71.6  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3839  cytidylate kinase-like protein  26.16 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.206028  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  31.36 
 
 		 204 aa  52  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3531  hypothetical protein  28.95 
 
 		 209 aa  50.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0110536  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0104  cytidylate kinase  41.27 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1932  adenylate kinase  31.01 
 
 		 214 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  25.6 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0066  cytidylate kinase  32.18 
 
 		 212 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0168644  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  28.24 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  27.27 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  27.37 
 
 		 275 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0598  deoxynucleoside kinase  24.4 
 
 		 215 aa  45.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.377653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  29.73 
 
 		 210 aa  45.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  25.66 
 
 		 222 aa  45.1  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0128  cytidylate kinase  26.01 
 
 		 221 aa  44.7  0.0006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3396  adenylate kinase  33.71 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  25.58 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  26.09 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0272  adenylate kinase  31.46 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  28.57 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1925  adenylate kinase  28.68 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  28 
 
 		 238 aa  42.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3122  adenylate kinase  32.56 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2381  cytidylate kinase-like  25.73 
 
 		 242 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0882495 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  38.89 
 
 		 255 aa  42.7  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  36.76 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0398  cytidylate kinase  29.76 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1111  cytidylate kinase  21.3 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  29.21 
 
 		 192 aa  42  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  26.32 
 
 		 273 aa  42.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  20.74 
 
 		 240 aa  42.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  37.1 
 
 		 213 aa  42.4  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0631  adenylate kinase  26.97 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1954  Adenylate kinase  27.91 
 
 		 214 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  29.21 
 
 		 216 aa  42  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2039  Adenylate kinase  27.91 
 
 		 214 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0191  cytidylate kinase  40.82 
 
 		 212 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1336  hypothetical protein  24.44 
 
 		 259 aa  41.6  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6593  adenylate kinase  29.21 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  40.82 
 
 		 223 aa  41.6  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  20.74 
 
 		 251 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  20.74 
 
 		 251 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1348  adenylate kinase  32.58 
 
 		 181 aa  41.6  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1657  adenylate kinase, conjectural  48.84 
 
 		 170 aa  41.6  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.160746  hitchhiker  0.0066831 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1456  cytidylate kinase  44.44 
 
 		 268 aa  41.6  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00727375 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3884  adenylate kinase  26.97 
 
 		 191 aa  41.6  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 230 aa  41.6  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0349  cytidylate kinase  37.5 
 
 		 222 aa  41.2  0.008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.229636  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0641  cytidylate kinase  40.82 
 
 		 212 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.112665 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0167  adenylate kinases  30.34 
 
 		 228 aa  41.2  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0999685  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  47.5 
 
 		 216 aa  41.2  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  47.5 
 
 		 216 aa  41.2  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  31.46 
 
 		 219 aa  41.2  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  32.58 
 
 		 189 aa  40.8  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  22.91 
 
 		 218 aa  41.2  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  37.04 
 
 		 514 aa  41.2  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  36.11 
 
 		 231 aa  41.2  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  38.78 
 
 		 223 aa  40.8  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  24.57 
 
 		 275 aa  40.8  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1234  adenylate kinase  30.34 
 
 		 215 aa  40.8  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>