20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0115 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0115  adenylate kinase  100 
 
 
194 aa  395  1e-109  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000149459  hitchhiker  0.0000475665 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1754  Adenylate kinase  64.1 
 
 
195 aa  258  3e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.137962  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1497  Adenylate kinase  38.62 
 
 
181 aa  138  4.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0105  adenylate kinase  40 
 
 
190 aa  131  5e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.640002  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2229  adenylate kinase  39.43 
 
 
190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.568748  normal  0.396144 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0556  adenylate kinase  39.88 
 
 
190 aa  124  7e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.261515 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0403  adenylate kinase  37.04 
 
 
192 aa  121  8e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.230243 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0466  adenylate kinase  38.73 
 
 
190 aa  119  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0588  adenylate kinase  39.16 
 
 
192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.145693  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1434  adenylate kinase  39.1 
 
 
196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0910302 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1829  adenylate kinase  40.22 
 
 
198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0011881  normal  0.0929136 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1130  adenylate kinase  39.24 
 
 
193 aa  111  7.000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0562  adenylate kinase  37.43 
 
 
192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.155535  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1628  adenylate kinase  37.43 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.378926  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0285  adenylate kinase  37.43 
 
 
192 aa  108  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0155043 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1687  adenylate kinase  39.78 
 
 
198 aa  108  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.515273  normal  0.0373221 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0709  adenylate kinase  38.89 
 
 
198 aa  105  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0354  adenylate kinase  35.2 
 
 
192 aa  103  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0378  adenylate kinase  40.36 
 
 
204 aa  100  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0113916  normal  0.834439 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1162  adenylate kinase-like protein  28.14 
 
 
189 aa  48.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0551247  hitchhiker  0.00191717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>